Manager Bioinformaticien

Description du poste :

Vous intégrez le service "Analytics" composé de 11 personnes et êtes rattaché.e directement à la Responsable de l'équipe. Vous aurez le rôle d’expert et de manager en bio-informatique afin de déployer et maintenir l’activité bio-informatique, principalement associée à l’analyse de données de séquençage du transcriptome et du génome humain.

Vous encadrerez au moins 1 expert en bio-informatique qui sera recruté en 2024.

Vos missions seront les suivantes :

• Pour les projets de Recherche, aider les biologistes à mettre au point des plans expérimentaux impliquant des analyses bio-informatiques, principalement en transcriptomique
• Pour les projets avancés, assurer l’analyse bio-informatique de caractérisation des produits destinés à l’investigation clinique
• Conduire les analyses bio-informatiques et les contrôles qualité obtenus sur les données de séquençage (transcriptomique et génomique)
• Concevoir et mettre en œuvre les solutions pour intégrer et exploiter les données de différents types d'analyses (transcriptomes, exomes, génomes entiers...)
• Fournir des outils de visualisation pour aider à l'interprétation des données biologiques
• Apporter son soutien dans l'implémentation de plans d'analyse pour le traitement de données biologiques,
• Produire des rapports de synthèse et les présenter oralement
• tant que Manager, planifier l’activité de bio-informatique et prévoir les ressources associées.
• des solutions innovantes aux équipes grâce à une veille technologique
• Assurer le stockage et le traitement de données à grande échelle, en lien avec l’équipe IT

Profil :

Vous avez validé un Doctorat ou un Master en bio-informatique. Vous justifiez d’une expérience professionnelle de minimum 5 ans dans l’analyse de données transcriptomiques (bulk, single cell, spatial transcriptomics) et génomiques (exomes et génomes entiers, oncopanels).

Vous avez une excellente maîtrise du langage R, des langages et des outils utilisés en bioinformatique : Linux/Unix, bash, Python, gestion de versions (Git, Github/Gitlab), conteneurisation (Docker/Singularity), automatisation de workflow (snakemake, nextflow). Vous maîtrisez les workflows d'interprétation d’analyse de données de séquençage génomique et transcriptomique (variant calling, expression différentielle de gènes, intégration de données multiomiques) ainsi que les infrastructures traditionnelles de HPC et de Cloud Computing

Il n’est pas nécessaire d’avoir une expérience en management.

Votre capacité d’adaptation, votre curiosité et votre bienveillance vous permettront de travailler en collaboration avec de nombreux chercheurs en biologie.

Enfin, la connaissance de l’anglais écrit et oral est indispensable pour être en réussite sur ce poste.

🌟 Nous cherchons une personne enthousiasmée par la perspective de déployer les thérapies cellulaires. Capacité d’exécution, bon sens, rigueur, polyvalence, adaptation, esprit d'aventure et d’équipe sont importants pour nous. Vous êtes autonome, organisé(e) et capable de vivre en environnement dynamique dans un projet de longue haleine ? Rejoignez-nous 🌱