Thèse : Echelles de Structuration Spatiale Des

il y a 3 semaines


Brest, France Ifremer Temps plein

**Description de l'offre**:
L’UMR BEEP (Biologie et Ecologie des Ecosystèmes marins profonds) a pour objectif d'étudier la biologie et l'écologie des écosystèmes marins profonds par une approche multidisciplinaire et holistique, des microorganismes à la mégafaune, et de la molécule à la communauté. Les recherches portent sur la description et la dynamique de la diversité biologique, les interactions biotiques et avec l’environnement ainsi que l’adaptation et la réponse des systèmes biologiques sous contraintes naturelles et d’origine anthropique. Ces problématiques sont abordées à différentes échelles spatiales et temporelles en fonction des écosystèmes étudiés : écosystèmes chimiosynthétiques, coraux d’eau froide, monts sous-marins ou plaines abyssales.

**Résumé de la thèse**
Les canyons sous-marins constituent l’une des géoformes les plus grandes et complexes du milieu profond, abritant une large diversité d’habitats, dont des coraux d’eau froide, et supportant de nombreux services écosystémiques. Un défi dans l’étude de ces environnements complexes est l’intégration des échelles de structuration spatiale, de la géoforme à l’organisme. A chaque échelle correspond des processus écologiques, des techniques d’acquisition et des algorithmes de traitement.

L’objectif de la thèse sera de réaliser une cartographie pluriannuelle et multi-échelle des habitats du canyon sous-marin de Lampaul afin d’évaluer et de suivre l'état de santé des habitats coralliens. Au-delà de la surveillance environnementale, cette cartographie multi-échelle sera également utilisée pour mieux comprendre les processus et facteurs qui régissent la distribution des coraux et leurs dynamiques. L’importance du rôle ingénieur des coraux (récifaux ou non) sur leurs fonctions écosystémiques sera également investiguée.

A cette fin, un flux d’analyse intégrant les multiples échelles spatiales sera développé pour opérationnaliser, accélérer et automatiser l'utilisation des données d'imagerie pour la cartographie des habitats benthiques.

**Mots-clés**
Canyon sous-marin, coraux d’eau froide, cartographie haute résolution, photogrammétrie, apprentissage profond, modélisation prédictive

**Profil recherché**
- Master 2 et/ou école d’ingénieur en écologie, océanographie, biostatistique ou équivalent
- Intérêt et bonnes connaissances en écologie marine et en biostatistiques spatiales
- Maitrise des outils numériques utilisés en traitement d’image (Python, C++,) et en biostatistique (R)
- Compétences et/ou connaissances en vision par ordinateur (apprentissage machine, photogrammétrie) et en traitement de données 3D appréciées
- Maitrise de l’anglais

**Conditions de travail**
- Le travail de recherche s’effectuera dans les locaux du centre Ifremer Bretagne à Plouzané.
- Des déplacements pourront avoir lieu en France et à l’étranger, incluant un séjour de quelques semaines dans un laboratoire étranger.
- La thèse impliquera des expérimentations en mer

Véritable opportunité de travailler sur les thématiques prioritaires de l’Ifremer, les contrats doctoraux proposés par l’Ifremer ouvrent droit, **pour une durée de 3 ans**, à une rémunération forfaitaire mensuelle brute égale à 2300 euros brut, non cumulable avec d’autres bourses d’étude.

**Comment postuler ?**
- un CV
- une lettre de motivation
- une lettre de référence
- un relevé de notes (Licence + Master 1 et premier semestre Master 2)

L’ensemble des documents doit être déposé sur ce site sous la forme de **2 documents.PDF. Chaque document pouvant aller jusqu'à 3 MB.**

Les contrats des doctorants démarreront à compter du **2 octobre 2023**, sous réserve de la production par le doctorant des documents administratifs autorisant son recrutement par l’Ifremer (attestation de réussite au master 2 ou diplôme d’ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors U.E.).

**L’Ifremer**

Reconnu dans le monde entier comme l’un des tout premiers instituts en sciences et technologies marines, l’Ifremer s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.

Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique. Pour le compte de l’Etat, il opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan


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    Le doctorant sera principalement accueilli au sein du laboratoire DHYSED de l’unité DYNECO de l’Ifremer et interagira fortement avec le laboratoire LEBCO de la même unité. L’objectif de l’unité DYNECO est d’étudier la réponse des écosystèmes côtiers aux pressions anthropiques et naturelles. Ses axes de recherche portent sur : i) les flux...


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    **Description de l'offre**: L’unité DYNECO (Dynamiques des Écosystèmes Côtiers) évalue les réponses des écosystèmes côtiers face aux perturbations anthropiques et naturelles. Elle mène, dans ce domaine, des activités de recherche et d’expertise qui visent à comprendre, modéliser et prévoir 1) les flux de matière dans le continuum...


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    **Description de l'offre**: Au sein de l’Ifremer, le Laboratoire d’Océanographie Physique et Spatiale (LOPS) est une Unité Mixte de Recherche composée de membres de l’Ifremer, du Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), de l’Institut de Recherche pour le Développement (IRD) et de l’Université de Bretagne Occidentale (UBO). La...


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    **Description de l'offre**: - Présentation de la structure d’accueil **Résumé de la thèse** En raison de leur localisation (intertropicale et hyper-océanique), de l’augmentation des enjeux humains (population, infrastructures, systèmes de production) dans les zones côtières basses, et d’économies climato-dépendantes, les Territoires...


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