Emplois actuels liés à Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol - BagnolssurCèze, Occitanie - Cea
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 3 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreL'offre concerne l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et leur environnement. Le post-doctorant travaillera sur la collecte et l'analyse de données WGS et de spectrométrie de masse pour identifier les gènes et les protéines impliqués dans les processus...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 1 semaine
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreCe poste est axé sur l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et leur environnement. Vous travaillerez sur des échantillons collectés dans un mésocosme où le sol est contaminé par l'arsenic.MissionsCollecte et traitement des données WGS et de spectrométrie de...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 2 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreL'offre concerne l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et leur environnement. Le candidat sélectionné travaillera sur des échantillons collectés dans un mésocosme où le sol est contaminé par l'arsenic.MissionsCollecte et traitement des données WGS et de...
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Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreCe poste concerne l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et les métaux dans un écosystème contaminé.MissionsCollecte et traitement des données WGS et de spectrométrie de masseAnalyses méta-omiques pour identifier les micro-organismes présents et leurs...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 7 jours
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreCe poste est axé sur l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et les métaux dans les environnements contaminés.MissionsCollecte et traitement des données WGS et de spectrométrie de masseAnalyses méta-omiques pour identifier les micro-organismes présents et leurs...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreCe poste est axé sur l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et leur environnement. Vous travaillerez en étroite collaboration avec notre équipe de recherche pour développer des méthodes innovantes d'analyse de données omiques et pour caractériser les fonctions et...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 3 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreCe poste est axé sur l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et leur environnement. Vous travaillerez sur des données de séquençage métagénomique et métaprotéomique pour identifier les gènes et les protéines impliqués dans les processus métaboliques des...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreL'offre concerne l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et les métaux dans les écosystèmes contaminés.MissionsCollecte et traitement des données WGS et de spectrométrie de masseAnalyses méta-omiques pour identifier les micro-organismes présents et leurs...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 2 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreL'offre concerne l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et les métaux dans les écosystèmes contaminés.MissionsCollecte et traitement des données WGS et de spectrométrie de masseAnalyses méta-omiques pour identifier les micro-organismes présents et leurs...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 2 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreL'offre concerne l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et les métaux dans les déchets miniers.MissionsCollecte et traitement des données WGS et de spectrométrie de masseAnalyses méta-omiques pour identifier les micro-organismes et leurs fonctionsSurveillance...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 2 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreL'offre concerne l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et les métaux dans les déchets miniers.MissionsCollecte et traitement des données WGS et de spectrométrie de masseAnalyses méta-omiques pour identifier les micro-organismes et leurs fonctionsSurveillance...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreCe poste est axé sur l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les interactions entre les micro-organismes et leur environnement. Vous travaillerez en étroite collaboration avec notre équipe pour développer des méthodes d'analyse innovantes et interpréter les résultats pour améliorer notre compréhension de...
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Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreCette offre concerne l'analyse moléculaire multi-omique (métagénomique et métaprotéomique) pour accéder au profilage des organismes présents dans les échantillons de sol, ainsi que leurs catalogues de gènes et leurs activités réelles.Les échantillons sont collectés dans le cadre d'une expérience de 18 mois en mésocosme,...
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Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreCe poste est axé sur l'analyse multi-omique d'échantillons de sol pour comprendre les effets de l'arsenic sur les écosystèmes. Vous travaillerez en étroite collaboration avec notre équipe pour collecter et analyser des données de séquençage métagénomique et de métaprotéomique.MissionsCollecter et analyser des données de...
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Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
il y a 3 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreCe poste est axé sur l'analyse de données omiques pour un projet de recherche visant à comprendre les interactions entre les micro-organismes et leur environnement. Vous travaillerez en étroite collaboration avec l'équipe de recherche pour collecter, traiter et analyser les données génomiques et protéomiques.Compétences...
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Post-doctorat en chimie théorique et modélisation H/F
il y a 2 jours
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinOffre de posteL'Institut de recherche et de développement en énergie atomique et alternative (CEA) recherche un post-doctorant pour rejoindre son équipe de recherche en chimie théorique et modélisation.ContexteLe projet ECCLOR vise à trouver des solutions pour traiter les effluents organiques radioactifs actuellement sans filière de...
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Post-doctorat en chimie théorique et modélisation H/F
Il y a 40 minutes
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinOffre de post-doctoratL'Institut de recherche et de développement de l'énergie atomique (CEA) recherche un post-doctorant pour rejoindre son équipe de recherche en chimie théorique et modélisation.ContexteLe projet ECCLOR vise à trouver des solutions pour traiter les effluents organiques radioactifs. Cette démarche implique le développement...
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Responsable de Lot Pilote de Contrats d'Analyse
il y a 3 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'OffreEn tant que Responsable de Lot Pilote de Contrats d'Analyse, vous participez au pilotage des contrats d'analyse, sous la supervision du Responsable de Lot Productions.Les laboratoires du CEA situés sur les sites de Marcoule, Saclay et Cadarache, spécialisés en analyses radiochimiques, chimiques, isotopiques et...
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Spécialiste R&D en décontamination d'effluents liquides
il y a 3 jours
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDéveloppement de matériaux et procédés de décontamination Notre laboratoire est actuellement à la recherche d'un(e) ingénieur(e)-chercheur(se) R&D pour développer des matériaux et des procédés de décontamination et d'extraction de métaux d'intérêts d'effluents liquides. Pour ce poste, nous recherchons des compétences en synthèse, mise en...
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Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinIngénieur en développement de matériaux et procédés de décontamination Nous sommes actuellement à la recherche d'un(e) ingénieur(e)-chercheur(se) R&D pour développer des matériaux et des procédés de décontamination et d'extraction de métaux d'intérêts d'effluents liquides. Pour ce poste, nous recherchons des compétences en synthèse, mise...
Post-doctorant en analyse multi-omique d'échantillons de sol
Il y a 3 mois
Cette offre concerne plus précisemment le volet analyse moléculaire multi-omique (métagénomique et métaprotéomique) permettant d'accéder au profilage des organismes présents dans les différents échantillons, à leurs catalogues de gènes par séquençage métagénomique, et à leur activité réelle par métaprotéomique, qui donne accès aux protéines exprimées, dont les enzymes impliquées dans les voies métaboliques des métaux ou des métalloïdes.
Les échantillons sont collectés à partir d'une expérience avec suivi de 18 mois en mésocosme où le sol contaminé par l'Arsenic provenant d'une mine d'étain est utilisé pour le suivi longitudinal de nombreux paramètres géochimiques après stabilisation puis amendements organiques et inorganiques et plantation de Festuca rubra. Les échantillons collectés et stockés dans le cadre du projet seront analysés en début de postdoc conjointement par métagénomique WGS et métaprotéomique. La métaprotéomique en particulier sera réalisée dans le laboratoire CEA Li2D qui possède une expérience reconnue en métaprotéomique et utilise des spectromètres de masse de dernière génération, permettant la plus grande sensibilité et exhaustivité pour la collecte de données sur les micro-organismes, à la fois du point de vue taxonomique et fonctionnel. Les données de séquençage métagénomique spécifiques à l'écosystème permettront d'explorer la présence de gènes d'intérêt et d'assurer la prise en compte de micro-organismes qui pourraient être absents des bases de données généralistes. Les informations sur les réactions microbiennes permettront d'améliorer les performances prédictives des modèles de transport réactif (MTR) développés au BRGM pour mieux gérer les risques associés à la distribution spatiale et temporelle des espèces chimiques dans les déchets miniers.
Les missions comprennent
- la collecte et le traitement des données WGS et de spectrométrie de masse, en incluant les optimisations spécifiques au type d'échantillons si nécessaire.
- les analyses méta-omiques avec ré-examen des méthodes disponibles au laboratoire ou dans la communauté pour les bases de données métagénomiques et la construction de MAGs, et l'identification de peptides métaprotéomiques, leur quantification et la cartographie des taxons, des protéines et des fonctions associées.
- la surveillance d'enzymes spécifiques liées aux métabolismes d'intérêt tels que les processus liés à l'Arsenic.
- les analyses longitudinales multivariées des jeux de données multi-omiques pour caractériser les fonctions et les voies métaboliques associées aux micro-organismes dans le cours de l'expérience en mésocosme.
- la valorisation des résultats du projet dans des publications à comité de lecture et des présentations lors de conférences.
Profil recherché
Formation :
- Doctorat en bioinformatique, biostatistique, analyse de données omiques ou domaines connexes
Connaissances, compétences et aptitudes requises :
- Expertise en analyse de données omiques et/ou analyses statistiques multivariées
- Connaissance de R et/ou Python
- Connaissances souhaitées en méthodes d'apprentissage automatique.
- Anglais courant
- Compétences en communication orale/écrite pour les publications et les présentations
- Esprit d'équipe
Pour postuler :
- Contact : Olivier Pible ) avec CV détaillé, lettre de motivation, liste de deux référents et si possible lettre(s) de recommandation.
- Date limite pour postuler : 31 août 2024.
- Début des entretiens : 1er septembre 2024.
Les demandes de renseignements préalables sont les bienvenues (email ou tel
Site Li2D : : Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot - Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic )
Présentation de Cea
Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.
Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs.
Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international.
Les collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :
• La conscience des responsabilités
• La coopération
• La curiosité
