Post-doctorat (H/F)
il y a 3 semaines
Date Limite Candidature : jeudi 23 février 2023
**Informations générales**:
Référence : UMR7159-SAKAYA-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : PARIS 05
Date de publication : jeudi 2 février 2023
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 3 avril 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 2 889 € brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
**Missions**:
Plus spécifiquement, le ou la post-doctorante étudiera la distribution spatiale de la diversité zooplanctonique. À l'aide d'algorithmes d'apprentissage automatique (forêt aléatoire, réseau de neurones, perceptron multicouches), le ou la post-doctorante exploitera les ensembles de données disponibles de séquençage à haut débit du zooplancton (métabarcoding, mais aussi de métagénomique) et des données d'imagerie quantitative (Zooscan, UVP) pour prédire la distribution de la diversité taxonomique et fonctionnelle du zooplancton à partir des sorties des modèles physiques et de bas niveaux trophiques du service européen Copernicus (CMEMS).
**Activités**:
- Le ou la post-doctorante contribuera en particulier à:
- compiler les données disponibles (omique, imagerie, occurrences) permettant de caractériser la diversité taxonomique et fonctionnelle du zooplancton marin à l'échelle globale et en Atlantique Nord-Est
- entraîner des algorithmes d'apprentissage automatique pour prédire la diversité taxonomique et fonctionnelle du zooplancton marin à partir des sorties des modèles physiques et biogéochimiques (bas niveaux trophiques: PISCES, ERSEM) de Copernicus/CMEMS
- analyser et exploiter les données collectées par le PNMI en mer d'Iroise et co-construire un cas d'étude avec les gestionnaires du PNMI
**Compétences**:
- Thèse en océanographie
- Maîtrise de la programmation avec R et/ou Python, maîtrise des commandes et scripts bash
- Expérience passée, attestée par au moins une publication en premier/co-premier ou deuxième auteur/autrice, sur un des thèmes suivants : manipulation et analyse de grands jeux de données à partir d'observations (omique, imagerie quantitative) et/ou de modèles numériques, apprentissage automatique (y compris modèles de niche)
- Une expérience passée sur le plancton marin serait un plus
- Maitrise de l'anglais (et éventuellement du français), aussi bien à l'écrit qu'à l'oral
- Capacité à travailler à la fois de manière indépendante et en équipe sur un projet pluridisciplinaire
**Contexte de travail**:
Le Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN) conduit des études sur les processus physiques et biogéochimiques de l'océan et leur rôle dans le climat en interaction avec les écosystèmes marins.
Le poste est financé par le projet européen NECCTON. Le travail sera mené dans le cadre de la tâche 4.3.1 du projet NECCTON et sous la supervision de Sakina-Dorothée Ayata au LOCEAN.
La personne recrutée travaillera également en interaction avec les autres partenaires du projet NECCTON, en particulier NERSC en Norvège, PML en Angleterre, Mercator Océan International et CLS à Toulouse, chargés de développer les nouveaux modèles d'écosystèmes marins au sein du WP5 ou utilisant des méthodes d'apprentissage automatiques pour analyser d'autres types de données au sein du WP4. Enfin, la personne recrutée interagira avec le Parc Naturel marin d'Iroise (PNMI) de l'Office Français de la Biodiversité (OFB) pour analyser et exploiter les données collectées par le PNMI et pour co-construire un cas d'étude avec les gestionnaires du PNMI dans le cadre du WP9 du projet NECCTON.
**Contraintes et risques**:
L'emploi est basé à Paris. Un à deux déplacements de courte durée par an, en France et à l'étranger, sont à prévoir pour participer aux réunions du projet NECCTON.
**Informations complémentaires**:
Toute question sur le poste peut être adressée à sakina-dorothee.ayata (at) locean.ipsl.fr avec pour sujet du message : Question post-doc NECCTON.
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