Tlm Bactériologie

**Missions Générales**:
Assurer sous la responsabilité médicale, la bonne exécution des analyses biologiques et des tâches administratives, en appliquant les règles du GBEA et dans le cadre de l’accréditation des laboratoires (norme ISO 15189), pour un traitement de qualité, fiable des examens.

**Missions permanentes du L2**:

- Prise en charge immédiate des prélèvements après enregistrement par la réception
- Ensemencement des produits pathologiques
- Isolement et identification des bactéries pathogènes sous la responsabilité du biologiste
- Ensemencement et Interprétation des antibiogrammes
- Exécuter les analyses en respectant les procédures
- Valider techniquement les résultats et informer le biologiste des résultats pathologiques
- Transcription des résultats sur l’informatique du laboratoire (GLIMS)
- Entretenir le matériel, les instruments, les appareils et automates ainsi que son poste de travail
- Approvisionner en petit matériel et réactifs les postes de travail
- Participer au circuit d’élimination des déchets
- Assurer la saisie, la mise à jour et l’archivage de données techniques (tableaux, procédures, protocoles) liés à l’activité
- Assurer la gestion des stocks réactifs (validation des livraisons, rangement des rayonnages, traçabilité sur logiciel fichier informatique)
- Assurer la transmission des informations au sein de l’équipe

**Missions générales du L3**:
Le laboratoire a pour rôle de conduire le diagnostic microbiologique des infections à mycobactéries. Il prend en charge l’ensemble des échantillons des patients consultants ou hospitalisés dans les hôpitaux universitaires de Paris-Seine-Saint Denis (H.U.P.S.S.D.), de l’hôpital de Montreuil (André Grégoire), du Centre Hospitalier de Gonesse mais aussi ceux des patients consultants dans les centres départementaux de dépistage et de prévention sanitaire (C.D.D.P.S.) de Seine-Saint-Denis. Il réceptionne également les milieux de culture correspondants à des cultures positives obtenues dans les laboratoires des hôpitaux de Montfermeil et d’Aulnay afin de compléter le diagnostic en identifiant les mycobactéries retrouvées dans ceux-ci et en évaluant leur sensibilité aux antibiotiques.
Une grande partie du travail sera effectuée au sein d’une enceinte de confinement de sécurité de niveau L3.
Le travail en enceinte de confinement nécessite de suivre des règles de fonctionnement particulières : tenue de protection adaptée au L3, port de masque et de lunettes ; respect des règles de sécurité ; prise en charge de l’entretien des locaux ; élimination des déchets par autoclavage.

**Missions permanentes du L3**:

- Participation en collaboration avec la réception commune à l’enregistrement des échantillons biologiques et milieux de culture incubés
- Contrôle de cohérence entre échantillons, prescription et étiquettes
- Préparation des différents matériels utilisés pour la conduite du diagnostic bactériologique des infections à mycobactéries (tuberculose, mycobactérioses et lèpre)
- Décontamination, mise en culture et préparation des examens microscopiques
- Examens microscopiques et enregistrement des résultats, suivi particulier des examens positifs (lors de la première indentification : tâche déclarative (en relation avec les biologistes) et examen de biologie moléculaire pour rechercher une éventuelle résistance aux antibiotiques (RT-PCR))
- Contrôle des cultures avec repérage des positifs et vérification de la présence de mycobactéries
- Identification des mycobactéries et évaluation de leur sensibilité aux antibiotiques (en relation avec les biologistes) : méthodes immuno-chromatographiques et de biologie moléculaire (extraction d’ADN, amplification génomique et hybridation).
- Définition de profils épidémiologiques des souches du complexe tuberculosis (par spoligotyping)
- Suivi et enregistrement des données d’investigations sur le système de gestion informatique de résultats du laboratoire en liaison avec l’équipe médicale.
- Gestion de la conservation des souches et extraits d’ADN des souches identifiées. Assurer le nettoyage et la biosécurité du local de confinement et des postes de sécurité microbiologique selon les procédures mises en place
- Surveillance et contrôle des flux et qualité de ventilation
- Elimination des déchets contaminés par autoclavage versant laboratoire de confinement uniquement.
- Assurer la gestion des matériels consommables et de leur flux au sein de l’enceinte (gestion des stocks et traçabilité d’utilisation)
- Assurer la maintenance et l’entretien des appareils selon les procédures préconisées par les fabricants (autoclave, automates d’incubation, congélateurs, colorateurs, microscopes, appareil pour RT-PCR, postes de sécurité microbiologique, centrifugeuses, etc.)

**Missions générales de la sérologie bactérienne**:
Le laboratoire dis