Bio-informaticien (F/H)

il y a 5 jours


Lyon, France Ividata Life Sciences Temps plein

Dans le cadre d'un accroissement d'activités, nous recherchons un support en bio-informatique qui participera à la définition des stratégies d’analyse, la mise en place des outils et pipelines, la réalisation des analyses, la validation d’analyses, l’accompagnement des utilisateurs et la rédaction des instructions.

Les principales activités sont détaillées ci-dessous:

- Participer à la mise en place dans un environnement cloud d’une plateforme de stockage des pipelines d’analyse bio-informatiques ainsi que des solutions de calcul computationnel nécessaires au service ;
- Mettre en place les pipelines d’analyses bio-informatiques sous Snakemake pour l’analyse des données issues de plateforme HTS (Illumina et Oxford Nanopore) pour une analyse simplifiée par les techniciens de laboratoire ;
- Réaliser le criblage et l’évaluation des différents outils d’analyse à partir de jeux de données de séquençage existants ;
- Aider dans la gestion des données de séquençage ;
- Mettre à jour les instructions d’utilisation des pipelines d’analyse ;
- Assurer la formation des équipes de techniciens de laboratoire ;
- Participer à la qualification des équipements lié au séquençage et des méthodes analytiques sur la partie bio-informatique (rédaction de protocole, réalisation des analyses, rédaction de rapport et analyse de risque) ;
- Assurer l’analyse des lots GMP et non GMP.

Vous avez:

- Un niveau BAC+5 en Bio-Informatique
- Au moins 2 ans d'expérience en Bio-informatique dans l'industrie pharmaceutique (idéalement)

Compétences indispensables:

- Maîtrise des principaux outils dédiés à l’analyse de données de HTS short-read et long-read (QC, Trimming, De novo Assembling, Mapping, Variant calling, etc ) ;
- Analyse prédictive (Annotation de génome, analyse structurale computationnelle, matrice de substitution, etc ) ;
- Programmation dans un langage de scripting (Snakemake, Python, R, Rust, bash,);
- Connaissances en génomique, notamment sur des génomes bactériens et la transcription des cellules eucaryotes.

Qui sommes nous ?

Créée en 2013, IVIDATA Life Sciences est une société de conseil française spécialisée dans le domaine de la santé. Nos 160 consultants accompagnent des laboratoires pharmaceutiques, sociétés de biotechnologies, dispositifs médicaux, établissements de santé, cosmétique, nutrition et santé animale. Nos expertises s'articulent autour de 5 domaines majeurs : Biométrie, Opérations cliniques, Affaires réglementaires, Vigilances, Assurance Qualité.


  • Bio-informaticien Senior

    Il y a 6 mois


    Lyon, France Eurofins France Clinical Diagnostics - Biomnis Temps plein

    Description du posteDans un contexte de renforcement de notre activité de séquençage à haut débit (production et développement), nous recherchons, en CDI, un(e) :                                               Bio-informaticien Senior – H/FL’équipe de bio-informatique, constituée de 3...

  • Bio-informaticien Senior

    Il y a 6 mois


    Lyon, France Eurofins Temps plein

    Description du poste Dans un contexte de renforcement de notre activité de séquençage à haut débit (production et développement), nous recherchons, en CDI , un(e) : Bio-informaticien Senior – H/F L’équipe de bio-informatique, constituée de 3 bio-informaticiens juniors, a pour but de mettre en place les pipelines d’analyse de...


  • Lyon 7e, France CNRS Temps plein

    Date Limite Candidature : lundi 30 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Bio-informaticien single cell et transcriptomique spatiale (H/F)** Référence : UMR5242-ZAYCHA-005 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : LYON 07 Date de publication : lundi 9 décembre 2024 Type de contrat : IT en contrat...

  • Bio-informaticien

    Il y a 6 mois


    Lyon 7e, France MaaT Pharma Temps plein

    **Bioinformaticien (H/F)** - Poste ouvert en CDI _ - Poste ouvert aux personnes en situation de handicap_ **Description de poste** En intégrant MaaT Pharma, vous aurez la chance de participer au développement et la production de solutions à la pointe de l'innovation pharmaceutique. Rattaché(e) au Responsable de la plateforme bio-informatique...


  • Lyon, France KALIXENS RH Temps plein

    Nous recherchons un Informaticien (H/F) en CDI, pour notre client, société industrielle spécialisée dans le têxtile. Votre mission principale sera d'assurer le bon fonctionnement des postes de travail et garantir la disponibilité permanente aux utilisateurs. Vous superviserez la maintenance du matériel. Pour ce faire, vous serez en charge de: -...

  • Vendeur Polyvalent

    Il y a 6 mois


    Lyon, France Bio c' bon Temps plein

    **Mission**: **Bienvenue chez Bio C'Bon** Depuis 2008, Bio c’ Bon se démarque par son approche conviviale et joyeuse de la consommation Bio en France. Nous prenons soin de proposer des produits bénéfiques pour la santé et propice au respect de l’environnement. Avec une centaine de magasins bio implantés au cœur des centres ville, nous sommes...

  • Vendeur Polyvalent

    Il y a 6 mois


    Lyon, France BIO C BON Temps plein

    **Bienvenue chez Bio C'Bon** Depuis 2008, Bio c’ Bon se démarque par son approche conviviale et joyeuse de la consommation Bio en France. Nous prenons soin de proposer des produits bénéfiques pour la santé et propice au respect de l’environnement. Avec une centaine de magasins bio implantés au cœur des centres ville, nous sommes proches de nos...


  • Lyon, France Eurofins France Clinical Diagnostics - Biomnis Temps plein

    Description du posteL’équipe de bio-informatique a pour but de mettre en place les pipelines d’analyse de données, notamment de séquençage, afin de permettre leur interprétation par les biologistes et scientifiques s’intéressant à différentes thématiques médicales : génétique constitutionnelle, oncologie, infectiologie, etc.Dans un...


  • Lyon, France MyBioShop Temps plein

    Nous recherchons pour notre magasin **MyBioShop à Montélimar** un(e) Responsable de Magasin pour un poste en CDI à temps plein. Le poste est à pourvoir immédiatement. MyBioShop est une jeune enseigne de magasin bio et de proximité, dynamique et à taille humaine, qui propose des produits de qualité. Nous privilégions un lien fort avec les petits...


  • Lyon, France MyBioShop Temps plein

    Nous recherchons pour notre magasin **MyBioShop à Montélimar** un(e) Responsable de Magasin pour un poste en CDI à temps plein. Le poste est à pourvoir immédiatement. MyBioShop est un magasin bio et de proximité, dynamique et à taille humaine, qui propose des produits de qualité. Nous privilégions un lien fort avec les petits producteurs de votre...


  • Lyon, France HQS EXPERT Temps plein

    Nous recherchons un **Informaticien SCADA IGNITION expérimenté** pour intégrer notre équipe projet sous la direction du chef de projet. **Missions**: - Intégration et développement sur le logiciel de supervision **IGNITION**. - Mise au point des programmes lors des recettes plateformes et des essais sur site. - Rédaction de spécifications : dossier...

  • Informaticien (H/F)

    Il y a 6 mois


    Lyon, France Hopital Intercommunal Gériatrique de Neuville et Fontaines sur Saône Temps plein

    **DESCRIPTION DE L’ETABLISSEMENT** Etablissement public de santé à vocation gériatrique (SMR, EHPAD, service à domicile, centre de formation, crèche hospitalière, résidence autonomie) réparti sur deux sites à Neuville sur Saône et Fontaines sur Saône. Comme tous les hôpitaux, l’HIG dispose d’un SI sensible car détenteur de très...


  • Lyon, France GEN-BIO Temps plein

    GEN-BIO, Laboratoire de Biologie Médicale (LBM) à exercice libéral, membre du groupe INOVIE, regroupe 35 sites dans les départements du Puy-de-Dôme, de l'Allier, du Cher, du Cantal, de la Lozère et de la Haute Loire. Nous recherchons, pour notre laboratoire situé Chamalieres qui fonctionne en pool avec les sites de Salin et Flaubert, un(e)...

  • Agent de Bio Nettoyage

    Il y a 6 mois


    Lyon, France ASSISTANCE PHARMACEUTIQUE AUVERGNE Temps plein

    Nous sommes une société régionale de location et vente de Matériel Médical pour les professionnels et les particuliers. Pour renforcer notre équipe dynamique, nous recherchons **un agent de bio-nettoyage (H/F)** Vous aurez en charge: 1/ NETTOYAGE ET DESINFECTION - Nettoyer et désinfecter le matériel médical dans le respect des procédures...


  • Lyon, France Job Direct Temps plein

    Notre agence JOB DIRECT recherche actuellement pour l'un de ses clients un **VENDEUR POLYVALENT MAGASIN BIO MI-TEMPS H/F sur CHAMBERY (73).** - Tenue du rayon_ - Mise en rayon_ - Réception des marchandises tous les jours (dépalettisation, port de charges)_ - Accueil et conseil client_ Expérience en vente Expérience en fruits et légumes est un...

  • Conseiller de Vente

    Il y a 6 mois


    Lyon, France Botanic Temps plein

    **Mission générale**: **botanic®** est une entreprise familiale qui vit sur des valeurs humaines et des partis pris écologiques. C'est la première entreprise audacieuse qui a supprimé les pesticides depuis 2008 et qui propose un management soucieux du bien être des collaborateurs. Notre ambition : Devenir la jardinerie naturelle préférée des...

  • Conseiller de Vente

    Il y a 6 mois


    Lyon, France Botanic Temps plein

    **Mission générale**: **botanic®** est une entreprise familiale qui vit sur des valeurs humaines et des partis pris écologiques. C'est la première entreprise audacieuse qui a supprimé les pesticides depuis 2008 et qui propose un management soucieux du bien être des collaborateurs. Notre ambition: Devenir la jardinerie naturelle préférée des...


  • Lyon 4e, France LA CAGETTE DES GONES Temps plein

    Vous souhaitez participer au développement d’un magasin Bio indépendant à La Croix Rousse. Une expérience unique ! Proposer une large gamme de produits issus de l’agriculture biologique, des produits locaux. Vous appréciez la polyvalence, le travail en équipe, Rejoignez-nous ! Vendeur ou Vendeuse Conseil VOS BIO-MISSIONS: Sous la responsabilité...


  • Lyon 4e, France LA CAGETTE DES GONES Temps plein

    Vous souhaitez participer au développement d’un magasin Bio indépendant à La Croix Rousse. Une expérience unique ! Proposer une large gamme de produits issus de l’agriculture biologique, des produits locaux. Vous appréciez la polyvalence, le travail en équipe, Rejoignez-nous ! Vendeur ou Vendeuse Conseil VOS BIO-MISSIONS: Sous la responsabilité...


  • Lyon 2e, France La Vie Claire Temps plein

    Descriptif du poste Nous recrutons pour notre magasin bio La Vie Claire de Villeurbanne un(e) responsable de magasin qui sera amené(e) à: En collaboration avec votre Animateur Réseau, vous êtes le garant du bon fonctionnement du point de vente et de l'épanouissement de votre équipe.Management de l'équipe : Vous recrutez, animez et organisez le...