Ingénieur bioinformaticien en analyse de microbiomes

il y a 7 jours


Évry, Île-de-France SFBI Temps plein
Poste d'Ingénieur bioinformaticien

Le CEA Genoscope UMR8030 recherche un Ingénieur bioinformaticien pour rejoindre son équipe de recherche en analyse de microbiomes.

Compétences requises
  • Maîtrise des outils logiciels standards et formats de données en génomique
  • Connaissance des gestionnaires de workflow courants en bioinformatique (nextflow, snakemake)
  • Compréhension de l'anglais oral et écrit
  • Capacité à travailler en mode projet et en équipe
Responsabilités
  • Inventorier, développer et déployer des outils, workflows et bases de données dans le catalogue de ressources IFB pour le traitement de données métagénomiques microbiennes
  • Identifier les cas d'usage d'applications spécifiques et participer à leur déploiement sur les ressources de calcul HPC/AI du projet
  • Contribuer à l'état de l'art des bases de données, méthodes, et outils nécessaires ou indispensables au traitement et à l'analyse des données métagénomiques d'écosystèmes microbiens
Conditions d'emploi
  • Diplômé(e) (Bac+5) en bioinformatique ou informatique
  • Maîtrise de l'environnement Linux, des langages (shell, python, R) et de l'utilisation de clusters de calcul

Le poste est ouvert pour les candidats souhaitant rejoindre une équipe de recherche dynamique et innovante. L'expérience dans le domaine de la bioinformatique et de l'analyse de données est un atout.



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