Bio-informaticien
Il y a 3 mois
**Bio-informaticien**
(CDD avec possibilité de CDI)
**VOTRE MISSION**
**Développer et mettre en œuvre des méthodologies bioinformatiques afin d’analyser les données génomiques, transcriptomiques et protéomiques générées par notre plateforme de pathologie de précision pour le rejet de greffe**. Réaliser des contrôles qualités étendus pour garantir l'exactitude et la fiabilité des données analysées. Travailler au sein d'une équipe de recherche pluridisciplinaire et compétitive, spécialisée dans la transplantation d’organe. Interagir et collaborer avec de nombreux interlocuteurs internationaux.
Dans notre équipe de recherche, la bioinformatique est cruciale afin d’optimiser le diagnostique du rejet de greffe et adapter le suivi du patient. Votre mission sera donc de grande importance pour l’équipe et vous serez un interlocuteur clé pour de nombreux projets.
**NOTRE ÉQUIPE DE RECHERCHE**
Nous sommes une équipe de recherche internationale spécialisée dans la transplantation d’organe, l’intelligence artificielle et la bioinformatique. Notre équipe comprend des néphrologues, cardiologues, pneumologues, hépatologues, épidémiologistes, informaticiens, biologistes, statisticiens, mathématiciens et data scientists.
En collaboration avec de nombreux hôpitaux français et internationaux, nous avons mis en place une plateforme de pathologie de précision pour le rejet de greffe. Notre plateforme est spécialisée dans l'extraction d'acides nucléiques (ADN et ARN) de tous types d'échantillons (FFPE, tissu congelé, plasma, etc.) pour l'analyse du génome et du transcriptome à l'aide de technologies de pointe (NGS, NanoString, Digital spatial profiling, etc.).
Nous avons développé une expertise dans les mesures multiplexées directes de l'expression génique avec des niveaux élevés de précision et de sensibilité, en utilisant des approches NGS pour l'exploration mécanistique ainsi que la technologie Nanostring, développée plus tard comme une plateforme collaborative internationale.
Étant donné l’essor de notre plateforme, en termes de projets, de données et de collaborations, nous souhaitons à présent travailler avec quelqu’un qui saura organiser et analyser en profondeur les données générées par notre plateforme.
**La mission de notre équipe** : Améliorer la quantité et la qualité de vie des receveurs d’organes, en offrant au cliniciens des systèmes de prédiction diagnostiques et pronostiques basés sur l’intelligence artificielle et la bioinformatique, qui optimisent la prise de décision clinique, facilitent les essais cliniques et accélèrent la découverte de nouveaux traitements.
**Notre équipe est localisée à**:
**Centre de recherche cardiovasculaire de Paris, 56 rue Leblanc, 75015, Paris**
**VOS PRINCIPALES ACTIVITÉS**
- Développer et mettre en œuvre des méthodologies bio-informatiques pour l'analyse de données génomiques, transcriptomiques et protéomiques.
- Assurer la réception et l’intégration des données de séquençage reçues de nos partenaires.
- Réaliser des contrôles qualités étendus.
- Développer des approches de transcriptomique spatiale.
- Analyser les données et rédiger des rapports d’analyse.
- Modifier et adapter les méthodologies en fonction des évolutions technologiques.
- Participer de façon active aux présentations des résultats et aux réunions de suivi du projet.
**CONNAISSANCES**
- Connaissance des outils d’analyses NGS pour le RNA-Seq : alignement, comptage, annotation, contrôles qualité, outils statistiques (DESeq2, edgeR).
- Maitrise de R et d’un ou plusieurs autre(s) langage(s) de programmation (bash, perl, python).
- Connaissance des bases en génomique et d’outils dédiés à la visualisation des données de NGS (IGV ).
- Bonne maîtrise de l’anglais oral et écrit (**requis** car notre équipe est internationale).
**CONNAISSANCES** **APPRÉCIÉES**
- Connaissance des analyses fonctionnelles par enrichissement, approches modulaires et analyses de réseaux de gènes.
- Notions en immunologie.
- Notions en transplantation d’organe.
- Pratique du calcul distribué sur cluster.
**COMPÉTENCES**
- Pilotage de projet avec esprit d’équipe
- Animation de réseau
- Aisance rédactionnelle
- Sens de l’organisation
- Capacité d’apprentissage
- Capacité à anticiper les tâches
- Capacité de synthèse
- Respect des échéances
- Réactivité
- Capacité à faire avancer plusieurs projets en parallèle
**EXPÉRIENCE REQUISE**
- Doctorat en bio-informatique, en biologie computationnelle ou domaine annexe
- 3 ans d’expériences professionnelles minimum
**RÉCENTES PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES DE NOTRE ÉQUIPE**
**Kidney international 2024** : _Evaluation of non-invasive biomarkers of kidney allograft rejection in a prospective multicenter unselected cohort study (EU-TRAIN)_
**Nature medicine 2024** : _Cell-free DNA for the detection of kidney allograf
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Datamanager/bio-informaticien Débutant ou Confirmé
Il y a 2 mois
Paris 15e, France Unité de Recherche Clinique - Hôpital Européen Georges Pompidou Temps plein1. CONTEXTE ET SPECIFICITES L’Unité de Recherche Clinique (URC) de l’Hôpital européen Georges-Pompidou (HEGP), sous la responsabilité du Pr Sandrine KATSAHIAN et du Dr Juliette DJADI-PRAT, regroupe une quarantaine de personnes : médecins, chefs de projets, bio-informaticiens, biostatisticiens, datascientist, attachés et techniciens de recherche...
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Ingénieur bio-informaticien en gestion de ressources
il y a 2 semaines
Paris, Île-de-France CNRS Temps pleinDescription du posteL'Institut de Biologie de l'ENS recherche un Ingénieur bio-informaticien pour rejoindre l'équipe de la plateforme informatique. Le candidat sélectionné contribuera à l'exploitation et à la gestion des clusters de calcul pour les équipes du LABEX Memolife. MissionsLes principales missions du candidat seront de:Assurer un support...
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Bio-informaticien Biostatisticien Spécialiste en Analyse de Données
il y a 4 semaines
Paris, Île-de-France MANPOWER FRANCE Temps pleinPoste : Manpower France recherche un Bio-informaticien Biostatisticien H/F à Rennes (35) pour une mission en travail temporaire d'une durée de 1 mois.Objectif du projet : Valider des marqueurs microbiotiques potentiels liés à des pathologies neurologiques à partir de la base de données exclusive.Vos missions :- Analyser des données de séquençage...
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Paris, France CNRS Temps pleinInformations générales Intitulé de l'offre : H/F Ingénieur bio-informaticien en gestion de ressources sur la plateforme de Bio-informatique de l'Institut de Biologie de l'ENS Référence : UMR8197-VALHER-147 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PARIS 05 Date de publication : mardi 5 novembre 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif...
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Paris, France CNRS Temps pleinInformations générales Intitulé de l'offre : H/F Ingénieur bio-informaticien en gestion de ressources sur la plateforme de Bio-informatique de l'Institut de Biologie de l'ENS Référence : UMR8197-VALHER-147 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PARIS 05 Date de publication : mardi 5 novembre 2024 Type de contrat : IT en contrat CDD Durée du...
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Apprenti-e en Bio-informatique
Il y a 5 mois
Paris 14e, France Inserm Temps pleinDescription de poste: Résumé du poste: La personne recrutée aura pour mission de développer un outil d’analyse fonctionnelle innovant dédié aux analyses intégratives transcriptomique-protéomique Responsabilités: - Réalisation d’une base de données d’annotations fonctionnelles - Calcul de métriques relatives aux transcrits et aux...
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Informaticien (H/F)
Il y a 6 mois
Paris, France GROUPE COERYS Temps plein**Rejoindre une équipe dynamique où manger 5 fruits et légumes par jour n'est pas qu'un slogan, ça vous tente ?** Le Groupe COERYS regroupe 9 sociétés spécialisées dans la distribution de produits frais rigoureusement sélectionnés pour assurer une livraison de qualité aux professionnels de la restauration (RHD) et de la distribution (GMS). Au...
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Apprenti(E) Assistant(E) Aux Ressources Humaines
Il y a 5 mois
Paris 15e, France Mademoiselle bio Temps plein_**Contexte**:_ Crée en 2006, Mademoiselle bio est l’enseigne leader de la distribution multicanale de cosmétiques biologiques beauté et bien-être bio. Mademoiselle bio compte aujourd’hui 15 boutiques et un site internet que vous - **Missions et taches**:_ - Gestion de planning - Organiser, alimenter, mettre à jour des bases de données relatives...
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Informaticien Reporting HTML
il y a 4 semaines
Paris, Île-de-France Knowllence Temps pleinPoste : Informaticien Reporting HTMLNous recherchons un informaticien pour créer des rapports et des indicateurs spécifiques à nos clients. Vous serez chargé de l'analyse du besoin client, du paramétrage de notre application, de la création des rapports et indicateurs, ainsi que de leurs validations et tests.Vous devrez avoir une bonne maîtrise du...
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Vendeur Polyvalent en Magasin Bio
Il y a 5 mois
Paris 15e, France La Vie Claire Temps pleinNous recrutons pour notre magasin bio La Vie Claire de Paris 15° un(e) vendeur(se) qui sera amené(e) à : - Accueillir et conseiller la clientèle et s’assurer de la satisfaction des clients - Développer les ventes, assurer l'encaissement des clients avec les membres de votre équipe - Gérer la réception des marchandises et leur mise en rayon (port de...
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Responsable de Magasin Bio
Il y a 6 mois
Paris 15e, France La Vie Claire Temps pleinNous recrutons pour notre magasin bio La Vie Claire Paris 15ème St Charles un(e) responsable de magasin qui sera amené(e) à: En collaboration avec votre Animateur Réseau, vous êtes le garant du bon fonctionnement du point de vente et de l'épanouissement de votre équipe. **Management de l'équipe**: Vous recrutez, animez et organisez le travail de vos...
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Vendeur/euse Polyvalent(E) Fruits Et Légumes Bio
il y a 3 semaines
Paris 15e, France Kantébiologique Temps pleinKantéBioLogique est une petite entreprise située à 75015 Paris 15e. Notre enseigne, Bouillon de Culture, est spécialiste des fruits et légumes bio. Nous proposons des produits issus majoritairement en circuit court à des prix accessibles. Nous recherchons, dès le 22/08/2024, 1 personne enjouée, dynamique et passionnée par les fruits, les légumes...
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Informaticien-cordinateur IT
Il y a 3 mois
Paris, France Maison Médicale Jeanne Garnier Temps plein**LES ÉTABLISSEMENTS JEANNE GARNIER** recrutent UN **INFORMATICIEN -COORDINATEUR IT** (H/F) en CDI à temps plein TELECHARGER L‘OFFRE D’EMPLOI
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Chef de Projet R&D en Immunologie
il y a 2 semaines
Paris, France Bio-Rad Temps pleinSaber Bio (a Bio-Rad company) is looking for an outstanding and highly motivated Scientist-Assay Development on-site in the heart of Paris. In this position, you will lead the development and validation of a diverse range of functional single-cell assays for antibody screening/discovery and T cell therapy using droplet microfluidics. You will collaborate on...
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Chef de Projet R&D en Immunologie
Il y a 2 mois
Paris, France Bio-Rad Temps pleinSaber Bio (a Bio-Rad company) is looking for an outstanding and highly motivated Scientist-Assay Development on-site in the heart of Paris. In this position, you will lead the development and validation of a diverse range of functional single-cell assays for antibody screening/discovery and T cell therapy using droplet microfluidics. You will collaborate on...
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Vendeur Polyvalent en Magasin Bio
Il y a 6 mois
Paris 15e, France La Vie Claire Temps pleinNous recrutons pour notre magasin bio La Vie Claire de Paris 15ème un(e) vendeur(se) qui sera amené(e) à : - Accueillir et conseiller la clientèle et s’assurer de la satisfaction des clients - Développer les ventes, assurer l'encaissement des clients avec les membres de votre équipe - Gérer la réception des marchandises et leur mise en rayon (port...
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Vendeur/vendeuse 35h Magasin Bio Fruits Et Legumes
Il y a 6 mois
Paris 15e, France Relais Producteurs Naturenville Temps pleinNaturenville, avec 10 magasins primeurs BIO et indépendants est une jeune entreprise à taille humaine qui privilégie l'approvisionnement en direct producteurs. **missions**: Nous recrutons un/e vendeur/se pour un de nos magasins. Vos activités principales: - réception et mise en rayon, - contrôle de la qualité des produits, - accueil et conseils...
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Informaticien sécurité
il y a 1 mois
Paris, Île-de-France Crédit Mutuel Temps pleinMissionL'équipe de sécurité des systèmes d'information (SSI) de Euro-Information est chargée de la sécurité du système d'information dédié aux activités d'Asset Management. Nous sommes à la recherche d'un Informaticien sécurité pour rejoindre notre équipe et contribuer à la mise en conformité réglementaire, la...
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Vendeur Magasin Bio Fruits Et Legumes
Il y a 6 mois
Paris 15e, France Relais Producteurs Naturenville Temps pleinNaturenville, avec 10 magasins primeurs BIO et indépendants est une jeune entreprise à taille humaine qui privilégie l'approvisionnement en direct producteurs. **missions**: Nous recrutons un/e vendeur/se pour notre magasin de **l'avenue d'Italie** Vos activités principales: - réception et mise en rayon, - contrôle de la qualité des produits, -...
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Informaticien Spécialisé en Sécurité
il y a 4 semaines
Paris, Île-de-France KPMG Temps pleinVos MissionsEn tant que Informaticien Spécialisé en Sécurité, vous serez chargé de:• Développer et mettre en œuvre des stratégies de sécurité pour protéger les systèmes d'information de KPMG,• Analyser et évaluer les risques de sécurité pour identifier les vulnérabilités et proposer des solutions efficaces,• Collaborer avec les...
