Doctorat en écologie marine H/F

il y a 2 semaines


Plouzané, Bretagne, France CNRS Temps plein

Informations générales

Intitulé de l'offre : Doctorat en écologie marine H/F
Référence : UMR6539-ANNPOD-064
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : PLOUZANE
Date de publication : lundi 10 juin 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 octobre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : La rémunération sera de 2135,00 € brut mensuel
Section(s) CN : Système Terre : enveloppes superficielles

Description du sujet de thèse

Contexte scientifique : Les mangroves sont des écosystèmes intertidaux (sub)tropicaux très productifs qui fournissent de multiples services écologiques naturels et sont fortement influencés par les crabes brachyoures fouisseurs. L'impact de ces crabes dépend de la dynamique de leur population, qui est façonnée par les processus de recrutement et les schémas de connectivité entre les populations. Les mangroves de la côte atlantique sud-américaine sont réparties dans des écorégions contrastées. Le littoral de la Guyane française présente une dynamique originale et unique, avec des bancs de vase très mobiles provenant du fleuve Amazone, qui forment une vaste zone de mangroves dominées par Avicennia. À la latitude sud, l'écorégion de Sao Paulo est caractérisée par des mangroves dominées par Rhizophora, moins étendues que celles de FG mais plus stables dans le temps. Ces différentes écorégions abritent des espèces de crabes brachyoures similaires. Cependant, il reste à déterminer si les populations de crabes de mangrove de FG et du Brésil constituent une seule unité panmictique ou si elles sont génétiquement séparées en unités discrètes et démographiquement indépendantes.
Objectifs : Le projet décryptera les processus qui façonnent la structure de la population et les modèles de recrutement des trois principaux crabes brachyoures (U. maracoani, L. cumulanta et U. cordatus) le long des côtes atlantiques de l'Amérique du Sud. À cette fin, trois objectifs seront abordés :
Obj.1 : Démêler les processus phylogéographiques passés et les schémas de connectivité contemporains qui ont façonné la structure génétique de la population actuelle.
Obj.2 : Caractériser comment les conditions environnementales contrastées peuvent façonner la dynamique des populations de crabes.
Obj.3 : Décrire les processus qui régissent la variabilité spatio-temporelle des schémas de recrutement.

Contexte de travail

Cette sera co-dirigée par E. Michaud (CNRS-LEMAR ; écologie des communautés benthiques dans les mangroves), G. Charrier (UBO-LEMAR ; génétique et génomique des populations marines), et par le Pr. M. Tavares (MZUSP, Brésil ; Systématique et de la phylogénie des crabes en Amérique du Sud). Le Lemar a récemment développé des outils moléculaires sur les crabes Brachyoures des mangroves en relation avec les chantiers « mangroves », qui ont pris de l'importance au laboratoire LEMAR au cours des dix dernières années. Le MZUSP utilise des techniques avancées de microscopie (microscopie électronique à balayage), de micro-tomographie et de biologie moléculaire pour obtenir des informations morphologiques et moléculaires permettant de comprendre la taxonomie, la systématique et la phylogénie. Les collaborations entreprises avec le laboratoire LEEISA depuis une 10aine d'années (ANR BIOMANGO, CNRS GDR LIGA) permettront d'aider les travaux de terrain en Guyane dans les mangroves. Cette thèse pourra s'intégrer dans des réseaux internationaux sur les études de génétique des populations/écologie évolutive et d'écologie des mangroves. Cette thèse s'inscrit aussi dans les prérogatives actuelles du CNRS sur les mangroves (Réseau National " Mangroves " ; PEPR Living Lab Magellan Guyane ; Centre de recherche international (IRC) entre CNRS et l'Université de Sao Paulo, IRC USP-CNRS).

Contraintes et risques

Il est prévu la mise en place d'une co-tutelle de thèse avec l'Université de Sao Paulo, ce qui impliquera de passer une partie de la thèse au Brésil. Plusieurs campagnes de terrain en mangroves seront nécessaires pour acquérir les données.



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