Déchiffrer Le Microbiome Des Organismes Aquatiques

il y a 2 semaines

Montpellier, Occitanie, France UMR MARBEC (Montpellier) UMR MCAM (MNHN-Paris) Temps plein
**Déchiffrer le microbiome des organismes aquatiques de la mangrove**:

- Réf **ABG-124508**
- Sujet de Thèse- 07/06/2024- Financement public/privé- UMR MARBEC (Montpellier) / UMR MCAM (MNHN-Paris)- Lieu de travail- Montpellier - Occitanie - France- Intitulé du sujet- Déchiffrer le microbiome des organismes aquatiques de la mangrove- Champs scientifiques- Biologie
- Ecologie, environnement
- Mots clés- mangrove, diversité et écologie microbienne, omiques bactériennes et virales**Description du sujet**:
Les mangroves sont des environnements fascinants et des sites d'étude d'une grande
importance en raison de leur immense valeur patrimoniale et du grand nombre de services
écosystémiques qu'elles fournissent. Ces zones d'interface situées entre terre et mer abritent une
grande variété d'organismes aquatiques (crustacés, poissons, mollusques, polychètes, annélides,
éponges, échinodermes, amphibiens, etc.) qui représentent la partie émergée de l'iceberg de la
biodiversité présente dans ces écosystèmes. Une autre composante, invisible, est constituée par les
microorganismes (notamment les bactéries et les virus) très abondants dans l'eau et le sédiment des
mangroves, mais aussi étroitement liés aux plantes et aux animaux locaux. Bien qu'essentielle au
fonctionnement de l'écosystème et à l'adaptation des organismes pluri-cellulaires, cette fraction reste
à ce jour très peu connue. Dans une approche résolument exploratoire, nous souhaitons donc réaliser
un inventaire aussi exhaustif que possible de la diversité microbienne (taxonomique et fonctionnelle)
présente dans les mangroves, sous ses diverses formes (planctonique, benthique et épibiotique). Dans
cette perspective, 3 sites emblématiques seront échantillonnés : en Guyane Française (Estuaire du
Sinnamary), au Sénégal (Delta du Siné-Saloum) et au Vietnam (Parc du Xuan Thuy), dans le but
d'identifier les principaux taxons microbiens (pathogènes ou non), ainsi que les principaux
déterminants biophysicochimiques de cette micro-diversité, et d'identifier une possible signature
biogéographique de ces microbiomes. Le projet de thèse vise notamment à explorer la diversité des
communautés bactériennes et virales présentes dans l'eau, les sédiments, mais aussi celles inféodées
aux principales espèces végétales (notamment les palétuviers) et animales (citées plus haut) qui
peuplent les mangroves.
L'étudiant(e) sera basé(e) à l'Université de Montpellier sous la supervision de Yvan Bettarel (UMR
MARBEC Marine Biodiversity, Exploitation and Conservation) et de Sébastien Halary (co-superviseur,
MNHN, Muséum National d'Histoire Naturelle, Paris). Plusieurs missions d'échantillonnage sont
prévues en Guyane, Sénégal et Vietnam au cours des deux premières années de thèse, avec plusieurs
courts séjours scientifiques au Muséum de Paris. Les travaux s'inscrivent dans le cadre du projet ADELE
(Microbiomes in mangroves: a hot spot of biodiversity yet to be explored), financé pour la période 2024
- 2028.

**Nature du financement**:

- Financement public/privé**Précisions sur le financement**:
**Présentation établissement et labo d'accueil**:

- UMR MARBEC (Montpellier) / UMR MCAM (MNHN-Paris)L'UMR MARBEC a quatre tutelles principales (IRD, Ifremer, Université de Montpellier, CNRS) et une tutelle secondaire (INRAE). Cinq agents du CUFR de Mayotte ont leur affectation recherche dans MARBEC via l'Université de Montpellier.

Son activité de recherche se déploie autour de six ambitions définies en fonction des enjeux de Société liés à la biodiversité marine et ses usages:

- Dresser l'état des lieux de la biodiversité marine
- Comprendre et modéliser le fonctionnement et l'évolution des organismes et des écosystèmes marins
- Evaluer les causes de la perte de la biodiversité marine
- Proposer des outils de conservation de la biodiversité marine et anticiper les risques émergents
- Promouvoir une pêche et une aquaculture marines durables
- Développer un océan numérique pour protéger la biodiversité marine

**Site web**:
Master spécialité (liste non exhaustive) : Microbiologie marine, Ecologie microbienne, Génomique
Environnementale, Océanologie, Bioinformatique, etc.
Le traitement post-séquençage des données issues des échantillons microbiologiques nécessite des
connaissances théoriques et pratiques approfondies en écologie microbienne et en bio-informatique
appliquée à l'étude de la biodiversité microbienne (barcoding, (méta)génomique ). A ce titre, une
expérience dans le traitement des données issues de NGS (Illumina) d'amplicons et/ou shotgun serait
appréciée, ainsi qu'une bonne autonomie en informatique (OS Linux, R ). La maîtrise de l'anglais, des
outils biomoléculaires et statistiques est également souhaitée.
Enfin, l'alternance des séjours scientifiques entre Montpellier et Paris, ainsi que les nombreuses
missio

  • Surveillant de Baignade

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Camping le CASTELLAS Temps plein

    _Le Castellas, Camping 4 étoiles dans un parc de 24 hectares, au cœur d'une magnifique pinède, avec un grand espace aquatique et un accès direct à la plage, disposant de 990 emplacements._Vous accompagnerez le Responsable Piscine dans la surveillance des bassins et des jeux aquatiques. Votre rôle est de permettre à tous les clients de profiter...

  • Agent de Maintenance Piscine

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Camping le Floride & l'Embouchure Temps plein

    **A propos de nous**:Situé au bord de la Mer Méditerranée dans un écrin de verdure notre Camping, Village et Spa 5 étoile, le Floride & l'Embouchure accueille depuis 60 ans plusieurs générations de campeurs en quête de bonheur et de souvenirs.Notre Paradis aquatique géant de 4000 m2 où toboggans géants, jacuzzis, solariums, et piscine couverte...

  • Conseiller/conseillère Touristique

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Camping le Floride & l'Embouchure Temps plein

    **A propos de nous**:Situé au bord de la Mer Méditerranée dans un écrin de verdure notre Camping, Village et Spa 5 étoile, le Floride & l'Embouchure accueille depuis 60 ans plusieurs générations de campeurs en quête de bonheur et de souvenirs.Notre Paradis aquatique géant de 4000 m2 où toboggans géants, jacuzzis, solariums, et piscine couverte...

  • Coiffeur / Barbier (H/F) Temps Plein ou Partiel

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Camping le Floride & l'Embouchure Temps plein

    **A propos de nous**:Situé au bord de la Mer Méditerranée dans un écrin de verdure notre Camping, Village et Spa 5 étoile, le Floride & l'Embouchure accueille depuis 60 ans plusieurs générations de campeurs en quête de bonheur et de souvenirs.Notre Paradis aquatique géant de 4000 m2 où toboggans géants, jacuzzis, solariums, et piscine couverte...

  • Employé / Employée D'entretien Sanitaires (F/H)

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Camping le Floride & l'Embouchure Temps plein

    **A propos de nous**:Situé au bord de la Mer Méditerranée dans un écrin de verdure notre Camping, Village et Spa 5 étoile, le Floride & l'Embouchure accueille depuis 60 ans plusieurs générations de campeurs en quête de bonheur et de souvenirs.Notre Paradis aquatique géant de 4000 m2 où toboggans géants, jacuzzis, solariums, et piscine couverte...

  • Stagiaire Community Manager

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Camping le CASTELLAS Temps plein

    Le Camping du Castellas** est situé dans un parc de 24 hectares, au cœur d'une magnifique pinède, avec un grand espace aquatique et un accès direct à la plage, disposant de 990 emplacements.**Nous recrutons un stagiaire H/F Community Manager**Le profil demandé est:- Excellente maîtrise des réseaux sociaux et une bonne culture web.- Bonne maitrise du...

  • Agent de Sécurité Et D'accueil Jour

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Camping le Floride & l'Embouchure Temps plein

    **A propos de nous**:Situé au bord de la Mer Méditerranée dans un écrin de verdure notre Camping, Village et Spa 5 étoile, le Floride & l'Embouchure accueille depuis 60 ans plusieurs générations de campeurs en quête de bonheur et de souvenirs.Notre Paradis aquatique géant de 4000 m2 où toboggans géants, jacuzzis, solariums, et piscine couverte...

  • Agent de Sécurité Et D'accueil Jour

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Camping le Floride & l'Embouchure Temps plein

    **A propos de nous**:Situé au bord de la Mer Méditerranée dans un écrin de verdure notre Camping, Village et Spa 5 étoile, le Floride & l'Embouchure accueille depuis 60 ans plusieurs générations de campeurs en quête de bonheur et de souvenirs.Notre Paradis aquatique géant de 4000 m2 où toboggans géants, jacuzzis, solariums, et piscine couverte...

  • Agent de Service Des Espaces Commun

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Yelloh Village Le Serignan Plage Temps plein

    **Camping Le Sérignan Plage**Le Yelloh Village Le Sérignan Plage est un établissement 5** en bord de Mer Méditerranée, recevant une clientèle internationale pour des prestations hôtellerie de plein air haut de gamme. Au milieu des dunes, dans un environnement naturel préservé et sous le généreux soleil d'Occitanie tous les éléments sont réunis...

  • Surveillant de Baignade

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Camping L'Ile des Papes Temps plein

    Recherche un Surveillant(e) de baignade ou maître nageur(euse)Poste logé gratuitement, colocation en mobil home récent climatisé avec réseau internetSalaire en fonction du diplôme ( SB:2080€/mois-BP JEPS AAN: 2445€/mois)Rejoindre Sandaya, c'est avant tout participer à une aventure humaine. Notre mission ? **Rendre les vacances plus belles en...

  • Assistante RH

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France La Compagnie des Desserts Temps plein

    LA COMPAGNIE DES DESSERTS est fière de pouvoir proposer à tous les consommateurs gourmands des produits élaborés dans ses ateliers et promet à ses clients de donner du plaisir aux desserts.Apporteur de solutions pour les professionnels de la restauration RHF qui souhaitent éveiller les papilles de leurs clients, nous fabriquons et distribuons une gamme...

  • Assitant(E) RH

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France La Compagnie des Desserts Temps plein

    LA COMPAGNIE DES DESSERTS est fière de pouvoir proposer à tous les consommateurs gourmands des produits élaborés dans ses ateliers et promet à ses clients de donner du plaisir aux desserts.Apporteur de solutions pour les professionnels de la restauration RHF qui souhaitent éveiller les papilles de leurs clients, nous fabriquons et distribuons une gamme...

  • Ide (H/F) 50% - Ehpad Cité Des Ainés Montpellier

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France EHPAD Cité des Ainés Montpellier Temps plein

    Aésio Santé Méditerranée recherche un(e) **IDE à temps partiel 50% **pour son EHPAD Cité des Ainés à Montpellier.**Présentation du groupe**:AESIO Santé Méditerranée gère 37 établissements et services, de soins et d'accompagnement, ce qui en fait un acteur de santé incontournable sur les régions Occitanie et Provence Alpes Côte d'Azur avec :...

  • Aide Soignant

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France EHPAD L'ECRIN DES SAGES Temps plein

    Aésio Santé Méditerranée est à la recherche d'un(e) Aide soignant(e) à temps partiel 50% pour son EHPAD L'écrin des sages à Mèze.**Présentation du Groupe**:AESIO Santé Méditerranée gère 37 établissements et services, de soins et d'accompagnement, ce qui en fait un acteur de santé incontournable sur les régions Occitanie et Provence Alpes...

  • Demi Chef de Partie

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France le relais des oliviers Temps plein

    Nous recherchons un(e) Demi-chef de Partie (H/F) pour rejoindre notre équipe de restauration. En tant que Demi-chef de Partie, vous serez responsable d'assister le Chef de Partie dans la préparation des plats et de maintenir les normes de qualité et d'hygiène.Aperçu du poste:- Poste : Demi-chef de Partie (H/F)- Secteur : Restauration- Manipulation des...

  • Employé(E) Polyvalent(E) Boulangerie

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Le Moulin des Alpilles Temps plein

    _Employé(e) polyvalent(e) boulangerie H/F _Dans le cadre du développement de notre Boulangerie Pâtisserie, nous recherchons un/une employé(e) polyvalent(e).Nous recherchons une personne dynamique et motivée pour intégrer rapidement notre équipeVos tâches seront entre autres la préparation de produits destinés à la boulangerie (salés, pizzas,...

  • Employé(E) de Caisse Polyvalent(E)

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France LE MAS DES AGRICULTEURS Temps plein

    Le Mas des Agriculteurs, Magasin mettant en avant la production locale et les circuits courts et implanté depuis 4 ans à Nîmes, recrute un ou une employé(e) de caisse qui pourra aussi intervenir dans l'un des espaces du magasin.Vous faîtes preuve de bonne humeur, de dynamisme et êtes particulièrement à l'aise avec les clients ?Nous vous proposons de...

  • Responsable Adjoint de Magasin

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France LE TEMPS DES CERISES Temps plein

    **Développez vos talents **Le Temps des Cerises est né en 1998 au cœur du berceau du denim, de la passion de ses fondateurs, Lylian Richardière et son père, pour la toile bleue. C'est dans le bassin Méditerranéen que la marque a su perpétrer un savoir-faire unique dans la fabrication de ses jeans et développer ainsi ses propres recettes pour la mise...

  • Chargé.e de Communication

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Le Journal des Plages Temps plein

    **1. LES MISSIONS DU POSTE**Nous sommes à la recherche d'une personne qui rejoindra l'équipe communication et travaillera directement avec Marion, notre Responsable Comm. et marketing digital.Ta mission, si tu l'acceptes, sera de nous aider à faire exploser le volet digital du Journal des Plages.**COMMUNITY MANAGEMENT : gestion, développement et...

  • Cuisinier / Pizzaiolo / Crêpier

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Le logis des pénitents Temps plein

    Bonjour,Venez rejoindre notre team 2023 Pour compléter notre équipe, le restaurant « Le logis des pénitents », situé dans le petit village historique de Saint-Guilhem-le-désert, est à la recherche d'un(e) crêpier(e) polyvalent ou cuisinier(e) à l'année.- Poste à pourvoir dès maintenant- CDD saisonnier (et plus si souhaité)- Pour faire quoi ? En...