Doctorant(E) (H/F)

il y a 3 semaines


Strasbourg, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : lundi 14 août 2023

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Doctorant(e) (H/F) en biologie moléculaire pour la caractérisation et la reprogrammation d'interactions ARN/protéine à haut-débit par microfluidique en gouttelettes**
Référence : UPR9002-MICRYC-011
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : lundi 24 juillet 2023
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 2 octobre 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2 135,00 € brut mensuel
Section(s) CN : Biologie moléculaire et structurale, biochimie

**Description du sujet de thèse**:
Les particules ribonucléoprotéiques (RNP) sont composées d'ARN associés à des protéines RBP (RNA-binding proteins) et jouent un rôle central dans les systèmes biologiques tant au niveau du maintien de l'homéostasie cellulaire, que dans l'établissement de processus infectieux ou pathologiques. En conséquence, l'identification des constituants de ces RNP et la caractérisation de leur dynamique de formation ont connu une véritable explosion au cours de la dernière décennie. La caractérisation fine du mode et de la spécificité d'interaction entre les composants de ces RNP requiert cependant l'analyse d'un grand nombre de mutants. Alors que plusieurs méthodologies à haut-débit ont été mises au point pour l'analyse de banques de mutants d'ARN, les progrès ont été plus modestes du coté protéique. Ce projet vise à mettre au point et exploiter une nouvelle technologie de criblage s'appuyant sur la microfluidique en gouttelettes d'eau dans l'huile pour analyser plusieurs millions de mutants de RBP en une seule expérience et ainsi combler ce vide technologique. Nous utiliserons pour cela une nouvelle chimie de couplage développée par l'équipe d'Alain Wagner (faculté de Pharmacie, Illkirch) qui permettra l'immobilisation efficace d'ARN cibles sur la surface interne des gouttelettes. Les gènes codant pour des mutants de la RBP seront ensuite exprimés dans ces gouttelettes, à raison de plusieurs millions de gouttelettes chacune contenant un mutant différent de la protéine. En effet, des millions de gouttelettes peuvent être facilement produites et manipulées dans nos systèmes microfluidiques. De plus, un système optique d'analyse unique, développé par l'équipe permettra de mettre en évidence la capacité de chaque mutant à reconnaître l'ARN présenté en surface de la gouttelette (suivi de relocalisation de fluorescence) et ainsi d'identifier parmi les millions de RBP mutantes, celles capables d'établir l'interaction avec leur ARN cible. Cette approche ambitieuse ouvre de nouvelles perspectives pour la cartographie des réseaux d'interaction moléculaire avec une précision encore jamais atteinte. Par ailleurs, l'utilisation d'une approche analogue permettra aussi de reprogrammer la spécificité de la RBP vers la reconnaissance de nouvelles séquences d'ARN et ainsi de développer de nouveaux couples ARN/protéines orthogonaux avec un large spectre applicatif, en particulier en biologie de synthèse, mais aussi à plus longue portée dans le domaine pharmaceutique.

**Contexte de travail**:
Le travail de thèse sera réalisé dans l'équipe « Biologie Digitale de l'ARN » dirigée par Michael RYCKELYNCK et hébergée dans l'unité CNRS « Architecture et Réactivité de l'ARN » (Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg). L'équipe possède une expertise unique reconnue internationalement dans le développement et l'utilisation de la microfluidique en gouttelettes couplée au séquençage haut-débit pour l'étude de l'ARN et le développement par évolution dirigée d'aptamères ARN fluorogènes d'intérêts biotechnologiques. L'équipe est composée de trois chercheurs permanents, de sept doctorant(e)s et de trois ingénieur(e)s.
Le/la doctorant(e) bénéficiera de l'accès à l'ensemble du matériel et infrastructure nécessaires à la bonne réalisation du projet de thèse. D'autre part, en plus d'un suivi quotidien informel des travaux de thèse et des réunions de laboratoire regroupant l'ensemble de l'équipe, des réunions hebdomadaires de suivi individuel seront organisées avec le directeur de thèse et plusieurs réunions de suivi de projet seront également organisées annuellement au sein du consortium.

**Contraintes et risques**:
Pas de contrainte ou de risque spécifique.



  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Date Limite Candidature : lundi 13 mars 2023 **Informations générales**: Référence : UPR22-LOIJIE-009 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : lundi 20 février 2023 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 13 mois Date d'embauche prévue : 3 avril 2023 Quotité de travail : Temps complet Rémunération :...

  • Doctorant (H/F)

    il y a 7 jours


    Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 3 mai 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant (H/F) - Propriétés optiques de matériaux nanocomposites multifonctionnels** Référence : UPR22-OLIFEL-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 3 juin 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant en physique nucléaire, instrumentation et radioprotection (H/F)** Référence : UMR7178-REGSOM-190 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication...

  • Doctorant (H/F)

    il y a 4 semaines


    Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 6 juin 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant (H/F) : Utilisation des procédés d'oxydation avancés pour la dégradation des nanoplastiques dans l'eau** Référence : UMR7515-DIDROB-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de...

  • Doctorant (H/F)

    il y a 7 jours


    Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 15 décembre 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant (H/F) : Caractérisation multi-omique du rôle des mécanismes de protection contre l'autoxicité pour l'évolution du métabolisme des plantes** Référence :...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 7 avril 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:post-doctorant/post-doctorante (H/F)** Référence : UMR7504-DAMMER-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : vendredi 17 mars 2023 Type de...

  • Doctorant / Doctorante (H/F)

    il y a 4 semaines


    Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 6 juillet 2023 **Informations générales**: Référence : UPR22-MEHVAH-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : jeudi 15 juin 2023 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois Date...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant en chimie analytique pour le vivant (H/F) Référence : UMR7178-REGSOM-176 Nombre de Postes : 2 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : jeudi 15 février 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois Date de début de la thèse : 1 septembre 2024...

  • Doctorant en chimie

    il y a 2 semaines


    Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant en chimie (H/F) Référence : UMR7178-REGSOM-188 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : mardi 30 avril 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois Date de début de la thèse : 1 octobre 2024 Quotité de travail : Temps...

  • Post-doctorant en Physique

    il y a 4 semaines


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    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 12 avril 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorant en Physique (H/F)** Référence : UMR7178-REGSOM-143 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : mercredi 22 mars 2023 Type de...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 5 mai 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant en chimie des procédés et des polymères (H/F)** Référence : UPR22-MADVAU-005 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : vendredi 14...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 15 septembre 2023 **Informations générales**: Référence : UPR22-MARKRA-007 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : vendredi 25 août 2023 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant en physique nucléaire, instrumentation et radioprotection (H/F) Référence : UMR7178-REGSOM-190 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : lundi 13 mai 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois Date de début de la thèse :...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 31 mai 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant H/F : Calibration d’un modèle hydrogéologique** Référence : UMR7063-NOLLES-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : vendredi...

  • Post-doctorant en Catalyse,

    il y a 4 semaines


    Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 20 décembre 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:post-doctorant en catalyse, H/F** Référence : UMR7053-ANDPAS-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : VANDOEUVRE LES NANCY Date de publication : mercredi 29 novembre...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 7 juillet 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant - Transport et transformation des pesticides des sols vers les nappes aquifères - approches isotopiques (H/F)** Référence : UMR7063-GWEIMF-007 Nombre de Postes :...

  • Doctorant (H/F)

    il y a 7 jours


    Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 30 juin 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant (H/F) Développement des matériaux cathodiques d'un électrolyseur à membrane échangeuse d'anions pour la production d'hydrogène vert à grande...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant (H/F) – Propriétés optiques de matériaux nanocomposites multifonctionnels Référence : UPR22-OLIFEL-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : vendredi 12 avril 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois Date de...

  • Doctorant H/F

    il y a 7 jours


    Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant H/F : Calibration d’un modèle hydrogéologique Référence : UMR7063-NOLLES-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : vendredi 10 mai 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois Date de début de la thèse : 1 octobre...


  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant (H/F) en Sciences des Matériaux - Etude de la polymérisation supportée de PEDOT pour la fabrication de composites thermoplastiques conducteurs électriques par extrusion Référence : UPR22-THIPAR-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : STRASBOURG Date de publication : jeudi 28 mars 2024...