CDD d'ingénieur d'étude/recherche en bioinformatique d'1 an

CDD d'ingénieur d'étude/recherche en bioinformatique d'1 an Le centre Inria de l'Université de Rennes est l'un des huit centres d’Inria et compte plus d'une trentaine d’équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le domaine des sciences numériques. Il est au cœur d'un riche écosystème de R&D et d’innovation : PME fortement innovantes, grands groupes industriels, pôles de compétitivité, acteurs de la recherche et de l’enseignement supérieur, laboratoires d'excellence, institut de recherche technologique. Inria recrute en CDD de 12 mois un·e ingénieur⋅e support et développement en bio-informatique pour le consortium VidjilNet, afin d’assister les structures hospitalières ayant choisi de travailler avec le logiciel Vidjil pour l’analyse bio-informatique des données de séquençage. Définition du poste et du service Le projet Vidjil est une plateforme logicielle qui traite les données de séquençage haut‑débit dans le cadre de l’analyse de répertoire immunitaire et plus particulièrement dans le diagnostic et le suivi des leucémies. La plateforme a deux versants, l'un en recherche bioinformatique, l'autre en routine hospitalière. Elle est déjà utilisée en routine hospitalière par plus d'une trentaine d’équipes à travers le monde. Composants de la plateforme Algorithme : pièce centrale du projet, il permet d'analyser les données de séquençage pour en tirer des informations structurées sur le répertoire immunogénétique. Serveur : il permet de manipuler les données, de les charger et les organiser, ainsi que de lancer des pipelines d'analyses bioinformatiques prédéfinis. Client : une page de visualisation interactive permettant aux cliniciens d'explorer les données pour poser un diagnostic. Le projet rentre en phase d'incubation pour la création d'une startup qui devrait être lancée en fin d'année 2026. Dans le cadre de ce contrat d'un an, l'ingénieur⋅e aura la charge d'assurer le support de premier niveau auprès des utilisateurs, jusqu'à la création de la startup qui assurera ensuite ces missions. En sus du support de premier niveau, l'ingénieur⋅e prendra en charge les évolutions du logiciel (principalement sur les aspects clients et potentiellement sur les aspects algorithmiques) prévues sur les prochains mois par le comité scientifique et technique du consortium VidjilNet. L'employeur sera l'Inria et sera localisé au centre Inria de l’université de Rennes, sur le campus de Beaulieu. Le contrat sera effectué au sein de l'équipe porteuse du projet de startup composée d'un bioinformaticien et d'un ingénieur logiciel. Salaire à définir selon ancienneté et compétence. Perspectives La startup en cours de montage est susceptible de proposer un poste pour un⋅e ingénieur⋅e en bioinformatique en 2027. Responsabilités Participer aux développements sur le logiciel, en fonction des priorités définies sur la feuille de route du consortium. Fournir un support de premier niveau, intervenir sur les dysfonctionnements. Rendre compte régulièrement du travail entrepris et prévu auprès de ses responsables. Coordonner ses interventions avec les autres personnels travaillant pour le consortium VidjilNet. Contribuer à la promotion du consortium VidjilNet. Animation de réunions et séminaires d'échanges avec la communauté. Apporter un support en bioinformatique aux utilisateurs de vidjil. Compétences recherchées Compétences techniques attendues Maîtriser les langages Python, JavaScript, bash. Avoir une expérience de git. Expériences sur le traitement des données de séquençage à haut débit. Connaissances en algorithmique des séquences. Capacités personnelles Diplôme souhaité : M2 bio-informatique ou PhD. Envie de travailler en équipe, d'échanger avec de nombreuses équipes différentes. Capacité à communiquer avec des non‑spécialistes. Sens de l’organisation, rigueur, esprit critique. Capacité à assurer un reporting clair et régulier. Maîtrise de l’anglais scientifique, à l’oral comme à l’écrit. Compétences complémentaires Compétences dans les langages ou technologies : C++, GitLab-CI, Docker. Une expérience d’au moins 2 ans serait un plus. Expérience en immunologie. Expérience en santé. Avantages Restauration subventionnée. Transports publics remboursés partiellement. Congés : 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement). Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail. Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.). Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria). Merci de déposer votre CV et lettre de motivation en ligne. #J-18808-Ljbffr