Ingénieur bioinformaticien en analyse de transcriptome

il y a 15 heures

GifsurYvette, France France Travail Temps plein

Offre - Ingénieur bioinformaticien en analyse de transcriptome (H/F)Missions et activitésAnalyse de données de transcriptome et de traductome et mise en place d'une ressource en ligne pour la recherche en immunologie.ActivitésMettre en place des pipelines Unix d'analyse de données NGSComparer des données transcriptome/traductome de différents tissusAssurer le respect des principes FAIR des procédures informatiquesDéployer et assurer la maintenance de services bioinformatiques en ligne sur différentes plateformes (cluster local, cloud, serveurs web)CompétencesConnaissance des outils et concepts utilisés en analyse NGS (genome/transcriptome/proteome)Maîtrise des langages Python et RMaîtrise d'au moins un gestionnaire de workflowProduction de conteneurs Linux (Docker, Singularity)Bonne pratique de la maintenance de code et de la gestion de versionsAnglais niveau B1Sens du relationnel et de la communicationCuriosité, dynamismeCapacité à gérer de nombreuses interactions et à travailler sur des projets variésContexte de travailContexte de travail: Dans le cadre d'un projet financé par l'Agence de Recherche sur le Cancer (ARC) avec l'institut Curie et l'INSERM, nous étudions le transcriptome et le traductome de l'épithélium thymique. L'ingénieur·e en bioinformatique sera en charge du traitement et de l'analyse des données NGS générées et appliquera des méthodes d'analyse sans référence pour identifier la diversité des antigènes produits par ce tissu, puis les comparer à celle d'autres tissus normaux. Ces données seront mises à disposition via un service web.Contraintes et risquesTravail sur poste informatiqueEntité/LocalisationL'I2BC est un grand institut de biologie moléculaire et cellulaire situé à Gif-sur-Yvette, à 25 km de Paris. L'équipe de Biologie computationnelle des génomes fait partie du département de Biologie des Génomes. Environnement riche: forums de discussion, séminaires et formations en bioinformatique, plateforme bioinformatique et centre de calcul de haute performance.Informations contractuellesType de contrat : CDD — 16 moisDurée du travail : 38h50/semaineTravail en journéeSalaire brut mensuel : 2571,0 € à 2742,0 € sur 12 moisRestaurationIndemnité transportsRémunération selon expérience : entre 2571 et 2742 euros bruts mensuelsProfil souhaitéExpérienceDébutant acceptéCompétencesAnalyser des résultats d'exploitation bio-informatiquesLangages de programmation informatiqueRendre compte de son activitéSavoir-faire professionnelsFaire preuve de curiosité, d'ouverture d'espritFaire preuve de rigueur et de précisionInformations complémentairesSecteur d'activité : Recherche-développement en sciences humaines et socialesD'autres offres peuvent vous intéresser : #J-18808-Ljbffr

  • Ingénieur Bioinformatique — Analyse de Transcriptome

    il y a 17 heures

    Gif-sur-Yvette, France France Travail Temps plein

    Un institut de recherche en biologie à Gif-sur-Yvette recherche un ingénieur bioinformaticien pour analyser des données de transcriptome et mettre en place une ressource pour la recherche en immunologie. Le candidat idéal aura une connaissance des outils NGS, maîtrisera Python et R, et sera curieux, dynamique, avec des capacités en communication. Ce...

  • Ingénieur bioinformaticien en analyse de transcriptome et de traductome

    il y a 1 semaine

    Gif-sur-Yvette, Île-de-France Choisir le Service Public Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement CNRS   Référence UMR9198-DANGAU-010   Date de début de diffusion /01/2026 Date de parution /01/2026 Date de fin de diffusion /02/2026 VersantFonction Publique de l'Etat CatégorieCatégorie A (cadre) Nature de l'emploiEmploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / MétierRecherche -...

  • Ingénieur bioinformaticien en analyse de transcriptome et de traductome

    il y a 2 semaines

    Gif-sur-Yvette, France JobiJoba FR S2 Temps plein

    Analyse de données de transcriptome et de traductome et mise en place d'une ressource en ligne pour la recherche en immunologie. Activités - Mettre en place des pipelines Unix d'analyse de données NGS - Comparer des données transcriptome/traductome de différents tissus - Assurer le respect des principes FAIR des procédures informatiques - Déployer et...

  • Ingénieur détudes en biologie moléculaire et cellulaire

    il y a 17 heures

    Gif-sur-Yvette, France Inserm France Temps plein

    OverviewL’U1280 fait partie de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), qui regroupe environ 55 équipes et des plateformes technologiques de la plus haute qualité. Les principaux axes de recherche de l’I2BC sont :Architecture et dynamique des structures cellulaires, et pathologies associéesTraitement de l’information génétique...

  • Analyse de l'écosystème de l'industrie des batteries en Europe par le prisme de la théorie économiqu H/F

    il y a 1 semaine

    Gif-sur-Yvette, Île-de-France CEA Temps plein

    Informations générales Entité de rattachement Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un...

  • Ingénieur Delivery

    il y a 2 semaines

    Gif-sur-Yvette, Île-de-France AdvanThink (ISoft) Temps plein

    Nous cherchons notre futur.e Ingénieur Delivery & Paramétrage – Intégration Client H/F pour renforcer notre équipe Delivery Au sein de cette équipe tu auras les missions suivantes:Compréhension de l'architecture de notre outil : Acquérir une connaissance approfondie de notre solution et de ses spécificités techniques.Analyse des besoins clients ...

  • Développement d'analyse numérique et caractérisation de biocapteurs fibrés. H/F

    il y a 24 heures

    Gif-sur-Yvette, Île-de-France CEA Temps plein

    Informations générales Entité de rattachement Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un...

  • Analyse physique de simulation d'interaction fluide-structure d'un assemblage nucléaire H/F

    il y a 2 semaines

    Gif-sur-Yvette, Île-de-France CEA Temps plein

    Informations générales Entité de rattachement Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un...

  • Ingénieur Sécurité d'Installations H/F

    il y a 6 jours

    Gif-sur-Yvette, Île-de-France CEA Temps plein

    Informations générales Entité de rattachement Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un...

  • Ingénieur développement logiciel pour contrôle caméra Tcherenkov – H/F

    il y a 2 semaines

    Gif-sur-Yvette, Île-de-France CEA Temps plein

    Informations générales Entité de rattachement Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un...