Bio-informaticien (F/H)
Il y a 5 mois
**Employeur**:
Et si vous rejoigniez une structure en pleine mutation vers l’université de demain ?
Au premier rang des universités françaises et francophones, Aix-Marseille Université (AMU) regroupe 78 000 étudiants, 8 000 personnels, 122 structures de recherche en lien avec les plus grands organismes dans ce domaine et un budget de 720 M€. 5 grands campus accueillent les étudiants et tous les champs universitaires qu’il est possible d’étudier en France. La diversité des sites permet de proposer aujourd’hui des opportunités de carrière uniques. Aix-Marseille Université fait partie de l'alliance CIVIS pour la création des "Universités Européennes". Aix-Marseille Université recrute et reconnait tous les talents, ses offres d'emplois sont handi-accessibles.
**Mission**:
Le C2VN est une unité mixte de recherche de plus de 250 personnes, sous la triple tutelle d'Aix-Marseille Université, de l'INSERM et d'INRAE et se situe sur le Campus Universitaire de la Timone à Marseille. L'unité étudie les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans le développement de la pathologie cardiovasculaire, la dysfonction endothéliale et la thromboinflammation.
Rattaché à la Faculté des sciences médicales et paramédicales, au sein du C2VN, le bio-informaticien sera en charge en premier lieu du démultiplexage et de l'analyse de données de single cell RNA-seq et de l'analyse de données de single cell multiome de 10x Genomics (combinant l'accessibilité de la chromatine et l'expression des gènes) pour les projets menés au C2VN. Au-delà il développera les outils nécessaires aux travaux de bioinformatique du C2VN. Il devra prendre en main certains pipelines déjà conçus, les adapter aux besoins des projets à venir et produire des rapports de résultats en tenant compte des demandes des porteurs de projet. Il devra être à même d'améliorer les pipelines existants pour y introduire de nouvelles méthodes issues de la littérature.
**Activités principales**:
- Développer des pipelines dédiés à l'analyse des données de single-cell RNA-seq générées au sein du C2VN
- Concevoir et optimiser de nouvelles méthodes d'analyse moléculaire et cellulaire.
- Rédiger des protocoles d'utilisation des outils et des méthodes mises en place/utilisées.
- Veiller au respect des principes d'accessibilité, d'interopérabilité et de portabilité des données et des outils.
- Interagir et apporter des conseils et un soutien technique aux chercheurs et ingénieurs du laboratoire.
- Diffuser et valoriser les résultats et les développements sous forme de rapports, de publications, de présentations orales et de formations.
- Assurer et organiser une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité et dans un contexte interdisciplinaire.
- Définir les procédures qualité et veiller à leur mise en œuvre et à leur respect.
**Positionnement hiérarchique**: Sous l'autorité directe du professeur PE Morange, co-directeur du C2VN
**Profil**:
Vous avez une expérience réussie en bioinformatique appliquée aux données génomiques ou transcriptomiques, et à l'échelle single-cell. Vous avez un intérêt pour les questions biologiques.
Vous maîtrisez la programmation dans différents environnements informatiques, ainsi que l'utilisation de logiciels spécifiques à l'activité.
Enfin, vous êtes une personne organisée, avec une bonne capacité de communication et d'écoute et une aptitude au travail en équipe.
**Compétences clés**:
- Maîtrise de la programmation en R, PYTHON
- Maîtrise des logiciels requis pour l'analyse de données génomiques et single cell (CellRanger, Seurat,monocle, Citeseq,..) Compréhension pratique des méthodes mathématiques d'analyse de données multidimensionnelles (data normalisation, HTO Demux, quality control, clusterisation, t-SNE, UMAP, pseudotime,...).
- Connaissance pratique des outils de conteneurisation (Docker, Singularity), gestionnaires de version (Github) et gestionnaires de workflow (Snakemake) souhaitée.
**Un processus de recrutement fluide et transparent**:
En cas de réussite, nous mettrons tout en œuvre pour confirmer votre recrutement rapidement. À votre arrivée, vous bénéficiez d'un parcours d'accueil et d'intégration, ainsi que de formations adaptées à vos besoins pour favoriser votre développement professionnel.
**Rejoindre AMU, c’est bénéficier d’un environnement de travail socialement engagé**:
- **Une flexibilité du travail** : la possibilité de télétravailler jusqu'à 2 jours par semaine après seulement 6 mois d'ancienneté selon le service concerné
- **Un équilibre** **des temps de vie** : bénéficiez jusqu'à 50 jours de congés dès la première année, puis 58 jours après un an
- **Un accompagnement personnalisé** pour les personnels en situation de handicap
- La prise en charge des transports en commun à hauteur de 75% compatible avec un forfait mobilité durable
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Bio-informaticien (H/F) dans une unité de recherche
il y a 3 semaines
Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France Aix-Marseille Université Temps pleinMission et objectifsL'unité C2VN, sous la tutelle d'Aix-Marseille Université, de l'INSERM et d'INRAE, se concentre sur l'étude des mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans le développement de la pathologie cardiovasculaire.Le bio-informaticien (H/F) sera chargé du démultiplexage et de l'analyse de données de...
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Bio-informaticien en alternance
il y a 4 semaines
Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France EFS Temps pleinDescription du posteMétierActivités de laboratoires / Biologie Médicale - Technicien de laboratoireIntitulé du posteBio-informaticien en alternance - Marseille 5e F/HContratContrat en alternanceTemps de travailTemps completDescription de la missionPour toi, intégrer l'Etablissement Français du Sang, c'est intégrer l'opérateur civil unique de la...
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Bio Informaticien
il y a 4 semaines
Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France EFS Temps pleinDescription du posteMétierActivités de laboratoires / Biologie Médicale - Technicien de laboratoireIntitulé du posteBio Informaticien - Marseille 5e F/HContratContrat en alternanceTemps de travailTemps completDescription de la missionPour toi, intégrer l'Établissement Français du Sang, c'est intégrer l'opérateur civil unique de la...
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ALTERNANCE - Bio Informaticien- Marseille 5e F/H
Il y a 6 mois
Marseille, France EFS Temps pleinDescription du poste Métier Activités de laboratoires / Biologie Médicale - Technicien de laboratoire Intitulé du poste ALTERNANCE - Bio Informaticien- Marseille 5e F/H Contrat Contrat en alternance Temps de travail Temps complet Date de prise de poste envisagée Septembre 2024 Rémunération Barème...
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Responsable de Magasin Bio
Il y a 5 mois
Marseille, France Naturel & Bio Temps pleinNous recherchons pour notre magasin **Naturel & Bio à Montélimar** un(e) Responsable de Magasin pour un poste en CDI à temps plein. Le poste est à pourvoir immédiatement. Naturel & Bio est un magasin bio et de proximité, dynamique et à taille humaine, qui propose des produits de qualité. Nous privilégions un lien fort avec les petits producteurs...
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Bio-informaticien F/H
Il y a 6 mois
Marseille, France Aix-Marseille Université Temps pleinMission Le C2VN est une unité mixte de recherche de plus de personnes, sous la triple tutelle d'Aix-Marseille Université, de l'INSERM et d'INRAE et se situe sur le Campus Universitaire de la Timone à Marseille. L'unité étudie les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans le développement de la pathologie cardiovasculaire, la dysfonction...
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Bio-informaticien F/H
il y a 4 semaines
Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France Aix-Marseille Université Temps pleinMissionLe C2VN est une unité de recherche pluridisciplinaire qui étudie les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans le développement de la pathologie cardiovasculaire, la dysfonction endothéliale et la thromboinflammation. Nous sommes à la recherche d'un bio-informaticien pour rejoindre notre équipe et contribuer à l'analyse de...
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Bio-informaticien F/H
il y a 4 semaines
Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France Aix-Marseille Université Temps pleinMissionL'unité C2VN est une équipe de recherche pluridisciplinaire qui étudie les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans le développement de la pathologie cardiovasculaire, la dysfonction endothéliale et la thromboinflammation.Le bio-informaticien sera en charge du démultiplexage et de l'analyse de données de single cell...
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Bio-informaticien F/H
il y a 4 semaines
Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France Aix-Marseille Université Temps pleinMissionLe C2VN est une unité de recherche qui étudie les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans le développement de la pathologie cardiovasculaire, la dysfonction endothéliale et la thromboinflammation. Rattaché à la Faculté des sciences médicales et paramédicales, le bio-informaticien sera en charge du démultiplexage et de...
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Vendeur Polyvalent
Il y a 5 mois
Marseille, France SO BIO Temps pleinBienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout.Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble.Depuis 2005,...
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Boucher (F/H)
Il y a 5 mois
Marseille, France SO BIO Temps plein**Bienvenue chez So-bio** Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout. Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble. Depuis...
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Vendeur Polyvalent
Il y a 6 mois
Marseille, France SO BIO Temps pleinBienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout.Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble.Depuis 2005,...
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Employe Libre Service Polyvalent
Il y a 5 mois
Marseille, France Bio Co Temps plein**Faites partie de la Famille Bio & Co : Transformez votre Passion en Carrière !** **BIO&CO** est un acteur reconnu de la filière bio depuis bientôt **25 ans**. Avec 7 magasins et 2 espaces de restauration situés en région PACA (Aix en Pce, Bouc Bel Air, Lambesc, Marseille, Salon de Pce, Toulon et Vallauris),** BIO&CO** propose une très large gamme de...
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Employe Libre Service Polyvalent
Il y a 3 mois
Marseille, France Bio Co Temps plein**Faites partie de la Famille Bio & Co : Transformez votre Passion en Carrière !** **BIO&CO** est un acteur reconnu de la filière bio depuis bientôt **25 ans**. Avec 7 magasins et 2 espaces de restauration situés en région PACA (Aix en Pce, Bouc Bel Air, Lambesc, Marseille, Salon de Pce, Toulon et Vallauris),** BIO&CO** propose une très large gamme de...
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Vendeur Polyvalent
Il y a 6 mois
Marseille, France BIO C BON Temps pleinBienvenue chez Bio C'Bon Depuis 2008, Bio c’ Bon se démarque par son approche conviviale et joyeuse de la consommation Bio en France. Nous prenons soin de proposer des produits bénéfiques pour la santé et propice au respect de l’environnement. Avec une centaine de magasins bio implantés au cœur des centres ville, nous sommes proches de nos...
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Informaticien Service Hotline
Il y a 5 mois
Marseille, France iziwork Temps pleinIziwork, l’agence digitale d’intérim #1 en France, recherche un Informaticien service hotline (h/f) à 2200€ - 2300€ brut/mois + 10% d'indemnités de fin de mission (IFM) + 10% de prime de congés payés (CP), soit 2 662,00€ - 2 783,00€ par mois. Postulez en quelques secondes, accédez à nos services uniques (dont acompte 24h) et bénéficiez...
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Vendeur Polyvalent
Il y a 5 mois
Marseille, France BIO C BON Temps pleinBienvenue chez Bio C'Bon Depuis 2008, Bio c’ Bon se démarque par son approche conviviale et joyeuse de la consommation Bio en France. Nous prenons soin de proposer des produits bénéfiques pour la santé et propice au respect de l’environnement. Avec une centaine de magasins bio implantés au cœur des centres ville, nous sommes proches de nos...
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Vendeur Polyvalent
Il y a 5 mois
Marseille, France BIO C BON Temps pleinBienvenue chez Bio C'Bon Depuis 2008, Bio c’ Bon se démarque par son approche conviviale et joyeuse de la consommation Bio en France. Nous prenons soin de proposer des produits bénéfiques pour la santé et propice au respect de l’environnement. Avec une centaine de magasins bio implantés au cœur des centres ville, nous sommes proches de nos...
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Boucher Vendeur
Il y a 5 mois
Marseille, France BIO ARTISANAL MEDITERRANEE Temps plein**UNEBIO (Union des Eleveurs BIO),** est une société commerciale gouvernée par des éleveurs et gérée par des professionnels de la filière viande. Le réseau est composé de 2 800 éleveurs structurés en SAS et organisés sur un modèle coopératif. Il est le premier outil collectif d’éleveurs bio spécialisé dans la mise en marché de viandes Bio...
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Vendeur Polyvalent
Il y a 6 mois
Marseille, France Boucherie Bio Artisanal Méditerranée Temps plein**UNEBIO (Union des Eleveurs BIO),** est une société commerciale gouvernée par des éleveurs et gérée par des professionnels de la filière viande. Le réseau est composé de 2 800 éleveurs structurés en SAS et organisés sur un modèle coopératif. Il est le premier outil collectif d’éleveurs bio spécialisé dans la mise en marché de viandes Bio...
