Doctorant (H/F)

il y a 1 semaine

Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein
Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : mardi 19 septembre 2023

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Doctorant (H/F) en biologie moléculaire des ARN. Modification épigénétique de la coiffe des ARNm et étude de leur mécanisme de traduction.**
Référence : UPR9002-CHRALL-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : mardi 29 août 2023
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 novembre 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2 135,00 € brut mensuel
Section(s) CN : Biologie moléculaire et structurale, biochimie

**Description du sujet de thèse**:
Les modifications épigénétiques d'ARN sont un moyen de réguler l'expression des gènes. La traduction canonique coiffe-dépendante des ARNm repose sur la reconnaissance d'une coiffe 7-méthylguanosine (m7G) en 5' des ARNm par le facteur d'initiation eIF4E. Cette étape est un prérequis à la fixation des ribosomes. Des mécanismes alternatifs d'initiation de la traduction ne reposant pas sur l'interaction eIF4E/ m7G ont cependant été mis à jour ces dernières années, notamment dans des conditions de stress cellulaire.
Nous avons identifié le premier exemple de modification épigénétique de la coiffe chez les mammifères et montré que les ARNm de sélénoprotéines liés au stress ont une coiffe triméthylée m32,2,7G (TMG). Ces ARNm ne sont pas reconnus par eIF4E, mais sont néanmoins traduits par un mécanisme qui reste à élucider. Nous avons identifié l'ensemble du répertoire des ARNm à coiffe TMG au niveau transcriptomique dans des cellules HEK293FT par immunoprécipitation de la coiffe (IP TMG) et RNA-seq (TMG RIP-seq). Ces ARNm à coiffe TMG sont principalement impliqués dans la traduction, la réponse au stress, la protection antioxydante et la prévention des cancers.

Les objectifs de cette thèse seront de déterminer le rôle de la coiffe TMG dans la traduction et la localisation des ARNm, d'identifier les facteurs de traduction associés et de caractériser le répertoire des ARNm à coiffe TMG dans des conditions de stress. Des approches de biologie moléculaire et cellulaire dédiées à l'étude des ARN et de la traduction seront utilisées. Le rôle de la coiffe TMG dans la traduction d'ARNm endogènes sera étudié par analyse de polysomes et IP TMG en conditions normales ou d'inhibition de la traduction. Des ARNm modèles transcrits in vitro à coiffe TMG ou m7G permettront de décrypter leurs mécanismes de traduction dans des extraits acellulaires ou in vivo (réticulocytes de lapin ou cellules HEK293FT). La coiffe TMG identifiée chez les ARN non codants (snARN, snoARN) joue un rôle dans leur localisation fonctionnelle. Son impact sur la localisation cellulaire des ARNm sera analysé par immunolocalisation.
Une méthode de purification des particules de ribosome/ARNm dédiée à l'analyse protéomique sera utilisée pour capturer les facteurs d'initiation natifs impliqués dans la traduction des ARNm à coiffe TMG. Ceci permettra de déterminer la composition des complexes d'initiation utilisés par ces différents types d'ARNm, les facteurs de liaison à la coiffe et les facteurs auxiliaires. Enfin, le répertoire d'ARNm endogènes à coiffe TMG sera déterminé par TMG RIP-seq dans différents types cellulaires et en conditions de stress (stress oxydant, conditions hypoxiques, privation d'acides aminés) afin de déterminer si l'hypermodification de la coiffe est régulée.
Cette étude permettra de proposer des modèles pour la traduction de divers ARNm à coiffe triméthylée et de mieux appréhender comment ils échappent au processus classique d'initiation de la traduction. Comprendre le rôle du stress cellulaire dans la régulation traductionnelle est particulièrement pertinent dans le cas de pathologies telles que le cancer.

Au cours de cette thèse, le/la doctorant(e) pourra acquérir une solide expertise dans l'étude des ARN, des complexes ARN/protéine in vitro et in vivo, en immunoprécipitation d'ARN ainsi qu'en assemblage et traduction de complexes ARNm/ribosomes in vitro. Des connaissances en biologie des acides nucléiques ainsi qu'en bio-informatique seraient un atout.

**Contexte de travail**:
Le projet sera réalisé dans l'unité « Architecture et réactivité de l'ARN », UPR 9002 du CNRS à l'Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire de Strasbourg. Les thèmes de recherche de l'unité portent sur la biologie des ARN et ses nombreuses fonctions biologiques (régulation de l'expression génique, traduction ou infection virale). La thèse se déroulera au sein de l'équipe « Evolution des systèmes d'initiation de la traduction chez les eucaryotes» et fera l'objet d'un financement ANR intitulé ReCAPtrans. La thèse sera rattachée à l'Ecole Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé

  • Doctorant en Physique Des Particules

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : mardi 28 mai 2024**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant en physique des particules - Expérience Belle II (H/F)**Référence : UMR7178-REGSOM-189Nombre de Postes : 1Lieu de travail : STRASBOURGDate de publication : mardi 7 mai...

  • Doctorant en Nanosciences

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : mardi 23 mai 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant en nanosciences (H/F)**Référence : UMR6174-FRECHE1-001Nombre de Postes : 1Lieu de travail : MONTBELIARDDate de publication : mardi 2 mai 2023Type de contrat : CDD...

  • Doctorant en Chimie

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : mercredi 21 juin 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant en chimie - spécialité synthèse/chimie de coordination (H/F)**Référence : UMR7178-REGSOM-155Nombre de Postes : 1Lieu de travail : STRASBOURGDate de publication :...

  • Doctorant en chimie analytique et spectrométrie de masse pour le vivant

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Doctorant en chimie analytique et spectrométrie de masse pour le vivant (H/F) Cette offre est disponible dans les langues suivantes : Date Limite Candidature : lundi 13 mai 2024 Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant en chimie analytique et...

  • Doctorant (H/F)

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : mercredi 6 septembre 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant (H/F) pour l'identification et la caractérisation de complexes ribonucléoprotéiques impliqués dans la réplication des virus de la Dengue et du Zika**Référence :...

  • Doctorant (H/F) en Nanomagnétisme

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:Date Limite Candidature : mardi 22 août 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant (H/F) en nanomagnétisme**Référence : UMR7504-MATBAI-002Nombre de Postes : 1Lieu de travail : STRASBOURGDate de publication : mardi 1 août 2023Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat...

  • Doctorant en physique nucléaire, instrumentation et radioprotection

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Doctorant en physique nucléaire, instrumentation et radioprotection (H/F) Cette offre est disponible dans les langues suivantes : Date Limite Candidature : lundi 3 juin 2024 Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant en physique nucléaire,...

  • Doctorant en Chimie Des Procédés Et Des

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : vendredi 5 mai 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant en chimie des procédés et des polymères (H/F)**Référence : UPR22-MADVAU-005Nombre de Postes : 1Lieu de travail : STRASBOURGDate de publication : vendredi 14 avril 2023Type...

  • Doctorant H/F

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Doctorant H/F : Calibration d'un modèle hydrogéologique Cette offre est disponible dans les langues suivantes : Date Limite Candidature : vendredi 31 mai 2024 Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant H/F : Calibration d'un modèle hydrogéologique ...

  • Doctorant - Transport Et Transformation Des

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:Date Limite Candidature : vendredi 4 août 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant - Transport et transformation des pesticides des sols vers les nappes aquifères - approches isotopiques (H/F)**Référence : UMR7063-GWEIMF-007Nombre de Postes : 1Lieu de travail :...

  • Doctorant (H/F) : Calibration D'un Modèle

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : vendredi 31 mai 2024**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant H/F : Calibration d'un modèle hydrogéologique**Référence : UMR7063-NOLLES-001Nombre de Postes : 1Lieu de travail : STRASBOURGDate de publication : vendredi 10 mai 2024Type...

  • Doctorant (H/F) en Neuroscience Intégration

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:Date Limite Candidature : mardi 22 août 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant H/F en neuroscience intégration sensorimotrice**Référence : UPR3212-MATCOR-002Nombre de Postes : 1Lieu de travail : STRASBOURGDate de publication : mardi 1 août 2023Type de contrat : CDD...

  • Doctorant (H/F) en Neuroscience Intégration

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : mardi 22 août 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant H/F en neuroscience intégration sensorimotrice**Référence : UPR3212-MATCOR-002Nombre de Postes : 1Lieu de travail : STRASBOURGDate de publication : mardi 1 août 2023Type de...

  • Doctorant(E) , Spécialité Génie Electrique (H/F)

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : vendredi 21 avril 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant(e), spécialité Génie Electrique H/F**Référence : UMR7563-SERPIE-001Nombre de Postes : 1Lieu de travail : VANDOEUVRE LES NANCYDate de publication : vendredi 31 mars...

  • Post-doctorant en Physique Du Neutrino

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : mercredi 3 mai 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Post-doctorant en physique du neutrino expérimentale dans l'expérience JUNO (H/F)**Référence : UMR7178-REGSOM-151Nombre de Postes : 1Lieu de travail : STRASBOURGDate de publication :...

  • Doctorant(E) en Chimie-physique ou Sciences Des

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : lundi 15 avril 2024**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:doctorant(e) en chimie-physique ou sciences des matériaux: Métasurfaces plasmoniques chirales pour la photocatalyse asymétrique (H/F)**Référence : UPR22-MATPAU-001Nombre de Postes :...

  • Contrat Post-doctorant

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : vendredi 15 mars 2024**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Contrat post-doctorant (H/F) - Contrôle des excitons à l'échelle nanométrique dans des hétérostructures de van der Waals à écart angulaire contrôlé - TEXTURES**Référence :...

  • Doctorant (H/F)

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : jeudi 6 avril 2023**Informations générales**:Référence : UPR3572-CECMEN-005Nombre de Postes : 1Lieu de travail : STRASBOURGDate de publication : mercredi 15 mars 2023Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoralDurée du contrat : 36 moisDate de début...

  • Doctorant (F/H) Synthèse de La Parole Pour

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD**Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent**Fonction **:Doctorant**Contexte et atouts du poste**:Cette thèse se place dans le cadre du Défi Inria COLaF "Corpus et Outils pour les Langues de France", dont l'objectif est de créer des corpus, des modèles et des logiciels ouverts et inclusifs pour les langues de France....

  • Doctorant (F/H) Thèse de Doctorat / Algorithmes de

    il y a 1 semaine

    Strasbourg, Grand Est, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD**Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent**Autre diplôme apprécié **:Master**Fonction **:Doctorant**Contexte et atouts du poste**:**Equipe****Contacts****Mission confiée**:Ces dernières années, le succès d'AlphaZero dans la maîtrise de jeux complexes tels que les échecs et le Go a démontré la puissance de...