Phd/thèse (H/F)

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Marseille e, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : mercredi 27 septembre 2023

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:PhD/Thèse (H/F) en Développement de prototype d'instrument de diffusométrie compact pour la caractérisation de greffons de cornées**
Référence : UMR7249-JULFAD-002
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MARSEILLE 08
Date de publication : mercredi 6 septembre 2023
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 novembre 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2 135,00 € brut mensuel
Section(s) CN : Pharmacologie, bio-ingénierie, imagerie, biotechnologie

**Description du sujet de thèse**:
Titre de la thèse:
Développement de prototypes d'instruments de diffusométrie optique compacts et rapides pour la caractérisation de greffons cornéens en banque des tissus, et pour le diagnostic in vivo de pathologies cornéennes

Description du sujet:
Dans ce contexte, les recherches de l'équipe DiMABio ont conduit à montrer que l'analyse du signal optique rétrodiffusé par des greffons de cornée expérimentaux pouvait permettre une détection efficace au stade précoce de l'œdème cornéen [1-3]. Ce signal de diffusion est mesuré au moyen d'un montage optique à très haute sensibilité, et résolu angulairement grâce à une architecture goniométrique. La collaboration étroite avec l'EFS-PACA Corse a permis au cours des études précédentes de montrer la potentialité de cette approche non invasive. Pour accélérer la prise de mesure et rendre l'instrument compatible avec une utilisation en banque d'organes, une première version d'un prototype de diffusomètre rapide et compact a été conçue et a pu être mise en service durant plusieurs mois au sein de l'EFS, à proximité de la plateforme de conservation et de conditionnement des greffons de cornées [2].

Le but initial du projet de thèse proposé est de poursuivre le développement d'un tel instrument en concevant une nouvelle version qui serait suffisamment ergonomique en terme de temps d'acquisition et d'automatisation pour autoriser son utilisation au quotidien dans le circuit de traitement des greffons (conditionnement pour la conservation, qualification des greffons (autorisés à la greffe ou rejetés et requalifiés en greffons expérimentaux), puis conditionnement pour l'expédition pour la greffe). L'enjeu principal est également de rendre cet instrument compatible avec les contraintes sanitaires liées à son utilisation en milieu stérile au sein d'une banque de conservation de tissus ou en service de chirurgie ophtalmique. Outre la conception instrumentale, il s'agira également d'opérer des choix de dimensionnement et des caractéristiques de l'instrument, en fonction du retour d'expérience de la première génération : choix de la (des) longueur(s) d'onde utilisés, développement d'une caractérisation en fonction de la polarisation, résolution et pas angulaire de la détection goniométrique

Une fois cet instrument opérationnel, le.a doctorant.e sera amené.e à participer à des campagnes de mesures expérimentales de validation tout d'abord à l'Institut Fresnel et/ou au CERIMED, avant d'intégrer l'EFS et la clinique Monticelli-Velodrome pour y conduire des tests sur greffons de cornée au sein d'une banque des tissus et d'un service d'ophtalmologie. Cette étape sera nécessaire pour former les équipes de l'EFS-PACA Corse et de la clinique à l'utilisation de l'instrument, et récolter leurs retours en vue d'optimiser l'instrument pour une utilisation de routine dans ces services.

Le second objectif de la thèse est de développer un second prototype de diffusométrie compact, mais destiné cette fois, à terme, à une utilisation in vivo sur les patients, pour proposer un instrument rapide et fiable pour la détection précoce de l'œdème cornéen. Il conviendra d'adapter la conception aux contraintes spécifiques de l'in vivo. En particulier un travail d'analyse et de traitement de données sera nécessaire pour parvenir à discriminer efficacement les signaux rétrodiffusés par la cornée d'une part, et les signaux de rétrodiffusion provenant des organes situés en « arrière-plan » (cristallin, humeurs, rétine) d'autre part. Ces questions majeures pour l'utilisation in vivo nécessiteront peut-être probablement de modifier les paramètres instrumentaux. La conception de l'instrument destiné à l'in vivo sera opérée en étroite collaboration avec les praticiens et chirurgiens hospitaliers de la clinique Monticelli-Velodrome (Ramsay Santé).
Ce projet de thèse constitue un objectif technologique ambitieux pour l'aide à la sélection et caractérisation de greffons cornéens d'une part, mais également pour le développement d'un instrument rapide destiné au diagnostic in vivo. Il comporte par conséquent également un fort intérê

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