Phd Position F/m Developing a Deep Learning

Il y a 2 mois


Strasbourg, France Inria Temps plein

Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_

**Type de contrat **:CDD

**Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent

**Fonction **:Doctorant

**Contexte et atouts du poste**:
[1] Y. Karami, et al. Exploring a Structural Data Mining Approach to Design Linkers for Head-to-Tail Peptide Cyclization. Journal of Chemical Information and Modeling 63.20: 6436-6450, 2023.

[2] Goverde, Casper A., et al. "De novo protein design by inversion of the AlphaFold structure prediction network." Protein Science 32.6 (2023): e4653.

**Mission confiée**:
[1] J. D Scott and T. Pawson. Cell signaling in space and time: where proteins come together and when they’re apart. Science, 326(5957):1220-1224, 2009.
[2] M. R. Arkin, Y. Tang, and J. A Wells. Small-molecule inhibitors of protein-protein interactions: progressing toward the reality. Chemistry & biology, 21(9):1102-1114, 2014.
[3] W. Cabri, et al. Therapeutic peptides targeting ppi in clinical development: Overview, mechanism of action and perspectives. Frontiers in Molecular Biosciences, 8:697586, 2021.
[4] D. J. Craik, et al. The future of peptide-based drugs. Chemical biology & drug design, 81(1):136-147, 2013.
[5] D. Schutz, et al. Peptide and peptide-based inhibitors of sars-cov-2 entry. Advanced drug delivery reviews, 167:47-65, 2020.
[6] J. Jumper, et al. Highly accurate protein structure prediction with alphafold. Nature, 596(7873):583-589, 2021.

**Principales activités**:

- Literature review of the relevant studies
- Preparing a test set using existing databased of peptides and proteins
- Developing a generative model to design peptides
- Implementing the method and preparing a software using Python
- Validating the method and analysing the results
- Writing dissertation, scientific articles and presenting the work in international conferences

**Compétences**:

- Master's degree in Computer Science, Bioinformatics, Chemoinformatics or a related master program
- Proficiency in programming languages (Python, PyTorch or R) and good coding practices
- Skills in algorithm design and computational biology
- Experience in deep learning
- Ability to work independently and also to work in a team
- Excellent oral and written English skills

**Avantages**:

- Subsidized meals
- Partial reimbursement of public transport costs
- Leave: 7 weeks of annual leave + 10 extra days off due to RTT (statutory reduction in working hours) + possibility of exceptional leave (sick children, moving home, etc.)
- Possibility of teleworking (after 6 months of employment) and flexible organization of working hours
- Professional equipment available (videoconferencing, loan of computer equipment, etc.)
- Social, cultural and sports events and activities
- Access to vocational training
- Social security coverage

**Rémunération**:
2100€ gross/month the 1st year

**Informations générales**:

- **Thème/Domaine**: Biologie numérique
Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre (BAP A)
- **Ville**: Villers lès Nancy
- **Centre Inria**: Centre Inria de l'Université de Lorraine
- **Date de prise de fonction souhaitée**: 2024-10-01
- **Durée de contrat**: 3 ans
- **Date limite pour postuler**: 2024-05-24

**Consignes pour postuler**:
**Sécurité défense**:
Ce poste est susceptible d’être affecté dans une zone à régime restrictif (ZRR), telle que définie dans le décret n°2011-1425 relatif à la protection du potentiel scientifique et technique de la nation (PPST). L’autorisation d’accès à une zone est délivrée par le chef d’établissement, après avis ministériel favorable, tel que défini dans l’arrêté du 03 juillet 2012, relatif à la PPST. Un avis ministériel défavorable pour un poste affecté dans une ZRR aurait pour conséquence l’annulation du recrutement.

**Politique de recrutement**:
Dans le cadre de sa politique diversité, tous les postes Inria sont accessibles aux personnes en situation de handicap.

**Contacts**:

- **Équipe Inria**: CAPSID
- **Directeur de thèse**:
**A propos d'Inria**:
Inria est l’institut national de recherche dédié aux sciences et technologies du numérique. Il emploie 2600 personnes. Ses 215 équipes-projets agiles, en général communes avec des partenaires académiques, impliquent plus de 3900 scientifiques pour relever les défis du numérique, souvent à l’interface d’autres disciplines. L’institut fait appel à de nombreux talents dans plus d’une quarantaine de métiers différents. 900 personnels d’appui à la recherche et à l’innovation contribuent à faire émerger et grandir des projets scientifiques ou entrepreneuriaux qui impactent le monde. Inria travaille avec de nombreuses entreprises et a accompagné la création de plus de 200 start-up. L'institut s'efforce ainsi de répondre aux enjeux de la transformation numérique de la science, de la société et de l'économie.



  • Strasbourg, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **Contexte et atouts du poste**: **Location**: The PhD will be hosted at the University of Strabourg in the city center and founded by the project PDE-IA of the PEPR IA. Since this is a...


  • Strasbourg, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **Niveau d'expérience souhaité **:Jeune diplômé **Contexte et atouts du poste**: LARSEN is a robotics team, located in Inria Nancy / Loria, that develops human-centered technologies, at the...


  • Strasbourg, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **Niveau d'expérience souhaité **:Jeune diplômé **Contexte et atouts du poste**: Ischemic stroke is a major cause of disability and death worldwide. The occlusion of blood vessels results in a...


  • Strasbourg, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **Contexte et atouts du poste**: This PhD thesis will take place in team COAST, under the supervision of Claudia-Lavinia Ignat, HDR, CRCN Inria, Inria center of Lorraine University and Gérald Oster,...


  • Strasbourg, France INRIA Temps plein

    PhD Position F/M CONTACTS: Control Optimization of Nonlinear Tendon-Actuated Continuum roboTs for Surgical applications Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais Type de contrat : CDD Niveau de diplôme exigé : Bac + 5 ou équivalent Fonction : Doctorant Mission confiée Continuum robots have emerged as promising...


  • Strasbourg, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **Contexte et atouts du poste**: This PhD thesis will take place in team COAST and will be supervised by Claudia-Lavinia Ignat, HDR, CRCN Inria, Inria center of Lorraine University and Olivier...

  • Phd in Polymer Chemistry

    il y a 5 heures


    Strasbourg, France Institut de Science et d'Ingénierie Supramoléculaires (ISIS) Temps plein

    **PhD in Polymer Chemistry**: - Réf - **ABG-115121** - Sujet de Thèse- 08/06/2023- Contrat doctoral- Institut de Science et d'Ingénierie Supramoléculaires (ISIS)- Lieu de travail- Strasbourg - Grand Est - France- Intitulé du sujet- PhD in Polymer Chemistry- Champs scientifiques- Chimie - Mots clés- Polymer chemistry, Polymerization, Sequences,...


  • Strasbourg, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **Contexte et atouts du poste**: This PhD thesis will be supervised by Claudia-Lavinia Ignat, researcher at Inria center of Lorraine University and co-supervised by Léo Joubert, assistant professor...


  • Strasbourg, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Contrat renouvelable **:Oui **Niveau de diplôme exigé **:Thèse ou équivalent **Fonction **:Post-Doctorant **Contexte et atouts du poste**: **Team** **Contacts** **Mission confiée**: Context This position in a subproject in the team Gamble. The central theme of this...


  • STRASBOURG, 67000, Grand-Est, France Orthogrid systems Temps plein

    Surgical Data Scientist - StrasbourgIn this role, candidate will work with a multidisciplinary team to design, develop & create analytical solutions through applications of Data Mining, Machine Learning and Artificial Intelligence. The ideal candidate will increase the maturity of the group's current analytical capabilities by progressing from...


  • Strasbourg, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **Contexte et atouts du poste**: **Mission confiée**: **Motivation and context** Sign language generation involves translating the spoken or written language into the visual-manual modality of sign...


  • Strasbourg, France ArcelorMittal Temps plein

    ArcelorMittal is the world’s largest steel producer. We use the most innovative technology to create the steels tomorrow’s world will be made of. Every day over 190,000 of our talented people, located in over 60 countries, push the boundaries of digitalization and use advanced technology to create a world that is stronger, faster and smarter. To help...


  • Strasbourg, France ArcelorMittal Temps plein

    You will be attached to Downstream Processes (DP), a multi-cultural cluster composed by 25 engineers and 11 technicians, organized in three teams, working on development and deploying process solutions for ArcelorMittal. In short term, you will take in charge R&D projects as project leader, propose new ideas, competitors and suppliers survey, university...

  • PostDoc position

    Il y a 2 mois


    Strasbourg, France IGBMC Temps plein

    The vacant PostDoc Position is to be filled in spring 2024. The application deadline is the 15th of January 2024. Shortlisting of candidates will start earlier. Cryo-electron tomography (cryo-ET) can provide unique ultrastructural insights into the molecular architecture of natively preserved cells. Combining it with subtomogram averaging (STA) allows for...

  • Computer Scientist Ml

    il y a 7 jours


    STRASBOURG, 67000, Grand-Est, France Orthogrid systems Temps plein

    Responsibilities- Research and prototype applications of machine learning on large medical image datasets to solve problems in orthopedic surgeries- Work with multidisciplinary team to integrate solutions into existing products- Candidate will BE working with various team members such as data engineers, data scientists, statisticians, computer scientists,...


  • Strasbourg, France ArcelorMittal Temps plein

    ArcelorMittal is the world’s largest steel producer. We use the most innovative technology to create the steels tomorrow’s world will be made of. Every day over 190,000 of our talented people, located in over 60 countries, push the boundaries of digitalization and use advanced technology to create a world that is stronger, faster and smarter. To help...


  • Strasbourg, France Digicom Temps plein

    **Contexte**_ En étroite collaboration avec une équipe de scientifiques et d'ingénieurs de données, vous êtes en charges de l'analyse de données et de la construction de modèles. - **Missions ?**_ - Concevoir et implémenter des modèles - Utiliser des techniques statistiques, d'apprentissage automatique et d'IA pour réer la prochaine génération...


  • Strasbourg, France IGBMC Temps plein

    New postdoc and doctoral positions available in the laboratory of Romeo Ricci at the IGBMC in Strasbourg, France (; ). Our institute is a leading research institution in Europe currently hosting 46 teams with researchers from all over the world. It is a facility-driven institute with state-of-the-art equipment and core expertise covering all experimental...

  • Learning Community Manager H/F

    il y a 3 semaines


    Strasbourg, France Lagardère Travel Retail Temps plein

    Lagardère Travel Retail est l’un des leaders mondiaux du Travel Retail, au service des passagers dans les aéroports, les gares et autres concessions dans 42 pays. L'une des deux divisions du groupe Lagardère, Lagardère Travel Retail répond aux besoins des passagers et des concédants de façon holistique à travers un réseau de plus de 5 000 points...

  • Test Engineer

    il y a 4 heures


    Strasbourg, France ViVitro Labs Inc Temps plein

    We have a new opportunity for a **Test Engineer** to join the growing team at **ViVitro Labs**, an internationally recognized and growing company. ViVitro Labs is a Canadian company specializing in cardiovascular device test equipment and contract testing services and is the only company in this space with two ISO 17025 accredited laboratories that offer an...