Emplois actuels liés à Création d’un index distribué pour les données génomiques - Montpellier - INRIA

  • Postdoctorant en génomique des populations

    il y a 9 heures

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    MissionVous rejoindrez l'axe « Écologie et évolution des zoonoses » du Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier, où vous travaillerez sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage.ObjectifsVous développerez des analyses de génomique des populations pour comprendre l'histoire...

  • Postdoctorant en génomique des populations

    il y a 1 semaine

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    Mission et objectifsL'IRD recherche un postdoctorant pour rejoindre l'axe « Écologie et évolution des zoonoses » au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier. Le candidat sélectionné travaillera sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage, en particulier des petits...

  • Analyste en génomique des populations

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    MissionVous rejoindrez l'équipe de recherche de l'IRD au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations à Montpellier.ObjectifsVous développerez des analyses de génomique des populations pour comprendre l'histoire de l'invasion en Afrique d'une des pires espèces exotiques envahissantes du monde, la souris...

  • Spécialiste en génomique des populations

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    MissionVous rejoindrez l'axe « Écologie et évolution des zoonoses » au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier, où vous travaillerez sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage.ObjectifsVous développerez des analyses de génomique des populations pour comprendre l'histoire...

  • Postdoctorant en génomique des populations

    il y a 23 heures

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    MissionVous rejoindrez l'axe « Écologie et évolution des zoonoses » du Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier, où vous travaillerez sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage.ObjectifsVos objectifs seront de :Réaliser l'analyse bioinformatique des nouvelles données de...

  • Postdoctorant en génomique des populations

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    MissionVous rejoindrez l'équipe de recherche de l'IRD au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier.ContexteLe CBGP est un centre de recherche interdisciplinaire qui étudie les menaces qui pèsent sur la sécurité alimentaire, la biodiversité et la santé. Vous serez intégré à l'axe « Écologie et évolution...

  • Chercheur Postdoctoral en Génomique des Populations

    il y a 1 mois

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    Génomique des populations - Études démographiques – Interactions génome/environnement Présentation de l'organisation Vous intégrerez le Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP), basé à Montpellier. Le CBGP regroupe 86 membres permanents issus d'INRAE, de l'IRD, du Cirad et de l'Institut Agro Montpellier. Les recherches...

  • Chercheur Postdoctoral en Génomique des Populations

    il y a 1 mois

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    Étude des Génomiques à Faible Couverture - Histoire Démographique – Interactions Gène-Environnement Présentation de l'Organisation Vous intégrerez le Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP), situé à Montpellier. Le CBGP regroupe 86 professionnels permanents issus d'INRAE, de l'IRD, du Cirad et de l'Institut Agro...

  • Chercheur Postdoctoral en Génomique des Populations

    il y a 1 mois

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    Étude des Génomiques à Faible Couverture - Évolution Démographique – Corrélations Génomiques/Environnementales Présentation de l'Institution Vous intégrerez le Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP), basé à Montpellier. Le CBGP regroupe 86 professionnels permanents d'INRAE, de l'IRD, du Cirad et de l'Institut Agro...

  • Chargé-e de Recherche en Génomique Structurale

    Il y a 3 mois

    Montpellier, France INRAE Temps plein

    34398 MONTPELLIER _ **RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE** **Présentation d'INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la...

  • Rechercheur en Génomique de l'adaptation à l'environnement portuaire

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de posteLe Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) recherche un chercheur pour rejoindre son équipe de recherche en génomique et en biologie de l'évolution. Le poste est axé sur l'étude de l'adaptation des espèces marines à l'environnement portuaire.ContexteLes ports sont des écosystèmes uniques qui présentent des pressions de...

  • Chercheur en informatique et statistique pour l'analyse de réarrangements génomiques

    il y a 3 jours

    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de recherche scientifiqueL'équipe MAB du LIRMM recherche un chercheur postdoctoral pour travailler sur un projet lié à la réorganisation du génome chez les anophèles. Le projet consiste à développer des algorithmes pour l'inférence des réarrangements ancestraux à un clade dans une phylogénie, ainsi que leur mise en...

  • Rechercheur en Génomique de l'adaptation à l'environnement portuaire

    il y a 3 semaines

    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de posteLe Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) recherche un(e) Rechercheur en Génomique de l'adaptation à l'environnement portuaire pour rejoindre son équipe de recherche.ContexteLe projet de recherche vise à étudier l'évolution des espèces marines dans les écosystèmes portuaires sous l'influence des pressions de sélection...

  • Rechercheur en Génomique de l'adaptation à l'environnement portuaire

    il y a 1 semaine

    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de posteLe Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) recherche un(e) Rechercheur en Génomique de l'adaptation à l'environnement portuaire pour rejoindre son équipe de recherche.ContexteLe projet de recherche vise à étudier l'évolution des espèces marines dans les écosystèmes portuaires sous l'influence des pressions de sélection...

  • Génomique des populations

    il y a 4 semaines

    Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein

    Décrivez l'histoire d'une invasion biologique majeure L'IRD recherche un(e) Post-Doctorant(e) en génomique des populations pour contribuer à un projet ambitieux sur l'histoire d'invasion de la souris domestique (Mus musculus domesticus) en Afrique. Vous utiliserez vos compétences en bioinformatique et en génomique des populations pour analyser des...

  • Rechercheur en Génomique de l'adaptation à l'environnement portuaire

    il y a 1 semaine

    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de posteLe Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) recherche un(e) Rechercheur en Génomique de l'adaptation à l'environnement portuaire pour rejoindre son équipe de recherche.ContexteLe projet de recherche vise à étudier l'évolution des espèces marines dans les écosystèmes portuaires sous l'influence des pressions de sélection...

  • Rechercheur en Génomique de l'Adaptation à l'Environnement Portuaire

    il y a 1 semaine

    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de PosteContexteL'évolution des espèces marines dans les écosystèmes portuaires est un phénomène complexe qui nécessite une approche multidisciplinaire. Le CNRS recherche un chercheur expérimenté pour rejoindre son équipe de recherche en génomique de l'adaptation à l'environnement portuaire.ObjectifsL'objectif principal de...

  • Post Doctorat en génomique des populations

    Il y a 4 mois

    Montpellier, France IRD Temps plein

    Génomes complets à faible couverture - Histoire démographique – associations génome/environnement La structure que vous allez rejoindre Vous serez affecté au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (), à Montpellier. Le CBGP est composé de 86 agents permanents d'INRAE, de l'IRD, du Cirad et de l'Institut Agro Montpellier. Les...

  • Rechercheur en Génomique de l'adaptation à l'environnement portuaire

    il y a 7 jours

    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de thèse : Génomique de l'adaptation à l'environnement portuaireContexteL'évolution des espèces marines dans les écosystèmes portuaires est un phénomène complexe qui nécessite une approche multidisciplinaire. Cette thèse vise à étudier les mécanismes sous-jacents de l'adaptation des espèces marines à l'environnement...

  • Doctorat en Génomique des Fourmis Moissonneuses

    il y a 3 semaines

    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Chercheur(euse) en Génomique et Evolution Sociale L'Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (ISEM) recherche un(e) chercheur(euse) talentueux(se) pour une thèse doctorale au sein du projet ERC RoyalMess, dirigé par Jonathan Romiguier. Ce projet se concentre sur l'évolution convergente de l'hybridogénèse sociale chez les fourmis récolteuses...

Création d’un index distribué pour les données génomiques

Il y a 4 mois

Montpellier, France INRIA Temps plein

Contexte et atouts du poste

Ce poste est proposé dans le cadre du projet OmicFinder, dont l'objectif est de créer un moteur de recherche pour indexer et interroger des séquences dans un grand nombre de bases de données génomiques.

Les données génomiques permettent des avancées cruciales en médecine, en écologie, en agronomie et en surveillance des océans. Une limitation majeure est qu’il est impossible d’interroger l’intégralité de ces données. L’objectif du projet OmicFinder est de lever ce verrou et de permettre l'exploitation complète et globale des séquences générées, permettant aux utilisateurs d'effectuer des requêtes dans les données de séquençage brutes à la volée afin d'exploiter au mieux les ressources disponibles dans les sciences de la vie.

Le candidat ou la candidate devra travailler dans l’équipe Zenith de l’Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique (Inria) à Montpellier . Plusieurs équipes d'Inria participent au projet et apportent des compétences en termes d'algorithmique, d'indexation, etc. Il y a aussi des partenaires externes qui participent aux développements algorithmiques et à la validation des résultats.

Mission confiée

La mission confiée à la personne recrutée est le développement d’un index distribué. Pour cela, elle s’appuiera sur un index centralisé existant, sur les approches de distribution développées dans l’équipe Zenith, et sur les nouveaux développements conjoints des équipes impliquées dans le projet OmicFinder pour définir les principes d’un index distribué destiné aux d onnées génomiques.

Principales activités

Les principales activités de la personne recrutée sont les suivantes :

Étudier l’état de l’art sur les index pour les données génomiques.

Concevoir un index distribué pour de grands volumes de données génomiques.

Développer l’index conçu en collaboration avec les partenaires du projet.

Développer un système de requête pour interroger l’index.

Participer à la rédaction des articles scientifiques pour valoriser les résultats de recherche.

Compétences

Connaissance des index et des systèmes distribués.

Avantages

Restauration subventionnée Transports publics remboursés partiellement Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement) Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.) Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria) Accès à la formation professionnelle Participation mutuelle (sous conditions)

Rémunération

A partir de 2692 € brut mensuel (selon diplôme et expérience)