Ingénieur d’études en bioinformatique génomique et multi-omics

il y a 5 jours


Paris, France Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière Temps plein

Ingénieur d’études en bioinformatique génomique et multi-omics (F/H)L’équipe de recherche s’intéresse aux mécanismes moléculaires et cellulaires des épilepsies avec malformations corticales causées par des mutations somatiques (PMID: 38710875, PMID: 36635388, PMID: 31444548). Il s’agit d’une équipe multidisciplinaire alliant la bio-informatique, la génétique, et l’établissement de modèles de la maladie in vitro et in vivo.Objectif principal du projet : Élucider les bases moléculaires et cellulaires des malformations corticales associées à l'épilepsie.Méthodologie :Détection de variants somatiques à partir de données de séquençage de l'exome (WES) et du génome (WGS) sur tissusAnalyse bioinformatique de données de séquençage d'ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatialeMISSIONS PRINCIPALESEn tant qu'ingénieur(e) de recherche, vous serez chargé(e) de:Réaliser le calling des variants somatiques sur des données de génomes en short et long readsAnalyser la distribution de la fréquence allélique des variants (VAF) et effectuer du lignage cellulaire (lineage tracing)Analyser les données de séquençage d'ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatialeIntégrer les différents types de données (génomiques et transcriptomiques)Présenter les résultats lors des réunions d'équipe et des congrès scientifiquesParticiper à la rédaction de rapports scientifiques et de publicationsMaster en bioinformatique (avec expérience) ou PhD en bioinformatique/génomiqueSolide expérience en bioinformatique génomiqueMaster en bioinformatique (avec expérience) ou PhD en bioinformatique/génomiqueSolide expérience en bioinformatique génomiqueSavoir-faireMaîtrise des langages de programmation pertinents (ex : Python, R)Expérience dans l'analyse de données de séquençage à haut débit (WGS, RNA-seq)Connaissance des approches d'analyse en cellule unique et de transcriptomique spatiale.Maîtrise de l'anglais scientifique (oral et écrit).Savoir-êtreCapacité à travailler de manière autonome et organiséeFaire preuve d’une rigueur scientifiqueAisance relationnelle et à interagir avec les membres de l’équipeCuriosité scientifique et capacité d'adaptation à de nouvelles technologiesL’Institut du cerveau s’engage pour lutter contre toute forme de discrimination. Nous garantissons un environnement de travail inclusif et respectueux de toutes les diversités.https://institutducerveau-icm.org/en/Institut du CerveauHôpital de la Pitié-Salpêtrière47, boulevard de l'Hôpital75013 Paris #J-18808-Ljbffr



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    Inovarion, créé en 2013, est un centre de Recherche et d’Innovation en Sciences du Vivant, collaborant avec les principaux centres de recherche publics et privés. En 12 ans, Inovarion est devenu un acteur clé de cet écosystème, à travers les prestations réalisées et sa contribution à faire progresser les connaissances scientifiques dans de...


  • Paris, Île-de-France Inovarion Temps plein

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  • Paris 13 Gobelins, Île-de-France Choisir le Service Public Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement CNRS   Référence UMR7592-ZOUZAD-009   Date de début de diffusion /12/2025 Date de parution /12/2025 Date de fin de diffusion /01/2026 VersantFonction Publique de l'Etat CatégorieCatégorie A (cadre) Nature de l'emploiEmploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / MétierRecherche -...


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    Le/la candidat·e sera recruté.e dans le cadre d’un projet financé par la Fondation pour la Recherche Médicale visant à caractériser l’origine évolutive des maladies génétiques complexes humaines à partir de données génomiques anciennes et modernes. Il ou elle sera chargé·e de l’acquisition, du traitement, de l’organisation et de la...


  • Paris 15e, France Institut Pasteur Temps plein

    **Métier**: Bio info / biostat - Ingénieur de recherche (Bio info / biostat) **Intitulé du poste**: Bioinformaticien génomique virale - CDD - H/F **Missions/Activités**: L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans. Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans...


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    Un institut de recherche biomédicale à Paris recherche un Ingénieur Bioinformatique pour développer des outils d'intelligence artificielle pour l'analyse de données unicellulaires. Le candidat idéal aura des compétences solides en Python et une expérience en apprentissage automatique. Ce poste offre un environnement de travail inclusif et...


  • Paris 13ème, France JobiJoba FR S2 Temps plein

    Nous recrutons un.e postdoctorant.e pour étudier l’origine évolutive des maladies génétiques complexes humaines, dans le cadre d’un projet financé par la Fondation pour la Recherche Médicale jusqu’au 31 janvier 2029. La personne recrutée exploitera des génomes anciens ainsi que des résultats d’études d’association pangénomique (GWAS)...


  • Paris, France JobiJoba FR S2 Temps plein

    Les missions qui incomberont à la personne recrutée seront d’analyser les résultats obtenus précédemment par une étudiante. Ces résultats portent notamment sur l’analyse de la locomotion des souris et sur la différence d’expression génique entre des animaux avec et sans traitement. Activités analyses bioinformatiques de données de RNA...


  • Paris 15e, France Collecteur analyseur des données de médecine génomique Temps plein

    Coordonner les efforts de collecte et d’exploitation de données de l’entrepôt de données de santé (EDS) du CAD. Les données concernent des domaines aussi variés que des informations biologiques, moléculaires (génomique, épigénomique, multi-omics) administratives (SNDS) et cliniques (différentes spécialités médicales, oncologies, maladies...


  • Paris, Île-de-France Dgafp Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement Siège de l'AP-HP   Référence APHP_ Date de début de diffusion /04/2025 Date de parution /12/2025 Nature de l'emploiEmploi ouvert aux titulaires et aux contractuels Domaine / MétierNumérique - Cheffe / Chef de projet maitrise d'œuvre SI Intitulé du posteIngénieur Bioinformatique et...