Ingénieur en Bioinformatique

il y a 2 semaines


Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein
Ingénieur d'étude en Bioinformatique

Contexte de l'offre

L'Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL) est une unité mixte multi-tutelle qui comprend plus de 100 personnes et 13 équipes de recherche. Nous sommes à la recherche d'un ingénieur d'étude en bioinformatique pour soutenir nos projets scientifiques en cours.

Missions

L'ingénieur d'étude sera chargé de l'analyse bioinformatique de données issues des nouvelles technologies de séquençage NGS en soutien à deux équipes de l'IGFL. Les missions incluent la définition du plan d'étude le mieux adapté au problème biologique posé, l'identification des outils de bio-calcul adaptés aux questions posées, la réalisation des analyses de données biologiques, le développement et/ou l'adaptation d'outils pour diffuser et mettre à disposition de la communauté scientifique les données acquises, et la diffusion et la valorisation des résultats sous forme de rapports techniques, de publications ou de présentations orales.

Compétences requises

Licence en sciences de la vie (par exemple, biologie, génétique, bioinformatique). Un diplôme d'études supérieures (Master) en bioinformatique constituera un atout. Connaissances théoriques générales dans le domaine des sciences de la vie et si possible dans le domaine de la génomique fonctionnelle. Connaissance théorique et pratique en programmation et biostatistique (langages R, Bash, Python et/ou équivalents). Maîtrise et/ou compréhension des outils d'analyse courants pour les données omiques incluant : séquençage à haut débit, notamment single cell pour la transcriptomique, l'épigénomique, la génomique. Expérience dans l'utilisation du logiciel de version de contrôle Git. Expérience de travail sur clusters de calcul (SLURM). Expérience dans l'utilisation de gestionnaire de pipelines d'analyse (ex : NextFlow, Snakemake). Intérêt pour les outils de visualisation interactive (ex: Shiny et/ou équivalent). Connaître la déontologie, l'éthique, la loi et la réglementation concernant le domaine de recherche (en particulier sur la confidentialité, sécurité informatique, sauvegarde et protection des données). Travailler en interaction, savoir discuter et vulgariser, à la fois avec des biologistes expérimentaux et des bioinformaticiens. Aptitude à la gestion de plusieurs projets en parallèle sur des sujets variés. Maîtrise de l'anglais scientifique (oral, écrit). Disposer d'excellentes qualités relationnelles. Capacité à travailler en équipe.



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    il y a 3 semaines


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    Poste d'Ingénieur bioinformaticien biostatisticien JuniorL'équipe de recherche du Centre d'Excellence en cancérologie pédiatrique SOUTH-ROCK est à la recherche d'un Ingénieur bioinformaticien biostatisticien Junior pour rejoindre son équipe de recherche. Le candidat idéal sera un spécialiste en analyse de données biomédicales avec...


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  • Bioinformaticien H/F

    il y a 1 mois


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