Postdoctorant en Génomique Environnementale

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : lundi 10 avril 2023

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Postdoctorant en génomique environnementale (H/F)**
Référence : UMR5240-AUDMAR-004
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : VILLEURBANNE
Date de publication : lundi 20 mars 2023
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 18 mois
Date d'embauche prévue : 1 juin 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : à partir de 4003 € bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : 5 à 10 années
Section(s) CN : Organisation, expression, évolution des génomes

**Missions**:
Le lac Dziani Dzaha est un lac très atypique salin et alcalin, formé par une éruption volcanique datée d'environ 7000 ans BP, situé sur la Petite Terre de Mayotte. Cet écosytème héberge un réseau strictement microbien, adapté à une combinaison de caractéristiques extrêmes dont certaines le rapprochent d'écosystèmes aquatiques du Précambrien. Notre consortium étudie la biodiversité, le fonctionnement biogéochimique et le registre sédimentaire depuis 2010. Nos résultats montrent une énorme biomasse photosynthétique en surface ([Chlorophyll a]

**Activités**:
Les changements de diversité et de fonctions microbiennes seront adressées par métagénomique et métatranscriptomique. Nous ciblerons des fonctions d'intérêt associées au cycle du méthane (méthanotrophie vs méthanogénése) ou du cycle du soufre (sulfato réduction, oxydation) ou encore la production primaire (oxy vs anoxygénique). Ceci nous permettra pour la première fois d'explorer le potentiel génétique des communautés ainsi que le niveau d'expression de certains gènes.
Nous tirerons avantage des données méta-omiques pour accéder à la fraction non cultivée nous permettant la description génomique ainsi la compréhension des réponses mises en jeu face à des changements de niche écologique.

Le post doctorat (i) analysera les données méta-omiques et (ii) interprètera les données, restituera les résultats et écrira les articles scientifiques en conséquence.

**Compétences**:
Analyses Bioinformatiques en métagénomique, du savoir faire en métatranscriptomique serait un plus
Bonne maîtrise de l'anglais

**Contexte de travail**:
Laboratoire MAP, équipe Adaptation aux Environnements Extremes.
L'objectif majeur de l'équipe M2E est de comprendre les processus d'adaptation des microorganismes vivant en milieux extrêmes grâce à une approche multidisciplinaire allant de la physique jusqu'aux techniques de pointe d'omiques environnementales. L'équipe se focalise sur l'étude des Archaea, dont il est primordial de comprendre l'écologie pour mieux appréhender le fonctionnement des écosystèmes et à partir desquelles des solutions biotechnologiques sont développées.

**Contraintes et risques**:
Aucun