CDD Ingénieur de recherche en neuroimagerie

Intitulé du poste : CDD Ingénieur de recherche en neuroimagerieType de structure : Chef de projet production (analyse d’image et base de données) dans le cadre de projets multicentriques en neuroimagerie.Contexte et missionLa plateforme CATI (Centre pour l’Acquisition et le Traitement des Images), dédiée à l’harmonisation et à l’analyse des données de neuroimagerie dans le cadre de projets multicentriques de recherche clinique, a été créée début 2011 dans le cadre du plan Alzheimer. Le démarrage de cette plateforme s’est appuyé sur une grande variété d’expertises provenant de plusieurs équipes de recherche, à Neurospin (CEA, INRIA), à l’Institut du Cerveau (ICM - CNRS, SU, ICM, INRIA) et au Laboratoire d’Imagerie Biomédicale (LIB - SU, Inserm, CNRS). Elle s’appuie aujourd’hui sur un réseau national d’une soixantaine de services d’imagerie (IRM, TEP et TEMP) auquel s’ajoutent une dizaine de centres à l’étranger. Une trentaine de projets de recherche font aujourd’hui appel à ses services, qui s’étendent du design et l’implémentation de protocoles d’acquisition jusqu’à la mise à disposition des données acquises et des résultats d’analyses sur un serveur web sécurisé. Les acquisitions réalisées dans le cadre des projets de recherche sont collectées grâce à une solution sécurisée pour être analysées de manière centralisée à l’ICM, Neurospin et au LIB. Ces analyses sont effectuées avec un niveau de qualité élevé grâce à une organisation systématisée de leur production à partir de logiciels de référence, dont certains ont initialement été conçus au sein des équipes de recherche à l’origine du CATI.Un poste de chef de projet en CDD est à pourvoir à Paris à l’ICM au sein de l’équipe CATI. Le/la candidat/e sera chargé/e des missions suivantes :Activités en gestion de projet “production”Coordonner la planification des traitements d’image selon les contraintes des études.Coordonner l’intégration des données collectées et des résultats des analyses dans le flux interne CATI en assurant leur cohérence.Coordonner la réalisation des missions du CATI pour certaines études (suivi des traitements, communication, cohérence des données, mise à disposition…).Participer à la rédaction et/ou maintenance des procédures liées à la production (analyses et leur contrôle qualité, flux interne et mise à disposition).Participer à l’identification de nouveaux besoins selon les demandes utilisateurs et aux discussions avec les utilisateurs lors de la définition des besoins.Activités en productionParticiper au contrôle qualité des données de neuroimagerie (IRM et/ou TEP/TEMP) collectées dans la plateforme logicielle dédiée.Prendre en charge la réalisation des traitements et leur contrôle qualité dans l’environnement logiciel unifié.Activités en R&DAssurer le fonctionnement et la validité des chaînes de traitements et participer à leur amélioration éventuelle ; coordonner le passage en production de ces améliorations.Participer au développement de nouvelles approches de contrôle qualité (données ou résultats) dans l’environnement CATI et à leur validation.Participer à la veille bibliographique sur les méthodes d’analyses implémentées ou à ajouter à l’offre CATI, et éventuellement participer à leur implémentation dans l’environnement unifié du CATI.Mener des missions d’analyse et de suivi global de la qualité des données et des résultats de certaines chaînes de traitements.Aspects pratiquesDes déplacements réguliers à Neurospin (91) sont à envisager.Un jour de télétravail hebdomadaire peut être envisagé.CDD de 12 mois, renouvelable, salaire selon expérience.Lieu : Institut du Cerveau ICM, hôpital Pitié Salpêtrière, Paris (13)Rémunération :Diplômes requis : Titulaires d’un diplôme de niveau bac +5 ou plus en bio informatique, imagerie médicale ou neurosciences.Une première expérience dans le domaine est souhaitable.Compétences requises : Connaissances et expérience en traitement de données en (neuro)imagerie.Une connaissance en programmation informatique serait un plus (langage Python).Expérience dans le traitement de données (dans un environnement Linux, si possible).Maîtrise de techniques / d’outils de gestion de projet.Maîtrise des outils de bureautique.Maîtrise de l’anglais technique à l’écrit et à l’oral.Contact : Marie CHUPIN : marie.chupin@upmc.fr / Emmanuelle GOURIEUX : emmanuelle.gourieux@icm-institute.org #J-18808-Ljbffr