Calcul Des CoÛts D'expression Des Circuits

il y a 3 semaines

JouyenJosas, France Université Paris-Saclay GSLife Sciences and Health Temps plein

**CALCUL DES COÛTS D'EXPRESSION DES CIRCUITS GÉNÉTIQUES SYNTHÉTIQUES // CALCULATING THE EXPRESSION COSTS OF SYNTHETIC GENETIC CIRCUITS**:

- Réf
- **ABG-110948**

**ADUM-46018**
- Sujet de Thèse- 09/02/2023- Université Paris-Saclay GSLife Sciences and Health- Lieu de travail- JOUY EN JOSAS CEDEX - France- Intitulé du sujet- CALCUL DES COÛTS D'EXPRESSION DES CIRCUITS GÉNÉTIQUES SYNTHÉTIQUES // CALCULATING THE EXPRESSION COSTS OF SYNTHETIC GENETIC CIRCUITS- Mots clés- circuits génétiques, circuits génétiques, calcul distribué, modélisation quantitative
- genetic circuits, genetic circuits, genetic circuits, quantitative modelling**Description du sujet**:

- À mesure que la taille et la complexité des circuits génétiques synthétiques augmentent, ils deviennent progressivement trop lourds pour une seule cellule. Par conséquent, de nombreux circuits génétiques de modèles réduits sont facilement perdus par sélection négative lorsque les organismes modifiés sont exposés à des environnements plus stressants. En revanche, les systèmes naturels sont capables de réaliser des programmes beaucoup plus importants en utilisant des mécanismes de régulation complexes pour contrôler les coûts d'expression. Ils y parviennent en combinant le contrôle temporel de l'expression des gènes et la distribution spatiale des fonctions dans les systèmes multicellulaires. Dans ce travail, nous développerons des méthodes expérimentales et théoriques pour mesurer le coût du maintien et de l'exécution des circuits génétiques synthétiques à l'intérieur des cellules. Les modèles quantitatifs seront utilisés pour choisir les architectures de conception les plus économiques (avec le moins de compétition de ressources) pour implémenter un circuit génétique avec une fonction spécifique. Les conceptions de circuits seront étudiées dans différentes conditions de croissance et de stress afin d'évaluer la relation entre les coûts calculés et la stabilité évolutive à long terme des circuits. Ces analyses permettront de déterminer la limite supérieure de la taille des circuits à partir de laquelle il serait plus efficace de les répartir entre plusieurs cellules d'une communauté. Nous prévoyons que les résultats de ce travail auront des implications clés non seulement pour la mise à l'échelle des circuits génétiques synthétiques, mais aussi pour la compréhension des fonctions de l'écosystème dans les communautés microbiennes ou de la division du travail dans les organismes multicellulaires.
As the size and complexity of synthetic genetic circuits increase, they progressively become too burdensome for a single cell. Consequently, many toy-model genetic circuits are easily lost to negative selection when the engineered organisms are exposed to more stressful environments. In contrast, natural systems are able to carry much larger programmes by using complex regulatory mechanisms to keep the costs of expression under check. They do this by a combination of temporal control over gene expression and additionally by spatial distribution of functions in multicellular systems. In this work, we will develop experimental and theoretical methods to measure the cost of maintaining and executing synthetic genetic circuits inside cells. The quantitative models will be used to choose the most economical design architectures (with least resource competition) for implementing a genetic circuit with a specific function. The circuit designs will be studied under different growth and stress conditions to assess the relationship between the calculated costs and the long-term evolutionary stability of the circuits. These analyses will help inform the decision of what is the upper size-limit of the circuits at which it would be more efficient to distribute them across multiple cells in a community. We anticipate the results of this work to have key implications not only for the scale-up of synthetic genetic circuits but also for the understanding of ecosystem functions in microbial communities or division of labour in multicellular organisms.
Début de la thèse : 01/10/2023**Nature du financement**:
**Précisions sur le financement**:

- Contrats ED : Programme blanc GS-LSaH**Présentation établissement et labo d'accueil**:

- Université Paris-Saclay GSLife Sciences and Health**Etablissement délivrant le doctorat**:

- Université Paris-Saclay GSLife Sciences and Health**Ecole doctorale**:

- 577 Structure et Dynamique des Systèmes Vivants- Le doctorant.e aura ou acquerra des compétences en biologie synthétique expérimentale (clonage moléculaire, conception de circuits génétiques, analyse de croissance et de fluorescence, cytométrie en flux), ainsi qu'en modélisation computationnelle (modèles déterministes et stochastiques de circuits génétiques). Pour la partie computationnelle, l'étudiant.e sera assisté par des membres de l'équipe et des collaborateurs externes issus

  • Chargé(e) de projet en agronomie urbaine

    il y a 2 semaines

    Jouy-en-Josas, France Urbasense Temps plein

    Intégrer Urbasense, c'est être acteur d’un projet ambitieux et collaboratif, aux côtés d’une équipe depassionnés ! C'est contribuer à mieux vivre en ville, en l'aidant à accueillir le végétalNous accompagnons des collectivités, des maitrises d’œuvres et d'ouvrages et des entreprises d'espaces vertspour amener leurs...

  • Chargé(e) de projet en agronomie urbaine

    il y a 2 semaines

    Jouy-en-Josas, FR Urbasense Temps plein

    Intégrer Urbasense, c'est être acteur d’un projet ambitieux et collaboratif, aux côtés d’une équipe depassionnés ! C'est contribuer à mieux vivre en ville, en l'aidant à accueillir le végétalNous accompagnons des collectivités, des maitrises d’œuvres et d'ouvrages et des entreprises d'espaces vertspour amener leurs...

  • Chargé(e) de projet en agronomie urbaine

    il y a 1 mois

    Jouy-en-Josas, France Urbasense Temps plein

    Intégrer Urbasense, c'est être acteur d’un projet ambitieux et collaboratif, aux côtés d’une équipe depassionnés ! C'est contribuer à mieux vivre en ville, en l'aidant à accueillir le végétalNous accompagnons des collectivités, des maitrises d’œuvres et d'ouvrages et des entreprises d'espaces vertspour amener leurs végétaux à développer...

  • Contrôleur de Coûts Projet

    il y a 1 mois

    Aix-en-Provence, France Gi Group Temps plein

    À propos de nous Gi Group, marque de Gi Group Holding spécialisée en intérim et recrutement généraliste, recrute pour l'un de ses clients une société qui accompagne depuis plus de 10 ans de grands projets mondiaux d’ingénierie, en apportant à ses clients des solutions pour faire face à leurs enjeux et défis industriels. C’est une filiale en...

  • Chargé(e) de développement entreprises partenaires

    il y a 2 semaines

    Jouy-en-Josas, FR HEC Paris Temps plein

    Dans le cadre d'un remplacement de congé maternité, HEC Paris recrute un/une chargé(e) de développement entreprises partenaires.Au sein de la direction Partenariats Entreprises & Financements Publics, le/la chargé(e) de développement entreprises partenaires accompagne les entreprises partenaires d’HEC Paris et/ou mécènes de la Fondation HEC et...

  • Chargé(e) de développement entreprises partenaires

    il y a 2 semaines

    Jouy-en-Josas, France HEC Paris Temps plein

    Dans le cadre d'un remplacement de congé maternité, HEC Paris recrute un/une chargé(e) de développement entreprises partenaires.Au sein de la direction Partenariats Entreprises & Financements Publics, le/la chargé(e) de développement entreprises partenaires accompagne les entreprises partenaires d’HEC Paris et/ou mécènes de la Fondation HEC et...

  • Responsable Calculs Equipements Complexes H/F

    il y a 3 semaines

    Cherbourg-en-Cotentin, France MICHAEL PAGE Temps plein

    Notre client, entreprise spécialisée dans la chaudronnerie, mécanique et tuyauterie industrielle intervenant dans des secteurs tels que le nucléaire et le naval, recherche un Responsable Calculs pour son site basé à Cherbourg en Normandie.Directement rattaché à la Direction de l'Ingénierie et Services Support, vous aurez en charge la gestion du...

  • Responsable Calculs Equipements Complexes H/F

    il y a 1 mois

    Cherbourg-en-Cotentin, France Michael Page Temps plein

    ArrayDirectement rattaché à la Direction de l'Ingénierie et Services Support, vous aurez en charge la gestion du service calculs, composé de 5 à 6 Ingénieurs Calculs.Ci-dessous, les principales missions qui vous seront confiées :Garantir le coût, les délais et la qualité des calculs encadrés ;Superviser, analyser et vérifier les calculs...

  • Responsable Calculs Equipements Complexes H/F

    il y a 1 mois

    Cherbourg-en-Cotentin, France Page Personnel Temps plein

    Notre client, entreprise spécialisée dans la chaudronnerie, mécanique et tuyauterie industrielle intervenant dans des secteurs tels que le nucléaire et le naval, recherche un Responsable Calculs pour son site basé à Cherbourg en Normandie. Directement rattaché à la Direction de l'Ingénierie et Services Support, vous aurez en charge la gestion du...

  • Ingénieur Calculs Equipements Complexes H/F

    il y a 12 heures

    Cherbourg-en-Cotentin, France MICHAEL PAGE Temps plein

    Notre client, entreprise spécialisée dans la chaudronnerie, mécanique et tuyauterie industrielle intervenant dans des secteurs tels que le nucléaire et le naval, recherche un Ingénieur Calculs pour son site basé à Cherbourg en Normandie.Sous la responsabilité de la Direction de l'Ingénierie et Services Support et en rattachement au Responsable...

  • Ingénieur Calculs Equipements Complexes H/F

    il y a 3 jours

    Cherbourg-en-Cotentin, France Michael Page Temps plein

    ArraySous la responsabilité de la Direction de l'Ingénierie et Services Support et en rattachement au Responsable Calculs, vous serez le garant de la réalisation des calculs de structure ainsi que l'analyse et l'interprétation des résultats obtenus, sur la base des éléments fournis au titre des affaires. Vous optimiserez la conception dans une...

  • Responsable Calculs Equipements Complexes H/F

    il y a 1 mois

    Cherbourg-en-Cotentin, France MICHAEL PAGE Temps plein

    Poste : Directement rattaché à la Direction de l'Ingénierie et Services Support, vous aurez en charge la gestion du service calculs, composé de 5 à 6 Ingénieurs Calculs.Ci-dessous, les principales missions qui vous seront confiées : * Garantir le coût, les délais et la qualité des calculs encadrés ; * Superviser,...

  • Ingénieur Calculs Equipements Complexes H/F

    il y a 5 jours

    Cherbourg-en-Cotentin, France Page Personnel Temps plein

    Notre client, entreprise spécialisée dans la chaudronnerie, mécanique et tuyauterie industrielle intervenant dans des secteurs tels que le nucléaire et le naval, recherche un Ingénieur Calculs pour son site basé à Cherbourg en Normandie.Sous la responsabilité de la Direction de l'Ingénierie et Services Support et en rattachement au Responsable...

  • Ingénieur(e) Calculs mécaniques H/F

    il y a 1 mois

    Aix-en-Provence, France Infodis Temps plein

    Vos responsabilités métier Pour accompagner l'équipe, vous êtes capable de prendre le lead sur tout ou partie des responsabilités métiers suivantes : * Analyse du cahier des charges et recherche des solutions techniques * Validation des données d'entrées * Rédaction des spécifications et contrôle des exigences mécaniques * Réalisation des...

  • Responsables Calculs

    il y a 1 mois

    Cherbourg-en-Cotentin, France ALTRAD INTERNATIONAL Temps plein

    Poste : Directement rattaché(e) à la Direction Qualité et Services Support, vous aurez en charge la gestion du service calculs, composé de 5 à 6 ingénieurs calculs.Ci-dessous, une liste non exhaustive des missions qui vous seront confiées :Garantir le coût, les délais, et la qualité des calculs encadrés ;Superviser,...

  • Ingénieur calculs mécanique H/F

    il y a 4 semaines

    Aix-en-Provence, France Seres Technologies Temps plein

    À propos de nousSERES Technologies est un spécialiste de l’ingénierie et du conseil, filiale du Groupe Gorgé, industriel familial présente dans les hautes technologies et dont les métiers s’organisent autour de trois pôles d’activités : les Systèmes Intelligents de Sûreté (Exail Group), la Protection des Installations à Risques (Vigians et...

  • Ingénieur calcul mécanique H/F

    il y a 1 mois

    Aix-en-Provence, France Infodis Temps plein

    Lieu : Aix en Provence (13)Prétentions salariales : en fonction du profilVos responsabilités métierPour accompagner l'équipe, vous êtes capable de prendre le lead sur tout ou partie des responsabilités métiers suivantes : * Analyse du cahier des charges et recherche des solutions techniques * Validation des données d'entrées * Rédaction des...

  • Ingénieur calcul mécanique H/F

    il y a 1 mois

    Aix-en-Provence, France Fortil Temps plein

    Lieu : Aix en Provence (13) Prétentions salariales : en fonction du profil Vos responsabilités métier Pour accompagner l’équipe, vous êtes capable de prendre le lead sur tout ou partie des responsabilités métiers suivantes : Analyse du cahier des charges et recherche des solutions techniques Validation des données d’entrées ...

  • Risk Manager Et Animateur Réduction Des Coûts

    il y a 4 semaines

    Saint-Quentin-en-Yvelines, France Orano Temps plein

    Orano : donnons toute sa valeur au nucléaire ! Notre expertise unique sur le cycle du combustible nucléaire nous permet de proposer à nos clients des produits et des services à forte valeur ajoutée, depuis les mines, la chimie de l'uranium, l'enrichissement, le recyclage, l'ingénierie, le démantèlement, la logistique, jusqu'au nucléaire...

  • AIDE-SOIGNANTE/AUX. PUER-CDI-TEMPS PLEIN-Jour au 31 Aout 2022

    il y a 4 semaines

    Les Loges-en-Josas, France Centre Pediatrique Des Côtes Temps plein

    LIEU : Centre Pédiatrique des Côtes 9 Chemin des Côtes Montbron - 78350 LES LOGES EN JOSAS à 5 km de Versailles – Véhicule conseillé.PRESENTATION DU CENTRE :Le Centre Pédiatrique des Côtes est un établissement SSR de Cardiologie Infantile et de Pédiatrie Générale de 66 lits composé de 57 lits SSR, 8 lits d’hôpital de jour et d’1 lit de...