Nantes Université Recrute Pour Son Umr 1064

Il y a 2 mois


Nantes, France Université de Nantes Temps plein

Du 18 avril 2024 au 17 mai 2024- Campus Centre Loire- UFR Médecine, CR2TI UMR1064 - Bd Jean Monnet-
- Contrat Postdoctorant, du 15/06/2024 au 14/06/2025

Ouvert à tous

Postdoctorant - contractuel - CDD 12 mois temps plein

Le CR2TI est une Unité Mixte de Recherche de l’Inserm et de Nantes Université basée sur le campus du CHU de Nantes et le bâtiment IRS2. Il est constitué de 6 équipes de recherche pour un total de 230 personnes (chercheurs, enseignants-chercheurs, cliniciens, étudiants, ingénieurs, techniciens) principalement dédiées au décryptage des mécanismes immunologiques et à l'amélioration du diagnostic et des traitements dans les domaines de la transplantation d’organes, des maladies inflammatoires, auto-immunes et des maladies infectieuses.

L’équipe 1 du CR2TI (Dr F Halary) travaille sur l’exploration d’une pathologie d’étiologie virale dans le rein des patients transplantés par les techniques de transcriptomique spatiale et scRNAseq.

Le plateau technique « single-cell genomics » du CR2TI (supervision : Dr J Poschmann) collabore avec les chercheurs Nantais et propose une panoblie de manipulations de genomique fonctionnelles tel que scRNA-seq, scATAC-seq, spatial transcriptomics, Bulk transcriptomics, ChIP-seq et ATAC-seq. Elle est composée d’une equipe pluridisciplinaire avec des spécialistes de biologie moleculaires, des bio-informaticien et avec access a tous les outils nécessaires, incluant un robot et le Nova-seq (geré par GenoA)

**Missions**:
**1. Analyse bioinformatiques de données scRNA-seq et transcriptome spacial**:
Objectifs opérationnels : Extraire des informations pertinentes à partir de données scRNA-sq et de transcriptome spatial pour comprendre les variations génétiques et les expressions géniques au niveau des cellules individuelles.
Condition d'exercice : utilisation de logiciels spécialisés en bioinformatique tels que Seurat, STAR, ou Cell Ranger. Application de méthodes statistiques pour interpréter les données.
2. Développement de méthodologies scRNA-seq:
Objectifs opérationnels : améliorer et optimiser les techniques existantes de scRNA-seq pour obtenir des données plus précises et fiables. Proposer de nouvelles approches pour l'analyse des données.
Conditions d'exercice : collaboration avec des chercheurs et des bioinformaticiens. Utilisation de langages de programmation tels que Python, ou R pour développer de nouveaux outils ou scripts.
3. Interaction avec collaborateurs, gestion de projet:
Objectifs opérationnels : assurer une communication fluide avec les collaborateurs pour comprendre leurs besoins et leurs attentes. Gérer les prjets de recherche de manière efficace pour respecter les délais et les objectifs fixés.
Conditions d'exercice : participer à des réunions régulières, utiliser des outils de gestion de projet tels que Trello. Capacité à travailler en équipe et à gérer plusieurs projets simultanément.
- Fiche de poste

**Date de fin de publication** : 18/05/2024
**Date des entretiens**: semaine 22

**Contact**:



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    Du 08 février 2023 au 02 mars 2023Direction de la Recherche, des Partenariats et de l'Innovation 10 rue BIAS BP 13522 44035 Nantes Cedex 1 - Plan d'accès Catégorie A (IGE), contractuel.le, CDD 31/12/2024 (article L.332-2, 2) **MISSIONS** Le/La chargé-e de projets européens est sous la responsabilité hiérarchique de la responsable du Service Appui...


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    Du 14 mars 2023 au 13 avril 2023Direction de la Recherche, des Partenariats et de l'Innovation 10 rue BIAS BP 13522 44035 Nantes Cedex 1 - Plan d'accès Catégorie A (IGE), contractuel.le, CDD 31/12/2024 (article L.332-2, 2) **MISSIONS** Le/La chargé-e de projets européens est sous la responsabilité hiérarchique de la responsable du Service Appui et...


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    Du 23 août 2023 au 20 septembre 2023- Campus Lombarderie- Plan d'accès Catégorie C,contractuel.le, CDD 1 an ou CDI **Environnement et contexte de travail**: - Localisation : Nantes, campus Lombarderie, arrêt de tramway Michelet Nantes Université s’articule autour de quatre pôles regroupant des composantes et des unités de recherche. Le pôle...


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    Du 21 août 2023 au 20 septembre 2023- Campus LombarderieCatégorie C, contractuel.le, CDI **Environnement et contexte de travail**: - Localisation : Nantes, campus Lombarderie, arrêt de tramway Michelet Nantes Université s’articule autour de quatre pôles regroupant des composantes et des unités de recherche. Le pôle Sciences et Technologie dispose...


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    Du 03 mai 2024 au 02 juin 2024Catégorie A, contractuel-le, CDD jusqu’au 11/12/2024, contrat renouvelable (article L332-6 du CGFP) **Environnement et contexte de travail**: - Localisation : Nantes, centre-ville La Direction de la recherche, des partenariats et de l'innovation accompagne le pilotage de l’établissement, conseille et accompagne les...


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