Post-doctorat en Bio-informatique

il y a 2 semaines


Évry, France CNRGH - Centre National de Recherche en Génomique Humaine Temps plein

**Contexte du projet**

Ce projet a pour but l'exploration des génomes d'une cohorte exceptionnelle de 1000 centenaires (Cohorte CHRONOS du CEPH) afin d'y comprendre les mécanismes moléculaires du vieillissement "en santé" de nos aînés.
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Le post-doctorant sera impliqué dans une étude préliminaire (projet RNAEDIT) qui a pour but d'explorer des données de WGS et RNA-seq afin de détecter des bases éditées sur l'ARN. Ce mécanisme d'édition médié par les protéines de type APOBEC et ADAR permet d'apporter encore plus de diversité génétique aux transcrits - que les classiquement étudiés variants.

Cette étude préliminaire se fera sur des échantillons de sang et de cerveau d'individus centenaires non déments que l'on comparera à des individus non centenaires Alzheimer.

**Vos missions**

Votre mission sera de mettre en place le pipeline informatique d'étude de l'édition reposant sur ce qui est fait dans la littérature afin de détecter des sites édités sur l'ARN fiables et d'éviter les faux-positifs.

Il y aura donc plusieurs phases de travail : bibliographie, développement et test du pipeline, traitement des données, analyse et critique des résultats et rédaction d'un article.

**Formation**

Quelques prérequis de base sont demandés:

- bash, Python, R
- être à l'aise avec un cluster de calcul
- fort intérêt pour la génétique
- niveau d’anglais suffisant pour la rédaction d’article

Vous êtes motivé(e) pour être l'un des acteurs d'un projet original sur un sujet de santé publique.

Votre formation en bio-informatique vous permet d'appréhender aussi bien les aspects biologiques qu'informatiques. Vous êtes donc capable de critiquer vos résultats, que cela concerne la pertinence d'un variant observé ou concernant l'optimisation d'un outil utilisé.

Votre curiosité vous permet d'appréhender les choses au-delà des questions initiales et votre autonomie vous donne une certaine aisance pour progresser et tester des choses.

Vous êtes enfin capable de présenter vos travaux en réunion, en conférence mais vous êtes également - et ce point est important - à l'aise avec la rédaction d'articles scientifiques afin de valoriser vos recherches.

**Conditions de travail**

Localisation du poste : Evry (rue Gaston Crémieux) au CNRGH

Type d’emploi : CDD de 18 mois (Post-doctorat)

Rémunération suivant formation et expérience

Poste télétravaillable dans la limite de 2 jours / semaine

Avantages propres à l’entreprise : titres restaurants, comité d’entreprise

**Le Laboratoire**

Le Laboratoire de Bio-Analyse (LBA), dirigé par le Dr Eric Bonnet au Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), mène des projets de recherche en lien avec l’analyse de données génomiques / transcriptomiques humaines en collaboration avec les équipes de recherche du CNRGH ou avec nos collaborateurs externes. Le LBA travaille également sur des sujets propres mêlant nos diverses valences allant de l’analyse de variants à la conformation 3D du génome dans des contextes pathologiques variés.

Le CNRGH est un département localisé sur Evry dépendant de la Direction de la Recherche Fondamentale (DRF) du CEA.
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Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat. Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs.

Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international.

Les 20000 collaborateurs⸱trices du CEA partagent 3 valeurs fondamentales : la conscience des responsabilités, la coopération et la curiosité.

Type d'emploi : CDD
Durée du contrat : 18 mois

Avantages:

- Prise en charge du transport quotidien
- RTT
- Travail à domicile occasionnel

Horaires:

- Du lundi au vendredi
- Travail en journée

Lieu du poste : Télétravail hybride (91057 Évry)



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  • 91000 Évry, France BIO SUPPORT Temps plein

    **BIO SUPPORT** Fondé en 2006 par des entrepreneurs de la Biotech, **BIO SUPPORT est un groupement d’employeurs spécialisé dans la mutualisation de compétences en temps partagé**. Nous mettons à disposition de nos adhérents, principalement basés à Evry et à Paris, des professionnels multi qualifiés sur des fonctions « support ». Basé à...


  • Évry (91), France Illumina BIO SUPPORT Temps plein

    On behalf of ILLUMINA FRANCE, BIO SUPPORT is hiring a Technical Applications Scientist. As a Technical Applications Scientist, you will provide support to customers and colleagues on Illumina’s products, bead array and Next Generation Sequencing. Your responsibilities will include: - Troubleshoot basic inquiries utilizing foundational knowledge of...


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    il y a 4 jours


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    Notre client recherche un Développeur Thingworx expérimenté pour rejoindre son département Informatique Industrielle, dédié à la maintenance et au développement d'applications Thingworx. Vous serez au cœur des projets de personnalisation de la plateforme Thingworx, avec des missions variées allant de la gestion des exigences à la mise en œuvre...


  • Évry, Île-de-France Safran Aircraft Engines Temps plein

    La division Services de la Direction du Système d'Information (DSI) de Safran Aircraft Engines recherche un-e stagiaire.Le candidat idéal possèdera une bonne maîtrise du Pack Office et bénéficiera d'une forte connaissance des solutions informatiques. Le poste offrira l'opportunité de travailler dans une entreprise de haute technologie, leader sur le...


  • Évry, France Safran Aircraft Engines Temps plein

    Job Description Et si vous montiez à bord du vol à destination de Safran Aircraft Engines ? Safran est un Groupe international de haute technologie opérant dans les domaines de l'aéronautique (propulsion, équipements et intérieurs), de l'espace et de la défense. Safran Aircraft Engines est une société du Groupe Safran. Porté par près de...


  • Évry, Île-de-France Safran companies Temps plein

    Safran Aircraft Engines recherche un pilote en informatique industrielle pour piloter des projets d'investissement de machines. Le candidat idéal possèdera des connaissances sur Panorama E2 WinCC et/ou des logiciels de supervision similaires, ainsi que des compétences en conduite de projet et une bonne capacité de rédaction.Détails du...


  • Évry, France Safran Aircraft Engines Temps plein

    Job Description Intégré(e) au sein du Service Procédés Spéciaux de la Direction Qualité Progrès et Transformation Digitale, le-la candidat(e) aura pour mission, dans le cadre de la migration vers SharePoint Online, de développer et implémenter un site SharePoint. Le-la candidat(e) travaillera en étroite collaboration avec notre équipe et...