Stage Géomatique

Date de clôture- 30/04/2023- Lieu(x) de travail- Paris- Secteur- Ensemble hospitalier- Stage

L’hôpital et Centre de Lutte Contre le Cancer Institut Curie (75005) et le département des BigDatas du CARPEM (Hôpital Européen Georges Pompidou 75015) s’associent pour le projet CANC’AIR.

CANC’AIR consiste à développer une base rétrospective (sur 3 ans) et prospective de données de qualité de l’air qui seront appariées avec des évènements médicaux aigus survenus chez des patients pris en charge pour cancer à l’Hôpital Institut Curie Paris.

Le CARPEM (pour CAncer Research for PErsonalized Medicine) a été labellisé par l’INCa en juillet 2012. Le projet CARPEM a pour objectif de mieux comprendre les mécanismes de cancérogenèse, et la relation entre la tumeur et son microenvironnement afin d’améliorer la prise en charge des malades atteints de cancer.

L'Institut Curie traite tous les cancers y compris les plus rares. Il propose une prise en charge globale des patients, du diagnostic au traitement et consacre une large place à l'innovation et à la recherche clinique. Réparti sur trois sites, l'Ensemble hospitalier de l'Institut Curie est un établissement de référence, pionnier dans la médecine de précision.

Nous recherchons actuellement un(e) stagiaire/Master pour une durée de 6 mois à 12 mois, idéalement à compter **1**er** avril 2023.**

Le poste sera partagé sur les 2 sites Département des BigDatas du CARPEM-HEGP, _75015 _et Département des Datas, Institut Curie, _75005_. Le stagiaire sera principalement (80%) du temps sur le site CARPEM-HEGP.

Le département des BigDatas du CARPEM-HEGP se situe à l'HEGP à Paris, 15 rue Leblanc, 75015 Paris (métro ligne 8, RER C).

Le Département des Datas de l’Institut Curie se situe au 26 rue d’Ulm, 75005 (RER B Luxembourg, métro 10 Maubert Mutualité, métro 7 Place Monge).

**Vos principales missions seront**:

- le développement de flux de données et d’outils d'analyse pour les données de qualité de l’air collectées auprès des organismes de qualité de l’air (ATMO-France)
- le développement de flux de données géographiques et d’outils d'analyse et de visualisation
- le développement d'outils de géotraitement en python pour l'administration et la manipulation de données géographiques
- l’automatisation des tâches de gestion de données géographiques
- le développement d’outils d’appariement avec les données pseudonimysées des patients pris en charge à l’Institut Curie
- le développement de flux de données et d’outils d'analyse pour comprendre l’impact de la qualité de l’air sur la santé d’une population suivie pour maladie cancéreuse
- le développement de nouvelles fonctionnalités
- la rechercher et préparation des données, puis l’automatisation de leur intégration
- la proposition de pistes d'amélioration (nouvelles fonctionnalités essentiellement)
- la contribution, la validation et la valorisation des outils

**Qualifications requises**:

- Ingénieur(e) ou Master en Géomatique
- Connaissances solides en SIG (Système d’information géographique), et en SGBD (Système de gestion de base de données)
- Connaissances en extraction de données et agrégation de données médicales et géographiques
- Capacité à travailler avec l'algorithmie en Python dans un environnement Jupyter dédié et/ou avec des outils comme PyCharm
- Capacité à réaliser des fouilles et récupération de données disponibles en Opendata
- Connaissances en développement Java et Apache Spark seraient appréciées
- Connaissance des méthodologies DevOps/DataOps et des outils associés (Docker, Airflow, Gitlab ) seraient appréciées
- Force de proposition, créatif(ve), bon relationnel, autonome et rigoureux(se)
- Anglais opérationnel dans un environnement professionnel
- Sens de l’écoute, du résultat et de la qualité

**Pour postuler**:
Nous vous demandons:

- Un CV et
- Une lettre de motivation

**A très bientôt **

Candidatures à envoyer à l’une ou l’autre des personnes ci-dessous:
H. Countouris
Data-manager
Equipe d'informatique biomédicale HEGP
Plateforme de Recherche Translationnelle - CARPEM
Tél. : 01.56.09.59.85

Docteur Clémence Basse
Médecin-chercheur, Oncologue médicale
Hôpital Institut Curie
26, rue d’Ulm
75005 PARIS
01.56.24.55.39