Ingénieur de recherche en analyse de forme de microstructure pour les faisceaux de matière blanche

il y a 1 mois


Rennes, Bretagne, France INRIA Temps plein
Contexte et objectifs du projet

L'imagerie par résonance magnétique (IRM) et en particulier l'IRM de diffusion (IRMd) fournissent des informations détaillées sur l'organisation macroscopique des faisceaux de matière blanche (WM) du cerveau (voir la figure). La méthode appelée fibre tractographie fournit également des informations sur la géométrie des fibres. Pour compléter ces informations, l'IRMd est sensible à la structure microscopique du tissu et à ses altérations en cas de pathologie. L'analyse conjointe des faisceaux de matière blanche et de leur organisation microscopique nécessite le développement de représentations mathématiques spécifiques.

Mission confiée

L'objectif principal de cette thèse sera le développement de modèles mathématiques de microstructure-augmentée des faisceaux (MAF), qui transmettent à la fois les informations macrostructurales fournies par la fibre tractographie et les informations microstructurales fournies par les modèles de diffusion le long des faisceaux de matière blanche. Dans le contexte du projet PASTRAMI (**Pa**tient-specific **s**tatistics for micros**tr**ucture-**a**ugmented connecto**mi**cs) (fonds par le PRC, agence nationale de la recherche, 2023-2028), ces représentations seront utilisées pour dériver des biomarqueurs spécifiques aux patients de la récupération fonctionnelle en cas de lésion cérébrale traumatique grave.

Activités principales

Nous développerons un cadre d'analyse de forme sur la base du cadre LDDMM (Large Diffeomorphic Metric Mapping) qui repose sur la géométrie riemannienne et est bien adapté à l'étude des structures anatomiques, pour construire les modèles pour la représentation des faisceaux de matière blanche (qui peuvent être définis comme des courbes 1-dimensionnelles ou des surfaces 2-dimensionnelles dans R3) et leur microstructure associée. En continuation, nous analyserons également le connectome cérébral, qui représente le réseau de régions de matière grise connectées dans le cerveau. Nous développerons sur les méthodes développées pour l'analyse de graphes avec des données complexes.

Compétences requises

Nous recherchons des candidats fortement motivés par des sujets de recherche complexes en neuroimagerie. Le candidat doit présenter une bonne connaissance en mathématiques appliquées. Une connaissance de base en traitement d'image serait un atout. Une bonne connaissance des aspects informatiques est également nécessaire, en particulier en Python et C++.

Avantages
  • Prise en charge partielle des frais de transport en commun sur le trajet domicile-travail ou FMD.
  • Restauration subventionnée.
  • Prise en charge partielle des frais de mutuelle.
  • Possibilité de télétravail (à hauteur de 90 jours annuels) et d'aménagement du temps de travail.
Rémunération

Salaire mensuel brut de 2 100 € les deux premières années et 2 190€ la troisième année.



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