Ingénieur en bioinformatique
il y a 4 semaines
Description du poste
Au sein du Centre Hospitalier Universitaire De Bordeaux, l'ingénieur en bioinformatique travaille en collaboration avec une équipe pluridisciplinaire composée d'ingénieurs en bioinformatique, de biologistes médicaux, de médecins généticiens, ainsi que d'autres professionnels de la santé. Il est également en interaction avec divers services de l'établissement, notamment la direction des systèmes d'information et les équipes qualité.
Ce poste exige un travail d'équipe soutenu, visant à contribuer efficacement à la mission de diagnostic génétique. Les activités se déroulent dans un cadre normatif strict, garantissant la confidentialité des données liées aux analyses de biologie médicale.
Missions principales :
L'ingénieur en bioinformatique a pour mission principale de traiter les données bioinformatiques issues du séquençage à haut débit pour les analyses de génétique constitutionnelle. Ses responsabilités incluent :
- Développement et maintenance des pipelines d'analyse (exomes et panels).
- Gestion et mise à jour des logiciels et bases de données associés au diagnostic génétique.
- Veille scientifique, réglementaire et normative.
- Assurer la conformité des activités bioinformatiques avec la norme ISO15189 (qualification des pipelines, documentation, gestion des exigences).
Autres missions :
- Création d'outils informatiques répondant aux besoins des équipes techniques et médicales.
- Formation du personnel à l'utilisation optimale des outils bioinformatiques.
- Gestion de l'infrastructure informatique en collaboration avec la direction des systèmes d'information.
- Collaboration avec des partenaires externes pour la mise à jour des outils propriétaires liés au séquençage.
- Participation à l'analyse des données issues de nouvelles technologies (NGS long read, RNAseq) mises en œuvre au laboratoire.
- Contributions aux publications scientifiques.
Profil recherché :
Compétences requises :
- Maîtrise des systèmes d'exploitation Linux.
- Connaissance approfondie de plusieurs langages de programmation (Python, Perl, Java, JavaScript, Bash, R, etc.).
- Expérience avec les outils de gestion de bases de données.
- Compétences en gestion de version, workflow et conteneurisation.
- Capacité à concevoir et à utiliser des architectures système pour le stockage et l'analyse de grandes quantités de données.
- Compréhension des techniques de biologie moléculaire.
- Esprit d'équipe et capacité d'adaptation.
- Engagement envers le service public.
- Maîtrise de l'anglais.
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Ingénieur en Bioinformatique Avancé
il y a 4 semaines
Paris, Île-de-France France Génomique Temps pleinPrésentation du Poste Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) recherche un Ingénieur en Bioinformatique pour la conception et le développement d'outils d'analyse de données protéomiques. Mission Principale Vous serez chargé de : Développer des solutions innovantes pour l'analyse de données biologiques complexes. Collaborer avec des équipes...
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Ingénieur/chercheur en bioinformatique
il y a 6 jours
Paris, Île-de-France SFBI Temps pleinPoste d'Ingénieur/Chercheur en BioinformatiqueÀ Biomemory, nous sommes déterminés à réduire l'empreinte carbone de l'industrie du stockage de données grâce à des approches innovantes en biologie. Nous visons à développer une solution de stockage de données ADN économique et respectueuse de l'environnement, répondant au défi critique de...
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Ingénieur en Bioinformatique H/F
il y a 4 semaines
Paris, Île-de-France CNRS Temps pleinContexte du posteDans le cadre de projets innovants, le CNRS recherche un ingénieur en bioinformatique pour renforcer son équipe dédiée à l'analyse et à la gestion des données biologiques. Ce poste est essentiel pour le développement de solutions bioinformatiques avancées, en mettant l'accent sur le calcul haute performance (HPC) et l'intelligence...
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Ingénieur en Bioinformatique H/F
il y a 4 semaines
Paris, Île-de-France SFBI Temps pleinPoste : Ingénieur en Bioinformatique H/FType de contrat : CDINiveau d'études : Bac+5 / MasterEntreprise : SFBIÀ propos de SFBI :SFBI est une entreprise innovante spécialisée dans le développement de solutions biotechnologiques durables. Nous nous engageons à accompagner les secteurs industriels dans leur transition vers des pratiques de production...
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Ingénieur en bioinformatique F/H
il y a 4 semaines
Paris, Île-de-France Centre Hospitalier Universitaire De Bordeaux Temps pleinMission PrincipaleAu sein du Centre Hospitalier Universitaire De Bordeaux, l'ingénieur en bioinformatique joue un rôle essentiel dans le traitement des données issues du séquençage à haut débit pour les analyses de génétique constitutionnelle. Il fait partie d'une équipe pluridisciplinaire, collaborant avec des biologistes médicaux, des médecins...
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Ingénieur développement informatique en protéomique
il y a 6 jours
Paris, Île-de-France P&H Hönes GmbH Temps pleinDéveloppement d'un pipeline bioinformatique innovant Nous recherchons un ingénieur développement informatique en protéomique pour rejoindre notre équipe de développement de solutions logicielles pour l'analyse de données biomoléculaires. Le candidat aura pour mission de développer un pipeline bioinformatique innovant pour l'analyse de données...
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Ingénieur en bioinformatique
il y a 6 jours
Paris, Île-de-France SFBI Temps pleinDescription du poste Nous sommes à la recherche d'un ingénieur en bioinformatique pour rejoindre notre équipe de recherche et développement au sein de SFBI. Vos missions principales seront de développer et de maintenir des outils et des méthodes pour l'analyse de données biométriques, en collaboration avec les équipes de chimie et d'analyse du...
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Ingénieur Informatique
il y a 2 semaines
Paris, Île-de-France Inovarion Temps pleinPrésentation de l'entreprise Inovarion est un centre de Recherche et d'Innovation créé en 2013. A l'interface entre recherche fondamentale et développement industriel, Inovarion apporte son savoir-faire et son expertise aux grands acteurs publics et privés des Sciences du Vivant. Mission de l'entreprise Devenu en 11 ans un acteur...
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Ingénieur•e en bioinformatique, développement de workflows
il y a 6 jours
Paris, Île-de-France CNRS Temps plein**Rejoignez l'équipe de recherche du CNRS** Nous sommes à la recherche d'un Ingénieur•e en bioinformatique pour rejoindre notre équipe de développement de workflows. **Votre rôle** Développer des solutions innovantes pour analyser et traiter des données biomédicales Collaborer avec les chercheurs pour intégrer les résultats de...
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Paris, Île-de-France CNRS Temps pleinIntitulé de l'offre : Ingénieur en déploiement d'applications sur des infrastructures de calcul avancées et en intelligence artificielle Informations générales Référence : UAR3601-ANILEF-017 Nombre de Postes : 1 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 24 mois Quotité de travail : Temps complet Rémunération :...
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Paris, Île-de-France CNRS Temps pleinInformations généralesTitre de l'offre : Ingénieur en déploiement d'applications sur des ressources haute performance et en intelligence artificielleCompétences requisesLe candidat idéal possède une maîtrise générale des outils logiciels standards en bioinformatique, ainsi que des compétences en gestion de versions des codes source et déploiement...
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Paris, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre de PosteL'Institut Français de Bioinformatique (IFB) recrute un ingénieur en déploiement d'applications sur des ressources haute performance et en intelligence artificielle pour rejoindre son équipe de bioinformaticiens à Paris.MissionsL'ingénieur en déploiement d'applications sur des ressources haute performance et en...
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Ingénieur Bioinformaticien F/H
il y a 6 jours
Paris, Île-de-France CNRS Temps pleinDéveloppement d'Applications HPC et Intelligence ArtificielleL'Institut Français de Bioinformatique (IFB) recrute un ingénieur bioinformaticien pour mettre en place des ressources bioinformatiques utiles pour appliquer le calcul à haute performance (HPC) et l'intelligence artificielle (AI) aux données de biologie.ResponsabilitésAnalyser les...
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Paris, Île-de-France SFBI Temps pleinIngénieur.e en déploiement d'applications sur des infrastructures de calcul avancées CDD·Ingénieur autre·24 mois Bac+5 / Master SFBI·Paris (France) Entre 2932,84 et 3557,58 euros bruts par mois selon expérience Dans le cadre d'un projet innovant en bioinformatique, SFBI recherche un ingénieur bioinformaticien pour développer des solutions...
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Ingénieur Senior en Développement Informatique DevOps
il y a 4 semaines
Paris, Île-de-France P&H Hönes GmbH Temps pleinPoste : Ingénieur Senior en Développement Informatique DevOpsType de contrat : CDD-OD, 36 moisNiveau d'études : Bac+5 / MasterLocalisation : Centre de Marcoule, GardContexte : Cette opportunité s'inscrit dans les projets novateurs du Laboratoire Innovations Technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le candidat participera à l'évolution...
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Paris, Île-de-France SFBI Temps pleinIngénieur en déploiement d'applications sur des ressources haute performanceContexte de l'entrepriseLa Société Française de Bioinformatique (SFBI) est une entreprise leader dans le domaine de la bioinformatique. Nous sommes spécialisés dans la fourniture de services de calcul haute performance et d'intelligence artificielle pour les...
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Ingénieur de recherche
il y a 2 semaines
Paris, Île-de-France Institut Pasteur Temps pleinPoste d'Ingénieur de RechercheDescription du PosteL'Institut Pasteur recherche un Ingénieur de Recherche pour rejoindre son équipe de recherche en microbiologie. Le candidat idéal aura une solide formation en microbiologie, biologie moléculaire et bioinformatique, ainsi qu'une expérience en experimentation animale.MissionsEffectuer des...
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Ingénieur(e) en Bio-informatique spécialisé(e) en Métagénomique
il y a 4 semaines
Paris, Île-de-France SFBI Temps pleinIngénieur(e) en Bio-informatique spécialisé(e) en Métagénomique Type de contrat : CDI · Niveau d'études : Bac+5 / Master · Secteur : Biotechnologies À propos de l'entreprise : SFBI est une entreprise innovante française qui se consacre à la création de solutions à fort impact dans le secteur des biotechnologies. Notre mission est...
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Ingénieur de recherche
il y a 2 semaines
Paris, Île-de-France Institut Pasteur Temps pleinPoste d'Ingénieur de RechercheDescription du PosteL'Institut Pasteur recherche un Ingénieur de Recherche pour rejoindre son équipe de recherche en microbiologie. Le candidat idéal aura une solide formation en microbiologie, biologie moléculaire et bioinformatique, ainsi qu'une expérience en experimentation animale.MissionsEffectuer des...
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Paris, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre d'emploi**Ingénieur.e en déploiement d'applications haute performance et intelligence artificielle**L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) recrute un ingénieur.e en déploiement d'applications haute performance et intelligence artificielle pour rejoindre son équipe de développement.MissionsAssurer un rôle de conseil et...
