Poste Chercheur Cdd

Il y a 2 mois


Strasbourg, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : jeudi 15 février 2024

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Poste chercheur CDD (H/F): repliement du génome 3D et paramutation chez les plants**
Référence : UPR2357-STEGRO-002
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : jeudi 25 janvier 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 mars 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2934€ et 4122€ bruts mensuelle selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Biologie cellulaire, développement, évolution-développement, reproduction

**Missions**:
Chez les plantes, les éléments d’ADN invasifs tels que les transgènes sont régulièrement mal transcrits, voire totalement réprimés transcriptionnellement. L'objectif de ce projet postdoctoral (CDD - 24 mois) est d'étudier comment ces éléments d'ADN invasifs sont reconnus par l'hôte et ensuite ciblés pour être réprimer. Le but final est de comprendre comment les cellules peuvent différencier l'ADN “étranger” et “domicile”. Nos recherches se concentrent sur un phénomène de silencing particulier et génétiquement inductible, appelé paramutation. La paramutation peut être décrite comme un processus épigénétique au cours duquel l'état transcriptionnel d'un locus peut être transmis à un autre. Nous étudierons le début de ce processus « d’infection » épigénétique et viserons à décrypter le mécanisme moléculaire sous-jacent. Pour cela, nous isolerons les tissus dans lesquels la paramutation est la plus susceptible d’être établie et effectuerons un profil approfondi de la chromatine. Une attention particulière sera accordée au repliement tridimensionnel des chromosomes qui, comme le suggèrent les données préliminaires, pourrait jouer un rôle majeur dans l'apparition de la paramutation.

**Activités**:
Nous utiliserons un large éventail d’outils génomiques, de biologie moléculaire, de microscopie et de bioinformatique pour ce projet de recherche. Plus précisément, à l’aide d’une ligne de marqueurs spécifiques aux cellules, le tissu dans lequel la paramutation est initiée sera grossièrement disséqué et les noyaux seront ensuite enrichis à l’aide du “fluorescence assisted nuclei sorting” (FANS). Les noyaux acquis feront l'objet d'un profil approfondi, avec l'évaluation du repliement du génome 3D à l'aide des techniques de Hi-C et SPRITE et de la quantification des ARN (ARNs, ARNnc et ARNm) par séquençage de nouvelle génération. En collaboration avec une ingénieure déjà impliqué dans le projet, le-la postdoctorant-e générera également des lignées transgéniques permettant de developer des outils supplémentaires requis pour ce projet. Le chercheur (H/F) pourra également étudier la nature dynamique d'une caractéristique spécifique de repliement 3D du génome d'Arabidopsis thaliana dans notre tissu d'intérêt. Cela sera réalisé à l'aide d'une technique nouvellement développée similaire à “fluorescent in situ hybridization” (FISH), qui permet non seulement la détection de locus spécifiques, mais également leur imagerie vivante sans protocole d'hybridation laborieux.

**Compétences**:
Les compétences requises comprennent:
Connaissance approfondie de la biologie moléculaire et bonne compréhension de la biologie/épigénétique de la chromatine végétale.
Une expérience antérieure en analyse et en codage de données bioinformatiques serait un plus mais n'est pas obligatoire.
Excellente connaissance de l'anglais, écrit et parlé.
Être prêt-e à s'engager pleinement dans un projet. Une participation intellectuelle critique ainsi que la volonté de mener des expérimentations manuelles exigeantes sont attendues.

**Contexte de travail**:
Nous proposons un poste chercheur (CDD) de 24 mois dans la nouvelle équipe d'organisation du génome 3D sous la direction de Stefan Grob à l'Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP) à Strasbourg. L'IBMP héberge des équipe de recherche excellentes, un large éventail de plateformes de pointe pour soutenir ce projet et offre un environnement convivial et solidaire. Au sein de notre équipe, nous visons à offrir une atmosphère de travail inclusive et motivante, dans laquelle l'initiative et l'apport intellectuel et technique seront très appréciés.



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  • Chercheur (H/F)

    il y a 1 mois


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  • Strasbourg, France CNRS Temps plein

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  • Strasbourg, France Université de Strasbourg Temps plein

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  • Post-doc (H/F)

    il y a 1 mois


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  • Post-doc (H/F)

    il y a 1 mois


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  • Post-doc (H/F)

    il y a 1 mois


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  • Post-doctorat (H/F)

    il y a 1 semaine


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    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 18 juin 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorat (H/F) en traitement du signal et apprentissage automatique** Référence : UMR7039-RICBOR-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : VANDOEUVRE LES NANCY Date de...


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  • Chercheur (H/F)

    il y a 1 mois


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    il y a 2 semaines


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