Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique
il y a 4 semaines
Description de l'offre
L'offre consiste à développer de nouvelles fonctionnalités pour un pipeline de typage par le séquençage de peptides, utilisé dans des applications en protéomique microbienne et métaprotéomique. Le projet vise à tester de nouveaux concepts, les intégrer et valider les performances.
Sous l'encadrement d'un ingénieur de recherche senior en informatique-bioinformatique, le candidat aura à développer de nouvelles fonctionnalités, évaluer les performances comparées des processus existants et des nouvelles options possibles (DIA, denovo, IA...), avant intégration et tester les performances finales.
Les missions principales du poste incluront de :
- tester et intégrer divers outils récents de mises en correspondance spectres MS/MS – séquence de peptides (DDA, DIA, de novo...) dans le process global de protéotypage, dans une démarche de simplification et optimisation
- sélectionner et appliquer des méthodes de classification ou de régression par IA (PyTorch, sélection de features, modèles...)
- optimiser les bases de données d'organismes utilisées pour un compromis couverture / rapidité / empreinte mémoire, en intégrant les nouveaux séquençages d'organismes (isolats, MAGs, SAGs ...)
- définir, mettre en œuvre et valider un estimateur de confiance global (Python, R)
Profil du candidat
Votre profil :
Formation : niveau Master 2 débutant
Compétences : Compétences en développement/rationalisation de code Python, compétences ou intérêt pour les méthodes de classification/régression IA, connaissances SQL
Pour postuler :
Contacter Olivier Pible avec CV détaillé, notes obtenues lors de votre formation, lettre de motivation, référents et si possible lettre de recommandation
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Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreL'offre consiste à développer de nouvelles fonctionnalités pour la plateforme ProGénoMix, une plateforme mondialement reconnue en protéomique microbienne et métaprotéomique. Le candidat aura à intégrer de nouveaux outils de mises en correspondance spectres MS/MS – séquence de peptides et à sélectionner et appliquer...
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Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique
il y a 2 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinPrésentation du projetL'objectif de ce projet est de développer un pipeline d'analyse de données biomédicales permettant de caractériser les échantillons inconnus. Ce projet s'inscrit dans le cadre des activités innovantes du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D).Compétences requisesPour réussir ce projet,...
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Ingénieur de développement en informatique pour Li2D
il y a 3 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreL'offre est axée sur le développement d'applications innovantes dans le domaine de la détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse au Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet consiste à améliorer le pipeline existant de typage par séquençage de peptides,...
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Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription du ProjetL'offre est liée à la plateforme ProGénoMix, une solution mondiale reconnue en protéomique microbienne et métaprotéomique. Le projet vise à améliorer le pipeline existant, écrit en Python, permettant la caractérisation taxonomique et fonctionnelle d'échantillons inconnus.Vous travaillerez sous l'encadrement...
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Ingénieur en développement informatique
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinPrésentation du posteFonction : Ingénieur en développement informatiqueCe poste est rattaché au Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D), une unité du CEA, et est placé sous l'encadrement d'un ingénieur de recherche senior en informatique-bioinformatique.Objectifs du projetLe projet consiste à développer de...
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Ingénieur Informatique Industrielle H/F
il y a 1 mois
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France ASSYSTEM Temps pleinPrésentation du posteSous la responsabilité d'Estelle, en charge de la coordination technique des projets en informatique industrielle, vous intégrez une équipe hautement impliquée dans les transformations de ce domaine dynamique.Vous êtes au cœur de projets variés et stimulants, que ce soit pour lancer de nouvelles initiatives ou pour moderniser...
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Ingénieur Études Développement
il y a 2 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Ortec Engineering Temps pleinEntretien d'EmbaucheDans le cadre de notre développement, nous sommes à la recherche d'un Ingénieur Études Développement pour rejoindre notre équipe.Nous sommes une société spécialisée dans les activités d'ingénierie d'études multidisciplinaires, d'assistance à maîtrise d'ouvrage et d'appuis sur projets, d'ingénierie...
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Ingénieur Contrôle Commande
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Capgemini Temps pleinCapgemini Engineering :Leader mondial des services d'ingénierie, Capgemini Engineering accompagne les entreprises les plus innovantes dans le monde à libérer leur potentiel. Nous rassemblons des équipes d'ingénieurs, de scientifiques et d'architectes pour fournir des services uniques de R&D et d'ingénierie dans tous les secteurs d'activité.Vos...
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Ingénieur Contrôle Commande
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Capgemini Temps pleinCapgemini Engineering :Leader mondial des services d'ingénierie, Capgemini Engineering rassemble des équipes d'ingénieurs, de scientifiques et d'architectes pour aider les entreprises les plus innovantes dans le monde à libérer leur potentiel. Des voitures autonomes aux robots qui sauvent des vies, nos experts en technologies digitales et logicielles...
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Ingénieur Automatisme et Supervision
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France ASSYSTEM Temps pleinPoste d'Ingénieur Automatisme et SupervisionVous rejoignez l'équipe d'Assystem, spécialisée dans l'automatisme industriel, en tant qu'Ingénieur Automatisme et Supervision. Vos missions seront variées et stimulantes, allant de la mise en œuvre d'imagerie de surveillance à la participation à l'élaboration de programmes...
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Ingénieur en Automatisme et Supervision H/F
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Assystem Temps pleinDescription du PosteVous rejoignez l'équipe d'Assystem, spécialisée dans les transformations de l'informatique industrielle, en tant qu'ingénieur en automatisme et supervision.Vous serez chargé de la coordination technique des projets, en travaillant étroitement avec l'équipe de coordination technique.Vous aurez la responsabilité...
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Ingénieur Projet Spécialiste Développement
il y a 1 semaine
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDécouvrez un nouveau défiNous recherchons un Ingénieur Projet pour rejoindre notre équipe de développement et travailler sur des projets d'ampleur dans le domaine électrique et contrôle commande.Missions clésSuivi de travaux et de marchés de démantèlement et/ou de jouvence de l'installation APMRéalisation d'études, passation de marchés et...
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Ingénieur-chercheur en informatique scientifique Junior
il y a 2 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinOffre de stage en recherche et développement Rejoignez l'équipe du CEA et enrichissez vos compétences dans le domaine du nucléaire. Nous sommes à la recherche d'un stagiaire motivé et curieux pour rejoindre notre équipe de recherche et développement. L'objectif de ce stage est de développer un modèle d'intelligence...
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Ingénieur Systèmes et Réseaux
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Capgemini Temps pleinMissions de l'Ingénieur Systèmes et RéseauxL'Ingénieur Systèmes et Réseaux est responsable de l'administration et du développement des systèmes et réseaux de l'entreprise. Ses missions principales sont les suivantes :Administration des systèmes : assurer la maintenance et la mise à jour des systèmes et réseaux.Développement des...
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Ingénieur Projet Spécialisé en Infrastructures Générales
il y a 4 jours
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinRéseaux d'emplois dans le domaine du génie civil Rejoignez le CEA, un groupe métier technique en forte croissance, où vous intégrerez un service chargé de la réalisation d'affaires dans le domaine du génie civil. En tant qu'ingénieur en génie civil, vous aurez pour mission de : • Piloter la définition des besoins et les phases...
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Ingénieur en automatismes et sécurité de systèmes
il y a 3 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDéscription de l'offreEn tant qu'ingénieur en automatismes et sécurité de systèmes, vous êtes responsable de la maintenance et du développement de systèmes d'automatisation et de sécurité pour l'installation Atalante.Vos missions comprennent notamment :Le pilotage et le suivi de projets associés aux besoins d'évolution de procédés de R&D en...
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Ingénieur Automatisme et Supervision
il y a 3 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Assystem Temps pleinPrésentation du PosteVous rejoignez notre équipe d'ingénieurs en automatismeEn tant qu'ingénieur en automatisme, vous serez chargé de mettre en œuvre des solutions d'automatisation pour nos clients. Vous travaillerez en binôme avec un ingénieur confirmé pour concevoir, développer et mettre en œuvre des programmes...
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Ingénieur Automatisme et Supervision
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Assystem Temps pleinPoste : Ingénieur Automatisme et SupervisionVotre rôleVous rejoignez l'équipe d'Assystem en tant qu'ingénieur automatisme et supervision. Vous travaillerez en binôme avec un ingénieur confirmé pour mettre en œuvre des projets variés dans les secteurs nucléaires, pharmaceutique et tertiaire.Vos missionsMettre en œuvre une partie de...
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Ingénieur mécanique de conception
il y a 4 semaines
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France SOM Aix-en-Provence Temps pleinMission Nous recherchons un ingénieur mécanique pour rejoindre notre équipe de conception de machines et systèmes mécaniques. Vous serez chargé de la conception 3D (Solidworks) des équipements mécaniques nécessaires, de leur prédimensionnement, vérification plans guides ou de réalisation, nomenclatures, rédaction de notes descriptives. Vous...
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Ingénieur Contrôle-Commande
il y a 1 mois
Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps pleinDescription de l'offreEn tant qu'ingénieur contrôle-commande / informatique industrielle, vous êtes chargé de la maintenance et de la mise en œuvre de systèmes de contrôle-commande complexes dans un environnement industriel.Vos missions comprennent notamment :Le pilotage et le suivi de projets associés aux besoins d'évolution de...