Ingénieur d'études en bioinformatique

il y a 5 jours


Bordeaux, Nouvelle-Aquitaine, France CNRS Temps plein
Ingénieur d'études en bioinformatique

L'équipe de l'UMR 5095 du CNRS recherche un ingénieur d'études en bioinformatique pour rejoindre son équipe de biologie computationnelle et bioinformatique. Le candidat idéal sera un spécialiste en analyse de données single cell et en intégration de données omiques.

Responsabilités
  • Concevoir et développer des pipelines d'analyse de données biologiques
  • Assurer et organiser la veille scientifique et technologique en ce qui concerne l'analyse de données single cell et l'intégration de données omiques
  • Travailler en collaboration avec les équipes productrices de données pour développer des méthodes d'intégration de données et les appliquer aux jeux de données disponibles
  • Concevoir des développements technologiques mutualisés et innovants en relation avec les projets des partenaires biologistes
Compétences requises
  • Maîtrise de la programmation en R et/ou Python
  • Connaissance de logiciels requis pour l'analyse de données génomiques et transcriptomiques (STAR, DeSeq2, CellRanger)
  • Maîtrise de l'anglais scientifique écrit et oral
  • Compréhension des méthodes d'analyse de données multidimensionnelles (ACP, t-SNE, UMAP, apprentissage statistique, etc.)
  • Expérience en bioinformatique appliquée aux données génomiques ou transcriptomiques
Formation requise
  • Diplôme de Master ou école d'ingénieur en bioinformatique, biostatistiques ou biologie

L'ingénieur d'études travaillera dans l'équipe de biologie computationnelle et bioinformatique (IBGC UMR CNRS 5095, Bordeaux) sous la supervision de Macha Nikolski. Une forte collaboration est attendue avec les équipes productrices de données.



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