Post-doctorat (H/F)

il y a 3 semaines

Villeurbanne, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : jeudi 16 janvier 2025 23:59:00 heure de Paris

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre**:Post-doctorat (H/F) en métagénomique des communautés microbiennes digestives**
Référence : UMR5023-CLEFRA-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : VILLEURBANNE
Date de publication : jeudi 26 décembre 2024
Type de contrat : Chercheur en contrat CDD
Durée du contrat : 30 mois
Date d'embauche prévue : 10 février 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : à partir de 3022 € bruts mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : 29 - Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés

**Missions**:
Le processus de dégradation de la litière végétale est central dans le cycle du carbone, et nous savons maintenant que les milieux d’eau douce y contribuent significativement à l’échelle globale. De nombreuses études d'écologie fonctionnelle se sont intéressées au rôle des détritivores (macro-invertébrés qui fragmentent les feuilles mortes) et à leurs capacités métaboliques de dégradation de la lignocellulose, car l’action de ces organismes décomposeurs permet le transfert du carbone et des nutriments contenus dans les feuilles vers les autres compartiments de l’écosystème. Cependant ces détritivores ont été considérés à l’échelle de “l’holobionte”, leur rôle intrinsèque n’a donc jamais été discriminé de celui de leur microbiote digestif, ce qui limite notre compréhension de ce processus écosystémique.
L’objectif de ce projet est donc d’évaluer l’influence du microbiote digestif des détritivores sur la décomposition de la litière végétale et sur les flux de carbone qui en découlent dans les milieux d’eau douce. Pour cela, la personne recrutée appliquera des approches de métagénomique et d’isotopie sur les communautés microbiennes digestives d’isopodes détritivores (modèle biologique utilisé depuis une quinzaine d’années dans l’équipe d’accueil), afin de déterminer si leur tube digestif est un bioréacteur du processus de dégradation.

La personne recrutée sera en charge de la caractérisation fonctionnelle du microbiote digestif des isopodes par approche métagénomique. La priorité sera d’identifier les fonctions de dégradation de la lignocellulose portées par les communautés digestives, sur plusieurs individus pour une dizaine d’espèces. Ces données permettront également de comparer les répertoires de gènes du microbiote entre individus et entre espèces, et ainsi d’estimer s’il existe un “core-répertoire” de gènes de dégradation dans ces communautés digestives.
La personne recrutée sera également en charge du développement d’une approche expérimentale de marquage isotopique de l’ADN (DNA-SIP) qui permettra d’identifier quelles espèces du microbiote digestif dégradent effectivement la lignocellulose, et si ces espèces clefs varient entre espèces de détritivores. Ces données permettront d’estimer le niveau de redondance fonctionnelle des communautés actives dans la dégradation des composés végétaux.
Pour mener à bien ses missions, la personne recrutée pourra s’appuyer sur la plateforme d'Écologie Moléculaire du laboratoire, ainsi que sur un ou une ingénieure bioinformatique recrutée sur le même projet ANR afin de soutenir la gestion et l’analyse des données de séquençage.

**Activités**:

- Acquisition des données de métagénomique (très certainement avec la technologie long-reads Nanopore) sur les communautés digestives d’isopodes collectés in situ
- Développement et mise en place du protocole d’ADN-SIP
- Expérimentations en conditions contrôlées et stériles
- Analyse des données de séquençage : caractérisation du répertoire fonctionnel des communautés digestives, focus sur les enzymes dégradant la lignocellulose (CAZymes), annotation de gènes, analyses comparatives (inter-individus, inter-espèces)
- Assurer la traçabilité et reproductibilité des analyses de biologie moléculaire et bio-informatiques.
- Présentation des résultats, rédaction de publications
- Possibilité d’encadrer un ou une stagiaire de Master dans le cadre du projet ANR

**Compétences**:

- Différents profils peuvent correspondre à ce poste:
solides compétences en biologie moléculaire appliquée aux nouvelles technologies de séquençage (extractions, préparations de librairies de séquençage). Des bases en bioinformatique, que vous souhaitez développer avec un appui en interne.
solides compétences en analyse bioinformatique de données (méta)génomiques (assemblage, annotation de gènes, design et implémentation de scripts, de pipelines, utilisation d’un cluster de calcul). Des bases en biologie moléculaire, que vous souhaitez développer avec un appui en interne.
- Aptitude à travailler en équipe
- Autonomie (organisation du travail)

Une expérience en ADN-SIP, ainsi que des compétences en microbiologie, ne sont pas requises mais seront considérées comme d

  • Post-doctorat Experimental

    Il y a 3 mois

    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 20 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorat experimental (H/F) en nanofluidique** Référence : UMR5306-ANNBIA-011 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : VILLEURBANNE Date de...

  • (H/F) - Post Doctorat Sur La Caractérisation

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    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 23 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F - Post Doctorat sur la caractérisation thermomécanique de composites à base de géopolymère** Référence : UMR5510-PASREY-002 Nombre de...

  • (H/F) Post Doctorat Stéréo Tomographie Pepr

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    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 30 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F post doctorat stéréo tomographie PEPR DIADEM - Essais mécaniques in situ analysés par P²-DVC** Référence : UMR5510-ERIMAI-010 Nombre de...

  • (H/F) Post-doctorant

    Il y a 2 mois

    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 21 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:(H/F) Post-doctorant / Post-doctorante : en analyse de données de transcriptomique à haut débit** Référence : UMR5558-NATARB-085 Nombre de Postes...

  • Post-doctorant (H/F)

    Il y a 4 mois

    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 24 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorant (H/F) sur Electrooxydation de molécules organiques assistée par spectroscopie Operando** Référence : UMR5256-JESGON-005 Nombre de...

  • (H/F) Post-doctorant

    Il y a 3 mois

    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 4 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:(H/F) Post-doctorant / Post-doctorante : Biologiste en biologie moléculaire et en évo-dévo des plantes** Référence : UMR5558-NATARB-083 Nombre de...

  • Thèse de Doctorat

    il y a 1 mois

    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 31 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre**:Thèse de Doctorat - Protection et équité dans l'apprentissage fédéré pour la santé numérique (H/F)** Référence : UMR5205-SARBOU-001 Nombre de...

  • Chercheur Post-doctorant en Chimie Organique

    Il y a 2 mois

    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 9 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur post-doctorant en chimie organique H/F** Référence : UMR5278-ANITLI-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : VILLEURBANNE Date de...

  • Post-doctorant en Rmn Hyerpolarisée

    Il y a 2 mois

    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 10 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorant en RMN hyerpolarisée (H/F)** Référence : UMR5082-ANNLES-012 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : VILLEURBANNE Date de publication...

  • Ouvrier Viticole

    Il y a 7 mois

    Villeurbanne, France DOMAINE F. MERLIN Temps plein

    **Le domaine** Domaine viticole familial situé à Saint-Michel-sur-Rhône recherche son/sa futur(e) “Ouvrier(ère) viticole” H/F à temps plein pour renforcer son équipe. Avec près de 10 hectares de vignes, nous sommes fiers de produire des vins renommés des appellations de Condrieu, Saint-Joseph et Côte-Rôtie. Nous cultivons nos vignes dans le...

  • Ouvrier Viticole

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  • Post-doc (H/F) Décryptage Du Rôle Protecteur Des

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    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 21 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:post-doc H/F Décryptage du rôle protecteur des éléments transposables dans la réponse antivirale** Référence : UMR5558-NATARB-082 Nombre de...

  • Post-doctorant en Chimie de Coordination

    il y a 1 mois

    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : dimanche 22 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorant en chimie de coordination (H/F)** Référence : UMR5256-AUDDEM-005 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : VILLEURBANNE Date de...

  • Ophtalmologue (H/F)

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    Villeurbanne, France RecrutMedicoSocial Temps plein

    Nous recherchons pour une stucture médicale un ophtalmologue H/F. **Environnement de travail**: Vous évoluez dans un cadre de travail attractif, dynamique et ergonomique avec une bonne ambiance et sympathique avec des secrétaires, mais aussi une plateforme internet pour la prise de rendez-vous... Vous disposez du support d’une équipe...

  • Pharmacien Gérant Pui

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    Villeurbanne, France Cabinet Saint Luc Temps plein

    Pharmacien gérant PUI - h/f - Saône et Loire 71 - CDI temps plein Pharmacien Gérant CMC catégorie A Saône et Loire, 71, Bourgogne Franche Comté Rejoignez un Groupe qui prend soin de vous ! Sous la responsabilité de la Directrice de l’établissement, vous aurez comme principales missions de: - Gérer les achats, l’approvisionnement, la...

  • Chef de Poste Adjoint

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    Villeurbanne, France Staffmatch Lyon Temps plein

    **À propos**: Créée en avril 2015, l’entreprise se lance le pari de révolutionner le marché du travail temporaire et de casser les idées reçues des agences d’intérim traditionnelles. Pari réussi, Staffmatch affiche aujourd’hui une couverture nationale, une centaine de collaborateurs permanents et plus de 50 000 collaborateurs...

  • Enseignant Chercheur Permanent

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    Villeurbanne, France Institut Paul Bocuse Temps plein

    **PROFESSOR F/H **Dans le cadre de son développement stratégique et de sa croissance, l'Institut Paul Bocuse, Ecole internationale de fort potentiel pour un poste de - **Enseignant chercheur permanent en Entrepreneuriat F/H (Entrepreneuriat, stratégie)** - **Enseignant chercheur permanent en Marketing F/H (digital, vente, commercialisation,...

  • (H/F) Propriétés Thermoélectriques de Canaux

    Il y a 3 mois

    Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 28 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:(H/F) Propriétés thermoélectriques de canaux conducteurs implantés dans du diamant cristallin** Référence : UMR5306-STEPAI-005 Nombre de Postes :...

  • Post-doctorant (F/H) Apprentissage Par Renforcement Profond Pour La Navigation Sociale Multi-robot

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    Villeurbanne, France Inria Temps plein

    **Type de contrat**: CDD **Contrat renouvelable**: Oui **Niveau de diplôme exigé**: Thèse ou équivalent **Autre diplôme apprécié**: Doctorat **Fonction**: Post-Doctorant **Niveau d'expérience souhaité**: Jeune diplômé **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria de Lyon est le 9ème centre de recherche Inria....

  • Opérateur de Production

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    Villeurbanne, France B-PHARMA Laboratoires Temps plein

    **B-Pharma Laboratoires** est un fabricant français de **compléments alimentaires** de haute qualité basé à **Chambéry. **Notre laboratoire assure un **service complet de façonnage**, depuis la fourniture de matières premières jusqu'à la livraison de produits finis, prêts à la vente. Pour faire face à une croissance très importante, nous...