Ingénieur.e en analyse des microbiomes

il y a 4 semaines


Paris, Île-de-France Live 2 B Healthy of Des Moines Temps plein
Ingénieur.e en analyse des microbiomes

Nous recherchons un.e ingénieur.e expérimenté.e en analyse des microbiomes pour rejoindre notre équipe de recherche en bioinformatique.

Responsabilités

  • Développer et déployer des outils, workflows et bases de données pour l'analyse des données métagénomiques
  • Contribuer à l'état de l'art des bases de données, méthodes et outils nécessaires pour l'analyse des données métagénomiques
  • Assurer une veille scientifique et technologique sur l'évolution des concepts et des méthodes du domaine
  • Mettre en œuvre des benchmarks des outils et bases de données
  • Contribuer à l'élaboration d'un catalogue des outils et bases de données d'intérêt pour le domaine

Compétences attendues

  • Diplômé(e) en bioinformatique ou informatique
  • Connaissances générales en microbiologie, génomique et métagénomique
  • Maîtrise générale des outils logiciels standards et formats de données en génomique
  • Maîtrise de l'environnement Linux, des langages (shell, python, R) et de l'utilisation de clusters de calcul
  • Connaissance des gestionnaires de workflow courants en bioinformatique (nextflow, snakemake)
  • Compréhension de l'anglais oral et écrit
  • Capacité à travailler en mode projet et en équipe
  • Réactivité, autonomie, initiative, rigueur
  • Sens de l'organisation
  • Esprit d'équipe et sens de la collaboration

La personne recrutée sera formée à son arrivée aux outils et techniques mis en œuvre au sein d'une infrastructure de calcul scientifique. Elle s'intégrera dans son équipe d'accueil et participera aux groupes de travail pertinents pour sa mission. Le travail nécessitera des déplacements occasionnels pour participer à des réunions, des formations ou des événements.



  • Paris, Île-de-France SFBI Temps plein

    Postdoctoral Researcher in Drinking Water MicrobiomeJob Summary: We are seeking a highly motivated postdoctoral researcher to join our team at the SFBI and contribute to a cutting-edge project focused on deciphering the impact of microbiome and water parameters on opportunistic waterborne pathogens in drinking water systems.Key Responsibilities:Analyze the...


  • Paris, Île-de-France Live 2 B Healthy of Des Moines Temps plein

    Offre de poste : Ingénieur bioinformaticienLive 2 B Healthy of Des Moines recherche un Ingénieur bioinformaticien pour rejoindre son équipe de recherche en microbiologie.ResponsabilitésInventorier, développer et déployer des outils, workflows et bases de données dans le catalogue de ressources IFB pour le traitement de données métagénomiques...


  • Paris, Île-de-France Live 2 B Healthy of Des Moines Temps plein

    Poste d'Ingénieur bioinformaticienLive 2 B Healthy of Des Moines recherche un Ingénieur bioinformaticien pour rejoindre son équipe de recherche en microbiologie.ResponsabilitésInventorier, développer et déployer des outils, workflows et bases de données dans le catalogue de ressources IFB pour le traitement de données métagénomiques...


  • Paris, Île-de-France Live 2 B Healthy of Des Moines Temps plein

    Poste d'Ingénieur bioinformaticienLive 2 B Healthy of Des Moines recherche un Ingénieur bioinformaticien pour rejoindre son équipe de recherche en microbiologie.ResponsabilitésInventorier, développer et déployer des outils, workflows et bases de données dans le catalogue de ressources IFB pour le traitement de données métagénomiques...


  • Paris, Île-de-France EHESS - Ecole des Hautes Etudes en Sciences Temps plein

    Ingénieur.e en informatique scientifique pour projet ERC InfantSimulatorL'Ecole des hautes études en sciences sociales (EHESS) recherche un.e ingénieur.e en informatique scientifique pour rejoindre son équipe de recherche dans le cadre du projet ERC InfantSimulator. Ce projet vise à développer de nouveaux outils informatiques pour aider les jeunes...


  • Paris, Île-de-France EHESS - Ecole des Hautes Etudes en Sciences Temps plein

    Ingénieur.e en informatique scientifique pour projet ERC InfantSimulatorL'Ecole des Hautes Etudes en Sciences Sociales (EHESS) recherche un.e ingénieur.e en informatique scientifique pour rejoindre l'équipe du projet ERC InfantSimulator.Contexte du projetLe projet ERC InfantSimulator vise à développer de nouveaux outils informatiques pour aider les...


  • Paris, Île-de-France EHESS - Ecole des Hautes Etudes en Sciences Temps plein

    Ingénieur.e en informatique scientifique pour projet ERC InfantSimulatorL'Ecole des Hautes Etudes en Sciences Sociales (EHESS) recherche un.e ingénieur.e en informatique scientifique pour rejoindre son équipe de recherche dans le cadre du projet ERC InfantSimulator.Contexte de travailL'EHESS est un établissement public à caractère scientifique,...


  • Paris, Île-de-France EHESS - Ecole des Etudes en Sciences Sociales Temps plein

    Ingénieur.e en informatique scientifique pour projet ERC InfantSimulatorL'ingénieur.e recruté.e travaillera en collaboration avec l'équipe pour développer des logiciels distribuables, mettre en place les bonnes pratiques de développement et du génie logiciel. Il/elle s'assurera également de rendre disponibles aux membres de l'équipe...


  • Paris, Île-de-France EHESS - Ecole des Hautes Etudes en Sciences Temps plein

    Ingénieur.e en informatique scientifique pour projet ERC InfantSimulatorL'Ecole des Hautes Etudes en Sciences Sociales (EHESS) recherche un.e ingénieur.e en informatique scientifique pour rejoindre son équipe de recherche dans le cadre du projet ERC InfantSimulator.Contexte de travailL'équipe de recherche est multidisciplinaire et composée de...

  • Ingénieur.e d'études

    il y a 1 jour


    Paris, Île-de-France Association AFPSA Temps plein

    Ingénieur.e d'études - LPPS, Université de ParisL'Université de Paris recrute un ingénieur.e d'études pour rejoindre son Laboratoire de Psychopathologie et Processus de Santé (LPPS). Cette personne sera chargée de travailler sur des projets de recherche et de développement dans le domaine de la psychopathologie et des processus de...

  • Ingénieur.e de maintenance

    il y a 4 semaines


    Paris, Île-de-France Lambert Manufil Temps plein

    Ingénieur.e de maintenanceL'entreprise Lambert Manufil, spécialisée dans la fabrication de fils d'acier et de produits tréfilés, recherche un(e) ingénieur(e) de maintenance pour rejoindre son équipe de 40 femmes et hommes investis dans la même aventure.En tant qu'ingénieur.e de maintenance, vous serez chargé(e) de l'accompagnement du développement...


  • Paris, Île-de-France EHESS - Ecole des Hautes Etudes en Sciences Temps plein

    Ingénieur.e en informatique scientifique pour projet ERC InfantSimulatorContexte de travailL'Ecole des hautes études en sciences sociales (EHESS) est un établissement public à caractère scientifique, culturel et professionnel, « grand établissement » assurant une mission de recherche dans le domaine des sciences humaines et sociales et de formation...


  • Paris, Île-de-France EHESS - Ecole des Hautes Etudes en Sciences Temps plein

    Projet de recherche ERC InfantSimulatorL'Ecole des Hautes Etudes en Sciences Sociales (EHESS) recherche un.e ingénieur.e en informatique scientifique pour contribuer au développement de nouveaux outils informatiques et participer à des publications dans le cadre du projet de recherche ERC InfantSimulator.Contexte de travailL'équipe de recherche est...

  • Ingénieur.e d'études

    il y a 5 jours


    Paris, Île-de-France Association AFPSA Temps plein

    Poste d'ingénieur.e d'étudesL'Université de Paris recrute un ingénieur.e d'études pour rejoindre son Laboratoire de Psychopathologie et Processus de Santé (LPPS).Ce poste consiste à travailler en étroite collaboration avec l'équipe du LPPS pour développer et mettre en œuvre des projets de recherche et de développement dans le domaine...


  • Paris, Île-de-France Ovivo Switzerland AG Temps plein

    Ingénieur.e automatisme et électrotechniqueRejoignez notre équipe d'experts en automatisme et électrotechnique chez Ovivo Switzerland AG!Qu'est-ce que le poste?En tant qu'Ingénieur.e automatisme et électrotechnique, vous serez responsable de la conception, de la mise en œuvre et de la maintenance des systèmes de contrôle et d'automatisme pour nos...


  • Paris, Île-de-France Ovivo Switzerland AG Temps plein

    Ingénieur.e automatisme et électrotechniqueOpportunitéNous recherchons un Ingénieur.e automatisme et électrotechnique pour rejoindre notre équipe en France. En tant que membre de notre équipe, vous contribuerez à la conception, au développement et à la mise en œuvre de systèmes de contrôle et d'automatisation pour nos...


  • Paris, Île-de-France Eurofins Genomics GmbH Temps plein

    Ingénieur.e Projets en Amélioration Continue Eurofins Genomics GmbH, un réseau international de laboratoires de génomique, recherche un.e Ingénieur.e Projets en Amélioration Continue pour rejoindre son équipe dynamique. En tant qu'Ingénieur.e Projets en Amélioration Continue, vous serez chargé.e de gérer des projets variés pour accompagner le...

  • Ingénieur.e Process

    il y a 3 semaines


    Paris, Île-de-France Agronutris Temps plein

    Ingénieur.e ProcessEn tant qu'Ingénieur.e Process, vous serez un acteur clé dans la mise en place et l'optimisation des procédés de production. Vous serez notamment en charge de : Suivre les indicateurs de performance de la ligne de transformation ; Conduire les projets d'optimisation et d'amélioration de l'outil de transformation ;...

  • Ingénieur.e Ouvrage d'Art

    il y a 3 semaines


    Paris, Île-de-France AGENCE CADRES Temps plein

    Ingénieur.e Ouvrage d'ArtVous rejoignez notre équipe Ouvrage d'Art en tant qu'Ingénieur.e Ouvrage d'Art. Vous êtes chargé.e de la conception et de la réalisation d'ouvrages d'art du réseau ferré.Missions clésAssurer les missions de Maîtrise d'Oeuvre Etude et la production d'études de la conception à la...


  • Paris, Île-de-France Ovivo Switzerland AG Temps plein

    Ingénieur.e automatisme et électrotechnique **Description du poste** Nous recherchons un Ingénieur.e automatisme et électrotechnique pour rejoindre notre équipe en France. Vous serez responsable de la conception, de la mise en œuvre et de la maintenance de systèmes de supervision et de solutions électrotechniques. **Responsabilités** * Analyser...