Stagiaire - M1 ou M2 - Biologie Des Systèmes

Il y a 3 mois


Villeurbanne, France INRAE Temps plein

**Structure d’accueil**

**Durée**: 3 à 6 mois(avec gratification)/ **Période**: flexible, début de stage entre janvier et mars 2025

**Encadrants**

Co-encadrant : Hubert CHARLES, Professeur des Universités, INSA
Support en bioinformatique : Patrice BAA-PUYOULET, Ingénieur d’Études, INRAE

**Profil souhaité**

**Deux sujets sont proposés, au choix.**

**Sujet 1 - Modélisation métabolique de l’émergence du caractère altruiste chez les bactéries endosymbiotiques.**

Le métabolisme bactérien est majoritairement dédié à convertir des ressources nutritives en biomasse et donc à permettre une croissance optimale de la bactérie. Seule une faible fraction des ressources est utilisée pour produire d’autres composés (métabolites secondaires, co-produits du métabolisme ). Pourtant, chez des bactéries symbiotiques intracellulaires, comme _Buchnera aphidicola_1, symbiote nutritionnel du puceron, une analyse des flux carbonés montre que seule une faible proportion du carbone assimilé est dédiée « égoïstement » à la biomasse bactérienne. La majeure partie de ce carbone est relarguée de manière altruiste pour fournir au puceron des éléments essentiels (vitamines, acides aminés essentiels ou leurs précurseurs) ou des métabolites que le puceron saurait assimiler (acétate, acides du cycle de Krebs). Ce phénomène est contre-intuitif d’un point de vue évolutif et est inexpliqué d’un point de vue quantitatif. La modélisation métabolique quantitative de la bactérie symbiotique _Buchnera aphidicola_ a permis de formuler de nouvelles hypothèses permettant d’expliquer ce comportement altruiste, et de le relier à l’érosion très marquée du génome de la bactérie. Des pistes similaires émergent chez une bactérie symbiotique de l’aleurode, un insecte au mode de vie proche du puceron.

L’étudiant-e aura pour projet d’étudier ces hypothèses en construisant et modélisant des scénarios de réduction métabolique. Comme point de départ, une bactérie aux capacités métaboliques versatiles (_Escherichia coli_) sera utilisée4. L’étudiant-e appliquera à cette bactérie les contraintes qu’une internalisation dans les cellules d’un insecte implique, et analysera de manière quantitative leur impact sur l’émergence d’un comportement altruiste. Le projet de stage comprendra donc : i) une prise en main des modèles métaboliques d’ _Escherichia coli_ et de _Buchnera aphidicola_, ii) une adaptation de celui d’_E. coli _à un environnement intracellulaire, iii) une construction d’un scénario _in silico_ de réduction métabolique, iv) une rédaction et optimisation du code, v) la réalisation des simulations et vi) des analyses statistiques et quantitatives des solutions obtenues.

Le sujet permettra à l’étudiant-e d’acquérir des compétences solides en modélisation métabolique, et des connaissances sur la structure du métabolisme bactérien, précieuses dans de nombreux domaines (biotechnologies, environnement, santé). Le thème abordé est fondamental, mais s’inscrit dans un projet plus large de modélisation des flux à l’interface plante - puceron - symbiote lié à des questions environnementales. Il constitue pour le laboratoire un prérequis pour la modélisation fine de l’interaction puceron - symbiote.

**Sujet 2 - Utilisation de la modélisation métabolique par contraintes pour décrypter les points critiques du métabolisme d’un insecte ravageur**

Les pucerons sont des insectes ravageurs de cultures dont la prolifération est difficile à limiter sans avoir recours aux insecticides. Localisés sur les tiges et les feuilles des plantes, ils se nourrissent de sève phloémienne, et ont leurs besoins nutritionnels complétés par un endosymbiote intracellulaire obligatoire, la bactérie _Buchnera aphidicola_. Ils colonisent ainsi rapidement un champ agricole entier. Nous souhaitons comprendre les mécanismes régissant leurs capacités de croissance et de reproduction exceptionnelles, afin de prédire quels facteurs de la plante et de l’environnement ont le plus d’impact dans le succès de leur colonisation. Afin d’associer les facteurs environnementaux et de la plante à la croissance/reproduction des pucerons, notre approche consiste à reconstruire et exploiter un modèle mathématique simulant les flux matière au sein de l’insecte par FBA (Analyse des Flux à la Balance).

Un premier modèle « cœur », reprenant le métabolisme central du puceron, a été construit par le laboratoire. Ce modèle ne représente que partiellement certaines fonctions du métabolisme du puceron. La ou le stagiaire devra donc compléter ce modèle en modifiant et complétant différentes voies métaboliques du puceron encore non fonctionnelles, comme le métabolisme des acides aminés soufrés, la biosynthèse des lipides et l’utilisation des vitamines. A l’issue de cette première partie, l’étudiant-e pourra alors


  • Stage M2 Recherche/ing

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    il y a 4 semaines


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  • Villeurbanne, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : H/F chercheur en biologie végétal Référence : UMR5557-BEABIG-030 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : VILLEURBANNE Date de publication : lundi 25 novembre 2024 Type de contrat : Chercheur en contrat CDD Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 6 janvier 2025 Quotité de travail :...


  • Villeurbanne, France enssib Temps plein

    PRÉSENTATION - MISSIONS - La Direction de la communication de l'INSA Lyon, service composé de 6 agents, définit et met en œuvre la stratégie globale de communication de l’INSA Lyon en lien avec la stratégie d’établissement « Ambitions 2030 » et les priorités définies par la direction. - Le /la stagiaire devra: - trier les images existantes et...


  • Villeurbanne, France Ergalis Temps plein

    Description de poste: EFFOR ACADAMY, recherche pour son entreprise partenaire sa/son : Apprenti(e) RH. Cette alternance se déroulera dans le cadre de notre formation diplômante reconnue par l’Etat de niveau 7 : Mastère Manager des Ressources Humaines. Vous êtes passionné par la gestion des ressources humaines ? Intégrez notre Master RH, entièrement...

  • Assistant RH

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    Villeurbanne, France SBS Groupe Temps plein

    **Assistante RH (STAGE de 6 mois) H/F** **Lieu**: Lyon, France **Entreprise**: My Sales Academy **Description du poste**: My Sales Academy, une école spécialisée dans la formation en commerce, recherche activement une Assistante RH dynamique et motivée pour rejoindre notre équipe à Lyon. En tant qu'Assistante RH, vous jouerez un rôle crucial dans...


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    **Description de l'entreprise** Vous souhaitez participer à une offre de soin de qualité, œuvrer au service de la santé publique en contribuant à l’efficience de la biologie médicale ? Rejoignez-nous ! Avec un chiffre d'affaires annuel de plus de 6.7 milliards d'euros en 2022, un effectif de 61 000 employés répartis à travers plus de 900...

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    Vous souhaitez donner du **sens à votre travail** en agissant concrètement pour la **transition écologique** des territoires ? Vous avez une **fibre informatique** et souhaitez la mettre au service de collectifs citoyens engagés ? L'Association des Centrales Villageoises recrute un-e **stagiaire** pour développer ses **services informatiques...

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    Villeurbanne, France SBS Groupe Temps plein

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    Villeurbanne, France Groupe Solutions Econ'Home Temps plein

    **Stagiaire saisie de données** Durée de stage : 2 mois Stage conventionné non rémunéré Prise de poste au plus vite Nous sommes actuellement à la recherche d’un stagiaire pour nous accompagner dans la gestion de la saisie et la mise à jour de nos bases de données. **Missions principales**: - Saisir et mettre à jour des données dans notre...

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    Il y a 7 mois


    Villeurbanne, France Auto double commande Temps plein

    Assistant commercial (H/F) Aperçu: Nous recherchons un assistant commercial dynamique et motivé pour rejoindre notre équipe. En tant qu'assistant commercial, vous travaillerez en collaboration avec l'équipe de vente pour atteindre les objectifs de vente et assurer la satisfaction des clients. Nous offrons: - Un environnement de travail stimulant et...

  • Assistant Commercial

    Il y a 7 mois


    Villeurbanne, France SBS Groupe Temps plein

    **Assistant(e) Commercial H/F (STAGE de 6 mois)** **Lieu**: Lyon, France **Entreprise**: My Sales Academy **Description du poste**: My Sales Academy, une école de commerce, en recherche active d'un Assistant Commercial enthousiaste et motivé pour rejoindre notre équipe à Lyon. En tant qu'Assistant Commercial, vous jouerez un rôle essentiel dans le...


  • Villeurbanne, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:Stage **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 4 ou équivalent **Fonction **:Stagiaire de la recherche **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: This internship is an INSA internship, within an Inria Research Team. The Inria research centre in Lyon is the 9th Inria...


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    !! STAGIAIRE SPA PRATICIENNE H/F !! Depuis 2016, RockyPop réinvente les codes de l'hôtellerie en partant d'un constat simple : le bonheur, ça se vit ensemble ! Simplicité, convivialité, partage et créativité sont des valeurs qui vous inspirent ? Et en plus vous avez toujours le sourire ? On est fait pour s'entendre ! On sait que les plus beaux...