Contrat Doctoral

il y a 6 jours


Pessac, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : lundi 17 juin 2024

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Contrat doctoral (H/F) (2024-2027)**
Référence : UMR5248-SEBVIL-003
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : PESSAC
Date de publication : lundi 27 mai 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 octobre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2135,00 € brut mensuel
Section(s) CN : Biologie cellulaire, développement, évolution-développement, reproduction

**Description du sujet de thèse**:
La thèse proposée fait partie d'un vaste projet visant à analyser le contenu en Substances Polymériques Extracellulaires (EPS) de sédiments estuariens (ANR "EXODIA"). Le projet EXODIA vise à définir la composition et la fonction des EPS dans les estuaires modernes et anciens, ainsi que leurs interactions avec les argiles et les métaux au cours de la diagenèse (i.e. transformations du sédiment postérieures à son dépôt). Ce projet repose sur 3 hypothèses : (1) les changements de la communauté microbienne avec la profondeur modifient les propriétés des EPS et impactent les cycles biogéochimiques dans les sédiments estuariens, (2) les EPS sont impliqués dans le transfert des métaux de l'eau interstitielle/porale aux sédiments et catalysent les réactions diagénétiques pendant l'enfouissement des sédiments et, (3) la complexation des EPS aux minéraux durant la diagenèse favorise la préservation de biosignatures organiques et minérales des communautés microbiennes estuariennes fossiles. Les estuaires sont des environnements présentant des gradients physicochimiques et microbiologiques marqués. Les biofilms estuariens sont en partie constitués d'EPS produites principalement par des diatomées et des bactéries. Ces EPS sont majoritairement composés de polysaccharides, de protéines, d'ADN extracellulaire, des molécules portant des groupes fonctionnels réactifs pouvant adhérer aux surfaces minérales, modifier les propriétés des sédiments et adsorber de grandes quantités de métaux. Les estuaires sont donc des environnements stratégiques pour étudier l'interaction entre les EPS des biofilms, les sédiments, l'eau et les métaux. Les EPS sont généralement moins abondantes et moins réactives lorsque la profondeur des sédiments augmente, en raison de leur dégradation par des micro-organismes qui les utilisent comme source de carbone et les métaux comme accepteurs potentiels d'électrons pour la respiration. Cependant, les EPS peuvent se trouver à des concentrations élevées à plusieurs mètres de profondeur dans les sédiments estuariens, où leur préservation peut être permise par une sédimentation rapide et une complexation avec des minéraux argileux. L'activité microbienne produit des gradients géochimiques verticaux marqués (O2, sulfures ), ce qui affecte la structure des EPS et donc la spéciation des métaux. Il est donc essentiel de déterminer le rôle des microorganismes estuariens dans la dégradation des EPS. Pour cela, il faut identifier les micro-organismes présents dans les sédiments en fonction de la profondeur et déterminer leur capacité à produire/dégrader les EPS.

L'objectif de la thèse est d'isoler, de caractériser et d'identifier les micro-organismes cultivables potentiellement impliqués dans le cycle des EPS des sédiments estuariens (diatomées ; bactéries anaérobies et aérobies ; archées), en particulier les souches produisant de grandes quantités d'EPS et/ou capables de dégrader des EPS. Des carottes de sédiments seront prélevées dans les estuaires de la Gironde (France) et de la Guadiana (Portugal). Un maximum de micro-organismes provenant des horizons sédimentaires les plus représentatifs sur des carottes de 6 m de profondeur seront isolés par une stratégie culturomique reposant sur l'utilisation de plusieurs milieux de culture et températures d'incubation, ainsi que des stratégies d'enrichissement pour se concentrer sur les souches dégradant les EPS et formant des biofilms. Après la constitution d'une banque de souches, chaque souche sera cultivée en culture pure planctonique et sessile (microplaque ou système GW2S) et leur capacité à produire des EPS (caractère mucoïde), à former des biofilms et à produire des enzymes modifiant les EPS (ADNses, protéases, hydrolases, lyases) sera évaluée. La dégradation des EPS sera également suivie par microcalorimétrie isotherme en collaboration avec l’Université de Bâle (Suisse). De plus, les activités antibiose et antibiofilm des isolats contre les souches bactériennes de référence dans la recherche sur les biofilms seront effectuées. Les informations relatives aux isolats seront répertoriées dans une base de données accessible au public. L'identification des isolats sera réalisée en pr


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    il y a 1 semaine


    Pessac, Nouvelle-Aquitaine, France CNRS Temps plein

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    il y a 1 mois


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    il y a 4 semaines


    Pessac, France CNRS Temps plein

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    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 14 juin 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur post-doctoral chimie organique - chimie supramoléculaire (H/F)** Référence : UMR5248-GILGUI-010 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PESSAC Date de publication :...

  • Contrat Doctoral 2024-2027 H/F

    il y a 4 semaines


    PESSAC, 33600, Bordeaux, France CNRS Temps plein

    La thèse proposée fait partie d'un vaste projet visant à analyser le contenu en Substances Polymériques Extracellulaires (EPS) de sédiments estuariens (ANR "EXODIA"). Le projet EXODIA vise à définir la composition et la fonction des EPS dans les estuaires modernes et anciens, ainsi que leurs interactions avec les argiles et les métaux au cours de...


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    Informations générales Intitulé de l'offre : Chercheur post-doctoral chimie organique – chimie supramoléculaire (H/F) Référence : UMR5248-GILGUI-010 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PESSAC Date de publication : vendredi 24 mai 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 2 septembre 2024...


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    Informations générales Intitulé de l'offre : Chercheur post-doctoral chimie organique – chimie supramoléculaire (H/F) Référence : UMR5248-GILGUI-010 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PESSAC Date de publication : vendredi 24 mai 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 2 septembre 2024...

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    il y a 1 semaine


    Pessac, Nouvelle-Aquitaine, France CNRS Temps plein

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    Pessac, France CNRS Temps plein

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    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: Date Limite Candidature : vendredi 28 juillet 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Thèse sur les protéines du cytosquelette bactérien H/F** Référence : UMR5248-CELGAU-015 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PESSAC Date de publication : vendredi 7 juillet 2023 Type de...


  • Pessac, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 19 juin 2024 **Informations générales**: Référence : UMR5026-FREBON0-200 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PESSAC Date de publication : mercredi 29 mai 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36...


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    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : samedi 4 mai 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant sur l'étude de l'organisation moléculaire de la paroi cellulaire H/F** Référence : UMR5248-CELGAU-025 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PESSAC Date de...


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    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 11 avril 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F Doctorant.e sur les Matériaux d’électrode à oxygène innovants à base de fer pour l’électrolyse haute température** Référence : UMR5026-FREBON0-190 Nombre de...


  • Pessac, Nouvelle-Aquitaine, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : vendredi 3 mai 2024**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Thèse Cellules Synthétiques (MSCA DN SigSynCell) H/F**Référence : UMR5031-JEABAR-016Nombre de Postes : 1Lieu de travail : PESSACDate de publication : vendredi 12 avril 2024Type de...


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    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 20 septembre 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Polymères Aromatiques Biosourcés de hautes performances pour l'Aérospatiale (H/F)** Référence : UMR5629-HENCRA-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PESSAC Date...


  • Pessac, France CNRS Temps plein

    Date Limite Candidature : jeudi 9 mars 2023 **Informations générales**: Référence : UMR5026-FREBON0-132 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PESSAC Date de publication : jeudi 16 février 2023 Nom du responsable scientifique : Samuel MARRE Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois Date de début de la thèse : 1...