Administrateur-trice Des Systèmes D'information

Il y a 2 mois


Nantes, France INRAE Temps plein

44300 NANTES _

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**Présentation d'INRAE**:
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la recherche.

C'est un acteur majeur de la recherche et de l’innovation créé le 1er janvier 2020. Institut de recherche finalisé issu de la fusion entre l’Inra et Irstea, INRAE rassemble une communauté de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.

L’institut se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal, et se classe 11ème mondial en écologie-environnement. Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

**Environnement de travail, missions et activités**:

- L'unité mixte de recherche (UMR) BIOEPAR est une unité de recherche de 75 personnes (hormis les stagiaires dont 50 titulaires) hébergée sur le site d'Oniris. Son objectif scientifique est de comprendre et d'agir sur les déterminants et la transmission des maladies infectieuses des animaux d'élevage dans une approche multidisciplinaire et multi-échelle. Vous serez affecté-e à l'équipe TIBODI qui comprend 6 chercheurs ou enseignants-chercheurs et trois personnels techniques, et qui mène des recherches sur la biologie, l'écologie et la génétique des tiques et des agents pathogènes dont elles sont les vecteurs. Ses objectifs sont de caractériser la génétique des tiques et des agents pathogènes transmis par les tiques pour la santé animale et publique et de comprendre les déterminants de leur écologie dans les agro-écosystèmes en zone tempérée. Les recherches de l'équipe portent notamment sur la diversité génétique, la structure et l'évolution comparée des génomes de différentes espèces de tiques ayant des profils écologiques variés. Vous travaillerez principalement avec deux chercheurs de TIBODI en biologie évolutive, et fournirez un appui à deux autres équipes de l'unité qui travaillent sur des génomes bactériens.
Vos missions:

Votre travail se fera principalement dans le cadre des projets de l'équipe TIBODI. Vous serez amené à interagir avec d'autres équipes de recherche en génomique partenaires de TIBODI, Genoscope /CEA à Evry et la plateforme BIPAA à L'IRISA de Rennes.
Vous devrez nourrir et gérer une importante base de données intégrant les séquences génomiques de différentes espèces de tiques, dont quatre génomes sont déjà séquencés dans le cadre du projet GenIric que nous avons porté. Vous devrez également intégrer dans cette base les données déjà publiées pour d'autres génomes de tiques, afin de faciliter leur comparaison. Vous contribuerez au traitement des données de transcriptomique : assemblages, mappings sur le génome ainsi qu'à des analyses de génomique populationnelle (mapping de reads, balayage et analyse des SNPs).
Vous contribuerez également à l'analyse de données produites dans le cadre des travaux des équipes APPIFISH (génomes des différentes souches de bactéries pathogènes) et IMMUNOCARE (analyse de données single-cell RNA-Seq et ATAC-Seq).
Vos activités:

- gestion des données de séquences génomiques et de leurs annotations pour différentes espèces de tiques: organiser le stockage des données massives et multi sources et assurer leur maintenance
- analyses de génomique comparative (comparaisons des répertoires de gènes, analyse de synténie)
- gestion des données transcriptomiques : comptage d'expression pour de multiples librairies, insertion de ces données dans l'outil Apollo
- analyse de polymorphisme génétique à partir de données de capture d'exome
- gestion et annotation de séquences génomiques bactériennes
- ouverture et FAIRisation des données : documentation des métadonnées, analyse du degré critique des données et recommandations sur le degré d'ouverture

**Vous exercerez dans une unité de recherche publique relevant de 2 tutelles (INRAE et Oniris), hébergée à Oniris, et devrez vous intégrer dans les spécificités et règles de chacune, notamment les schémas directeurs en informatique et leurs évolutions**

***

**Formations et compétences recherchées**:

- Idéalement Master 2 ou école d'ingénieur en Bioinformatique
Compétences:

- Maîtrise de Linux et Bash, et de langages de programmation;
- Maîtrise de logiciels d'analyses bio-informatiques;
- Connaissances en R;
- Analyse de données NGS (préparation/nettoyage de données, mapping



  • Nantes, France DÉPARTEMENT DE LOIRE-ATLANTIQUE Temps plein

    Filière: **Administrative** ou Technique Métier: **Finances - Contrôle gestion, Economie - Développement, Informatique - NTIC** Catégorie: **A** **Attaché territorial** **ou Ingénieur territorial** Titulaire **NANTES** **(Pays de la Loire)** *** **Titulaire** Expérience: **Indifférent** Rémunération statutaire + régime...


  • NANTES, France Naval Group Temps plein

    Le site de Naval Group Nantes/Indret recrute un(e) administrateur(trice) système d'information & réseaux.Vous intégrez le service production contrôle commande du département ingénierie électrique et automatismes qui assure la conception et la programmation des logiciels et outils de maintenance des sous-marins et navires de surface.Vos principales...


  • NANTES, 44100, Rezé, France Naval Group Temps plein

    Le site de Naval Group Nantes/Indret recrute un(e) administrateur(trice) système d'information & réseaux.Vous intégrez le service production contrôle commande du département ingénierie électrique et automatismes qui assure la conception et la programmation des logiciels et outils de maintenance des sous-marins et navires de surface.Vos principales...


  • Nantes, France Solead RH Temps plein

    **Solead RH** est un cabinet de chasse de tête & de recrutement Villefranchois (12) & Toulousain (31), issu du terrain depuis plus d’une dizaine d’années, nous relevons chaque challenge en accord avec vos valeurs, avec un service de proximité. Nous accompagnons notre client dans leur recrutement suivant, ainsi que dans la sélection de leurs futurs...


  • Nantes, France NANTES UNIVERSITE Temps plein

    Descriptif du poste Vous intégrez une équipe dynamique et solidaire (Service des Dispositifs Numériques Transversaux) qui embrasse tous les sujets autour du poste de travail en tant qu administrateur de systèmes d infrastructures Microsoft, en prenant part à une aventure humaine et technologique enrichissante, au cœur de l enseignement supérieur et...


  • Nantes, France NANTES UNIVERSITE Temps plein

    Descriptif du poste Vous intégrez une équipe dynamique et solidaire (Service des Dispositifs Numériques Transversaux) qui embrasse tous les sujets autour du poste de travail en tant qu administrateur de systèmes d infrastructures Microsoft, en prenant part à une aventure humaine et technologique enrichissante, au cœur de l enseignement supérieur et...


  • Nantes, France TERRITOIRE D’ÉNERGIE 44|TERRITOIRE D ENERGIE LOIRE ATLANTIQUE (T Temps plein

    Le poste de administrateur systèmes d’information (H/F)Territoire d’énergie Loire-Atlantique recherche un administrateur systèmes d’information (H/F) en contrat de projet de 24 mois.Cadre d’emploi des techniciens territoriaux - Poste à pourvoir rapidementVos futures missions, en quelques mots :Au sein du service Organisation et Système...


  • Nantes, France Département de Loire-Atlantique Temps plein

    **Informations sur l'offre**: - Publish on 15/02/23 - (Ref : S-60997A) Bâtiment Sully 1 - 23, 25 rue Pitre Chevalier - Nantes Direction finances et commande publique - Sous la responsabilité hiérarchique de la directrice finances et commande publique **Profil souhaité**: - Filière Administrative - Filière Administrative / Technique - Catégorie A -...


  • Nantes, France Ecritel Temps plein

    Pour soutenir la croissance d'Ecritel, nous recrutons des administrateurs / administratrices Système Linux pour notre activité Hébergement & Infogérance. Les postes sont situés à Clichy-la-Garenne, Nantes, Bordeaux, Vannes ou éventuellement en Télétravail. **Missions et activités** - Traitement et analyse des problèmes (1ème et 2ème niveau) -...


  • Nantes, France Naval Group Temps plein

    Organisation NAVAL GROUP Nous sommes un acteur international dans l'industrie navale de défense depuis plus de 400 ans, repoussant continuellement les limites pour construire l'avenir. Nous recrutons des talents pour concevoir, réaliser et entretenir des produits exceptionnels tels que des sous-marins, des porte-avions et des frégates dont la...


  • Nantes, France Naval Group Temps plein

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  • Nantes, France ALTEREA Temps plein

    Description de l'entreprise **Le Groupe ALTYN** **est un acteur fran**ç**ais, ind**é**pendant et engag**é** dans le conseil, l’ingénierie, les travaux et les services liés à la **transition énergétique, environnementale et numérique.** Notre vocation est de concevoir, construire, réhabiliter et exploiter les bâtiments, équipements et réseaux...

  • Administrateur infrastructure

    il y a 2 semaines


    Nantes, France Sully Group Temps plein

    Nous recherchons pour intégrer les équipes de notre client Grand Compte du secteur public, un Administrateur Système Linux H/F. Vous participez à la mise en œuvre des évolutions du système d’information par l'installation, la mise en production et la maintenance des éléments de l’infrastructure , et assurez la disponibilité du système ,...


  • Nantes, France ALMERIA SOLUTIONS INFORMATIQUES Temps plein

    **DESCRIPTIF DU POSTE ADMINISTRATEUR SYSTÈMES ET RÉSEAU** Intégré(e) au service Technique de notre agence de Vendée, vous avez pour mission d’assurer la mise en place des projets d’infrastructures de nos clients. Vos missions s’articulent autour de deux axes: - L’activité techniqueDéployer et maintenir les solutions vendues chez les...


  • Nantes, France CORDON ELECTRONICS Temps plein

    RESEAUX : Administrateur Systèmes et Réseaux (H/F) **CDI** **Publié le : 16 février 2023** **Localisation : Cesson Sévigné** Au sein de Cordon GROUP, la société - **Mobiltron** est spécialisée dans le secteur du E-commerce et de la distribution multi-canal auprès des marques, des enseignes et des pure players. Société à taille humaine de 80...


  • Nantes, France Arpège Temps plein

    **L'entreprise** Editeur de solutions logicielles, spécialisé sur le marché des collectivités territoriales, Arpège crée, commercialise et héberge une suite de solutions interconnectées. L'entreprise offre une expérience citoyenne unique à travers l'optimisation des processus métiers, la qualité de la relation citoyenne et un accompagnement...


  • NANTES, France Naval Group Temps plein

    Vous êtes basé(e) sur le site de Nantes-Indret, le pôle d'excellence de l'énergie propulsion des sous-marins et bâtiments de surface, en charge de la conception, la réalisation, des essais et de l'entretien de systèmes et équipements nucléaires et conventionnels.Raison d'être de la fonction : mettre en oeuvre un système...


  • Nantes, France Arpege Temps plein

    Éditeur de solutions logicielles, spécialisé sur le marché des collectivités, Arpège crée, commercialise, déploie et héberge une suite de solutions interconnectées. Grâce à un accompagnement client d'une grande qualité, l'entreprise offre une expérience citoyenne unique à travers l'optimisation des processus métiers et la qualité de la...

  • Administrateur Systemes

    il y a 4 jours


    Nantes, France OPTIMA Temps plein

    Nous recherchons pour l'un de nos Clients un Administrateur Systèmes & Réseaux pour renforcer notre équipe dynamique suite à une cyberattaque. Notre environnement de travail offre une atmosphère stimulante propice à l'épanouissement professionnel. Rejoignez notre équipe au sein d'un environnement unique où l'excellence technique rencontre un cadre...


  • Nantes, France SMA NETAGIS Temps plein

    **SMA NETAGIS recrute un administrateur(trice) systèmes et réseaux expérimenté(e) en Loire Atlantique (44).** Entreprise à taille humaine de 15 collaborateurs, dont le siège social est à Orvault près de Nantes, SMA NETAGIS est spécialisée depuis plus de 20 ans dans les produits et services IT orientés infogérance et sécurité (SMA), et dans les...