Stage Data Scientist 6 Mois
il y a 2 semaines
Stage Data Scientist 6 mois
Hyponatrémie à l’APHP : prévalence et évaluation de sa prise en charge.
**Niveau **:Bac +5 Analyses de données
**Durée du stage **:6 mois
**Date de début souhaitée **:01/02/2023
**Nom de la structure d'accueil **:Unité de Recherche Clinique (URC) Paris Nord Val de Seine / Délégation de la Recherche Clinique et de l’Innovation /Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)
**Sites géographiques**:
Hôpital Bichat, 46 Rue Henri Huchard 75877 PARIS 18 France
Hôpital Louis-Mourier, 178 Rue des Renouillers, 92700 Colombes
Hôpital Beaujon, 100 Bd du Général Leclerc, 92110 Clichy
**Présentation de la structure**:
L’unité de recherche clinique Paris Nord Val de Seine, URC PNVS, est dirigée par le Pr France Mentré. La responsable adjointe est le Dr Camille Couffignal et le Dr Cédric Laouénan est responsable de l’activité biométrie.
L’URC PNVS gère les projets menés par les investigateurs des cinq sites (Beaujon - Clichy, 92; Bichat - Paris, 75; Bretonneau - Paris, 75; Louis-Mourier - Colombes, 92; EHPAD Adelaïde-Hautval - Villiers-le-Bel, 95) du groupe hospitalier universitaire AP-HP.Nord - Université de Paris.
Elle est constituée d’une équipe de plus de soixante personnes parmi lesquelles: praticiens hospitaliers médecin ou pharmacien, chefs de projet, statisticiens, data-scientists, data-managers, bio-informaticiens, attachés de recherche clinique, techniciens d’étude clinique.
L’URC PNVS a pour missions principale la mise en œuvre et le suivi des projets de recherche clinique portés par les investigateurs (médecins, pharmaciens, dentistes, sages-femmes ou paramédicaux) du groupe hospitalier HUPNVS dont l’AP-HP est promoteur. L’URC PNVS met à la disposition des investigateurs des compétences méthodologiques, statistiques, datascience et technico-réglementaire pour les aider à concevoir des projets de recherche et assurer leur accompagnement (méthodologie, biostatistiques, datascience, conformité, faisabilité, budgets prévisionnels, réponses aux appels d’offres). Représentante du promoteur, l’URC PNVS assure le suivi et le contrôle de la qualité des recherches, la gestion des données des projets et participe à la coordination des activités de recherche du groupe hospitalier.
L’URC est en relation très étroite avec le département d’épidémiologie, de biostatistiques et de recherche clinique (DEBRC) et apporte un soutien méthodologique à la recherche clinique sur le groupe hospitalier. Il est constitué d’un PU-PH, 2 MCU-PH, 2 PH, 3 AHU, 2 ingénieurs de recherche, d’internes (de pharmacie et de santé publique), et 1 secrétaire.
**Contexte**
L’hyponatrémie est le trouble hydro-électrolytique le plus fréquent et elle est associée à une augmentation de la mortalité. Le traitement de l’hyponatrémie dépend de l’étiologie et nécessite donc une enquête étiologique précise. Le traitement est bien codifié mais n’est pas sans risque et nécessite des contrôles très fréquents de la natrémie avec une vitesse de correction adaptée. Aucune étude n’a évalué le respect des bonnes pratiques des recommandations d’expert, tant en termes d’exploration étiologique que de la prise en charge. Les données de natrémie sont disponibles à l’Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, chaque année pour près de 500 000 patients.
**Objectif**:
L’objectif principal de l’étude est d’évaluer le respect des pratiques médicales en fonction des recommandations en cas d’hyponatrémie sévère (< 125 mmol/L) : réalisation ou non d’un ionogramme urinaire, réalisation de ionogrammes sanguins réguliers ou non, et respect ou non de la vitesse de correction d’une hyponatrémie.
**Missions**:
- Accéder aux données d’hospitalisation des patients dans un environnement sécurisé de l’Entrepôt de Données de santé (EDS AP-HP) et procéder à une pré-processing pouvant impliquer la mise en œuvre de techniques Regex ou NLP sur des données non structurées, ainsi qu’un data management important en raison de l’hétérogénéité des données.
- Réaliser des analyses statistiques
- Descriptives (pourcentages, intervalle de confiance à 95 %, moyenne, écart-type, médiane, étendue, intervalle interquartile) et représentations graphiques adaptées.
- Analytiques : modèles de régression selon les besoins et la pertinence.
- Produire un rapport d’analyse et le présenter en fin de mission.
- Participer à des missions annexes liées à d’autres projets de recherche en cours sur l’EDS.
- Participer aux réunions d’équipe associant le DEBRC de l’Hôpital Bichât et l’équipe Inserm 1137 IAME du Pr MENTRE.
**Environnement et outils**:
- Studio de programmation JupiterLab supportant les langages Python, R, SQL, SparkR, PySpark, Scala etc.
- Plateforme Big Data admettant les caractéristiques suivantes : 2 Po (2.000 To) d'espace disque, 1 500
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