Décrypter Les Variations Phénotypiques Des Trois

il y a 1 semaine


JouyenJosas, Île-de-France INRAE Temps plein
78350 Jouy-en-Josas _

**RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS**

**Présentation INRAE**:
L'Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l'animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

**Environnement de travail, missions et activités**:
L'équipe G2B conduit des travaux sur l'analyse de la variabilité génétique et sur son exploitation en sélection génomique. Les recherches menées visent à contribuer à la durabilité de la production bovine dans ses dimensions économique, sociale et environnementale. Les travaux reposent largement sur le séquençage à haut débit et sur une base de plusieurs milliers de séquences en lectures courtes et longues.

Les recherches de l'équipe GenROC sont consacrées à l'identification des gènes et polymorphismes sous-jacents aux caractères quantitatifs chez les ovins et les caprins et à la compréhension des mécanismes moléculaires conduisant aux phénotypes observés

Vous serez plus particulièrement en charge de:

- Générer des graphes de pangénome des trois espèces bovine, ovine et caprine à partir de différentes sources de données de séquences génomiques déjà disponibles et à avenir (lectures courtes, lectures longues, assemblages spécifiques de plusieurs races dans chacune des 3 espèces)
- Explorer les caractéristiques de ces pangénomes et étudier les variations de structure dans les 3 espèces
- Comparer les résultats entre les 3 espèces pour identifier éventuellement des gènes/familles de gènes communs impactés par les variants structuraux (SV).
- Evaluer l'impact de ces variations de structure sur des phénotypes d'intérêt (données liées à la production laitière, traces de sélection, caractéristiques morphologiques,).

L'enjeu de ce projet est d'améliorer la compréhension de la structure, du fonctionnement et de l'évolution des génomes des ruminants domestiques, grâce à l'exploitation de pangénomes, dont la construction est rendue possible par les lectures longues des séquences haut-débit. L'étude de la diversité génétique intra et inter-espèces a un intérêt pour les filières. En effet, elle permet de cibler des régions génomiques impliquées dans les performances recherchées par les éleveurs ou encore mettre en lumière des spécificités de race.

Le projet de thèse proposé permet d'établir une nouvelle structuration des données génomiques sous la forme d'un graphe de pangénome. Il permet la compression sans perte de l'information de plusieurs centaines de génomes tout en préservant l'organisation chromosomique des gènes bovins, ovins et caprins. Ce nouveau type de ressources a prouvé son utilité chez la tomate pour améliorer la puissance de détection des variants génétiques à l'origine des variations phénotypiques d'intérêt agronomique.

Les travaux réalisés dans ce projet apporteront une contribution significative à la recherche sur les espèces de ruminants, en particulier sur l'évolution de leur génome et la cartographie des loci associés à des caractères.

Les outils bio-informatiques dédiés à la construction du graphe et à la recherche de SV sont accessibles à partir de la plateforme genotoul-bioinfo. Les pipelines développés durant la thèse seront immédiatement mis à disposition sur la plateforme genotoul-bioinfo et seront utilisables pour l'analyse de génomes d'autres espèces, étendant considérablement l'impact des résultats du projet.

**Prévoir quelques déplacements et courts séjours entre les 2 centres INRAE de Jouy-en-Josas et de Toulouse.**

**Formations et compétences recherchées**:
**Master/Ingénieur (Bac+5)**

Formation recommandée : Master ou équivalent (Bac +5) en bio-informatique

Connaissances souhaitées : génétique et génomique chez les eucaryotes

Expérience appréciée : analyses bio-informatiques des séquences génomiques haut débit

Aptitudes recherchées : Avoir un intérêt particulier pour la génétique et la génomique animale, avoir une expérience en programmation (en langage python et R) et des connaissances pratiques avec des clusters de calcul, aptitude à la rédaction d'articles scientifiques et la communication orale. Bonne maitrise de l'anglais requise.

**Votre qualité de vie à INRAE**:
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée):

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un so
  • Secrétaire médical

    il y a 4 semaines


    Les Loges-en-Josas, Île-de-France Centre Pédiatrique des Côtes Temps plein

    L'établissement Le Centre Pédiatrique des Côtes est un établissement de Soins Médicaux et de Réadaptation de Cardiologie et de Pédiatrie Générale de 66 lits composé de 57 lits SMR, 8 lits d'hôpital de jour et d'1 lit de Médecine.Etablissement associatif à but non lucratif - FEHAP (Convention Collective de 1951) Le poste RECHERCHE SECRETAIRE...

  • Secrétaire médical

    il y a 1 mois


    Les Loges-en-Josas, Île-de-France Centre Pédiatrique des Côtes Temps plein

    L'établissement Le Centre Pédiatrique des Côtes est un établissement de Soins Médicaux et de Réadaptation de Cardiologie et de Pédiatrie Générale de 66 lits composé de 57 lits SMR, 8 lits d'hôpital de jour et d'1 lit de Médecine.Etablissement associatif à but non lucratif - FEHAP (Convention Collective de 1951) Le poste RECHERCHE SECRETAIRE...


  • Saint-Germain-en-Laye, Île-de-France Département des Yvelines Temps plein

    La Direction de la Culture, Tourisme et Sport (DCTS), a pour mission de développer l'attractivité touristique du Département des Yvelines en créant une offre culturelle et sportive accessible à tous les types de publics et sur l'ensemble de son territoire.Le Musée Maurice Denis a été fondé par le Département en 1980, dans l'ancienne demeure du...

  • Responsable normes ifrs

    il y a 4 semaines


    Tremblay-en-France, Île-de-France HUB ONE Temps plein

    Quelles sont les missions ?Vos principales missions:Directement rattaché(e) au Directeur Comptable groupe, vos missions porteront notamment : · Accompagner la migration des comptes du Groupe Hub One aux normes IFRS ; · Documenter les retraitements comptables en normes IFRS, les changements de méthodes comptables à effectuer dans les comptes statutaires...

  • Responsable normes ifrs

    Il y a 2 mois


    Tremblay-en-France, Île-de-France HUB ONE Temps plein

    Quelles sont les missions ?Vos principales missions:Directement rattaché(e) au Directeur Comptable groupe, vos missions porteront notamment : · Accompagner la migration des comptes du Groupe Hub One aux normes IFRS ; · Documenter les retraitements comptables en normes IFRS, les changements de méthodes comptables à effectuer dans les comptes statutaires...

  • infirmier psychiatrique cdd

    il y a 1 semaine


    Neufmoutiers-en-Brie, Île-de-France Fondation Santé des Etudiants de France Temps plein

    A propos du poste Rejoindre la Clinique FSEF Neufmoutiers en brie c'est bénéficier de nombreux avantages : -Meilleure conciliation vie privée / vie professionnelle : -Un week end sur trois travaillé, en contrat à durée déterminée dès que possible jusqu'au 30/11/2024 et en fonction du renouvellement de l'absence (divers congés parentaux)-Horaires...

  • Junior (F/H)

    il y a 1 semaine


    Roissy-en-Brie, Île-de-France Les Amis des Producteurs Éthiques Longchamp Temps plein

    Descriptif du poste**Achats et relation producteurs**:- Entretenir la relation au quotidien avec les producteurs avec qui nous tissons un partenariat long terme- Gérer les achats quotidiens auprès des producteurs- Fixer le prix d'achat et le prix de vente des produits, en collaboration avec les producteurs, pour une juste rémunération de ces derniers, en...


  • Saint-Germain-en-Laye, Île-de-France Hôpital de Poissy-Saint-Germain-en-Laye Temps plein

    Détails de l'offre Poste proposé ORTHOPHONISTE - PSYCHIATRIE (F/H) Contrat CDD; CDI; Mutation Descriptif Intitulé du poste Lorthophoniste exerce à temps plein, partagé entre le CMPI de Conflans sainte Honorine et le CMPI de Chanteloup les Vignes. 2. Positionnement du poste Appartenant au 2ème inter Secteur de Psychiatrie Infanto Juvénile des...

  • Dieteticienne

    il y a 1 semaine


    Meulan-en-Yvelines, Île-de-France Centre hospitalier intercommunal de Meulan - Les Mureaux Temps plein

    **Descriptif**Vous êtes dynamique, organisé(e), volontaire.Vous avez le sens du travail en équipe, la volonté de mener à bien des objectifs ambitieux, et souhaitez participer à un projet institutionnel.Rejoignez-nous.Situé à 45 km Ouest de Paris. Le Centre Hospitalier de Meulan-Les Mureaux recherche une diététicienne (H/F) pour compléter son...


  • Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein

    78350 Jouy-en-Josas _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales,...


  • Les Loges-en-Josas, France CENTRE PEDIATRIQUE DES COTES Temps plein

    LIEU : Centre Pédiatrique des Côtes 9 Chemin des Côtes Montbron – 78350 LES LOGES EN JOSAS à 5 km de Versailles – Véhicule conseillé.PRESENTATION DU CENTRE : Le Centre Pédiatrique des Côtes est un établissement de Soins Médicaux et de Réadaptation de Cardiologie  et de Pédiatrie Générale de 66 lits composé de 57 lits SMR, 8 lits...


  • Les Loges-en-Josas, France CENTRE PEDIATRIQUE DES COTES Temps plein

    LIEU : Centre Pédiatrique des Côtes 9 Chemin des Côtes Montbron – 78350 LES LOGES EN JOSAS à 5 km de Versailles – Véhicule conseillé.PRESENTATION DU CENTRE : Le Centre Pédiatrique des Côtes est un établissement de Soins Médicaux et de Réadaptation de Cardiologie  et de Pédiatrie Générale de 66 lits composé de 57 lits SMR, 8 lits...

  • Secrétaire médical

    il y a 1 mois


    Loges-en-Josas, France Centre Pédiatrique des Côtes Temps plein

    L'établissement Le Centre Pédiatrique des Côtes est un établissement de Soins Médicaux et de Réadaptation de Cardiologie  et de Pédiatrie Générale de 66 lits composé de 57 lits SMR, 8 lits d’hôpital de jour et d’1 lit de Médecine. Etablissement associatif à but non lucratif - FEHAP (Convention Collective de...


  • Saint-Marcellin-en-Forez, France ADMR les Trois Rives Temps plein

    L'ADMR de St Marcellin en Forez recrute pour des interventions à domicile**: - CDD de 6 mois évolutif en CDI, 120h/mois, à pourvoir dès que possible (temps de travail choisi).** **Secteur d'intervention** : St Romain le Puy, Sury-le-Comtal, St Cyprien, Bonson, Andrézieux Bouthéon,St Just St Rambert, St Marcellin en Forez, Périgneux et...

  • Aide Maçon

    il y a 5 jours


    Magny-en-Vexin, France LES ARTISANS DU VEXIN Temps plein

    Nous recherchons un aide-Maçon qualifié (H/F) pour rejoindre notre équipe dynamique. **Compétences obligatoires**: - Préparation du chantier, de la construction des structures aux finitions et du démontage du chantier. - Etre rigoureux, soigné, ordonné dans son travail, faire preuve d'initiatives et d'autonomie. - Faire preuve de polyvalence et de...

  • Receptionniste (H/F)

    il y a 2 semaines


    Parentis-en-Born, France Les Cottages du Lac Temps plein

    **Réceptionniste/agent d’accueil (H/F)** Résidence de Tourisme 3* Les Cottages du Lac, à Parentis en Born La Résidence « Les Cottages du Lac » est à la recherche de son/sa futur(e) réceptionniste pour la saison 2024. Missions principales: - Assurer l’accueil de la clientèle, - Prendre en charge au cours du séjour des clients les services...

  • Receptionniste (H/F)

    il y a 1 semaine


    Parentis-en-Born, France Les Cottages du Lac Temps plein

    **Réceptionniste/agent d’accueil (H/F)** Résidence de Tourisme 3* Les Cottages du Lac, à Parentis en Born La Résidence « Les Cottages du Lac » est à la recherche de son/sa futur(e) réceptionniste pour la saison 2024. Missions principales: - Assurer l’accueil de la clientèle, - Prendre en charge au cours du séjour des clients les services...

  • Agent Logistique

    il y a 4 semaines


    Soucieu-en-Jarrest, France CRIT Temps plein

    **à propos de l’entreprise**: Acteur leader dans les ressources humaines et recrutement en CDD, CDI, CDII et intérim, CRIT compte aujourd'hui près de 450 agences d'emploi généralistes et spécialisées en France. Depuis 60 ans, nous répondons aux besoins des entreprises publiques et privées dans tous les secteurs d'activité. Nous accompagnons...

  • Préparateur de Commandes

    il y a 4 semaines


    Soucieu-en-Jarrest, France CRIT Temps plein

    **à propos de l’entreprise**: Acteur leader dans les ressources humaines et recrutement en CDD, CDI, CDII et intérim, CRIT compte aujourd'hui près de 450 agences d'emploi généralistes et spécialisées en France. Depuis 60 ans, nous répondons aux besoins des entreprises publiques et privées dans tous les secteurs d'activité. Nous accompagnons...

  • Auxiliaire de Puériculture

    il y a 3 semaines


    Aix-en-Provence, France CRECHE LES BISOUNOURS Temps plein

    La crèche des Bisounours est une petite structure, gérée par une association de parents, située dans un quartier HLM à Aix en Provence. Nous accueillons 22 enfants âgés de 2 mois à 3 ans, du lundi au vendredi de 7h30 à 18h30. Ils sont répartis en trois groupes selon leurs rythmes et leurs besoins. L'équipe éducative, composée de 10 personnes,...

  • Agent Administratif

    Il y a 2 mois


    Soucieu-en-Jarrest, France CRIT Temps plein

    **à propos de l’entreprise**: Acteur leader dans les ressources humaines et recrutement en CDD, CDI, CDII et intérim, CRIT compte aujourd'hui près de 450 agences d'emploi généralistes et spécialisées en France. Depuis 60 ans, nous répondons aux besoins des entreprises publiques et privées dans tous les secteurs d'activité. Nous accompagnons...

  • Agent Administratif

    il y a 4 semaines


    Soucieu-en-Jarrest, France CRIT Temps plein

    **à propos de l’entreprise**: Acteur leader dans les ressources humaines et recrutement en CDD, CDI, CDII et intérim, CRIT compte aujourd'hui près de 450 agences d'emploi généralistes et spécialisées en France. Depuis 60 ans, nous répondons aux besoins des entreprises publiques et privées dans tous les secteurs d'activité. Nous accompagnons...

  • Receptionniste (H/F)

    il y a 1 semaine


    Parentis-en-Born, Nouvelle-Aquitaine, France Les Cottages du Lac Temps plein

    **Réceptionniste/agent d'accueil (H/F)**Résidence de Tourisme 3* Les Cottages du Lac, à Parentis en BornLa Résidence « Les Cottages du Lac » est à la recherche de son/sa futur(e) réceptionniste pour la saison 2023.Missions principales:- Assurer l'accueil de la clientèle,- Prendre en charge au cours du séjour des clients les services définis par...


  • Port-en-Bessin-Huppain, France Ifremer Temps plein

    **Description de l'offre**: Le Laboratoire Environnement Ressources de Normandie (LER/N) appartient à l’Unité Littoral du Département Océanographie et Dynamique des Ecosystèmes (ODE) de l’Ifremer. Il est implanté sur les sites de Port en Bessin. Son activité se décline suivant trois axes : (i) la surveillance et l'observation de la qualité des...


  • Bourg-en-Bresse, France Service Civique Temps plein

    En quelques mots... L’objectif de ces missions est de sensibiliser à l’alimentation de qualité, faire découvrir le monde agricole, valoriser les surplus et limiter le gaspillage alimentaire, s’approprier des savoir-faire de cuisine et de mise en bocaux et transmettre le plaisir de partager et de cuisiner ensemble. Votre mission de Service...


  • Bons-en-Chablais, France LES 2 MARMOTTES Temps plein

    PME française créée en 1976, en forte croissance, nous sommes une équipe passionnée par les plantes. Dans le cadre du renforcement de nos équipes, nous recherchons **un(e) Opérateur/trice sur ligne de conditionnement H/F**, dans le cadre d’un **Contrat à Durée Indéterminée**. Au sein d’une équipe composée d’un Chef d’équipe et de...


  • Bons-en-Chablais, France LES 2 MARMOTTES Temps plein

    PME française créée en 1976, en forte croissance, nous sommes une équipe passionnée par les plantes. Dans le cadre du renforcement de nos équipes, nous recherchons **un(e) Opérateur/trice sur ligne de conditionnement H/F**, dans le cadre d’un **Contrat à Durée Indéterminée**. Au sein d’une équipe composée d’un Chef d’équipe et de...


  • Bons-en-Chablais, Auvergne-Rhône-Alpes, France LES 2 MARMOTTES Temps plein

    PME française créée en 1976, en forte croissance, nous sommes une équipe passionnée par les plantes.Dans le cadre du renforcement de nos équipes, nous recherchons **un(e) Opérateur/trice sur ligne de conditionnement H/F**, dans le cadre d'un **Contrat à Durée Indéterminée**.Au sein d'une équipe composée d'un Chef d'équipe et de trois...


  • Vaulx-en-Velin, France GROUPE ACPPA - LES ALTHEAS Temps plein

    Description de l'entrepriseRattaché au Groupe Associatif ACPPA, situé à Vaulx-en-Velin/Carré de Soie, desservi par les transports en commun, l’établissement Les Althéas est composé d'un CSLD (60 lits) et d'un EHPAD (30 lits), bénéficient d'une structure fonctionnelle et agréable.Description du posteRattaché au Directeur d'établissement, et en...