Ingénieur en collecte et organisation de données de traits chez les plantes

il y a 4 jours


Rennes, Bretagne, France CNRS Temps plein
Ingénieur en collecte et organisation de données de traits chez les plantes

Le CNRS recherche un ingénieur pour rejoindre son équipe de recherche dans le domaine de la biologie des données. Le candidat sélectionné travaillera sur la collecte et l'organisation de données de traits chez les plantes à fleurs.

Responsabilités
  • Récolter des données sur des traits reproducteurs et végétatifs chez les plantes à fleurs à partir de bases de données publiques, de flores ou de la littérature scientifique.
  • Organiser ces données sous format standardisé.
  • Participer à la curation des données préexistantes déjà récoltées et à la préparation des données pour les analyses du projet.
  • Rechercher des données, les organiser et les mettre à disposition pour des personnes impliquées dans le projet.
  • Curer des données déjà disponibles et nouvellement acquises.
  • Préparer des données pour les analyses en associations avec les autres données du projet.
  • Communiquer (écrit et oral, en anglais et/ou français) auprès des partenaires impliqués dans le projet et pour la communauté scientifique.
Compétences requises
  • Familiarité avec la botanique et formation en biologie évolutive et écologie.
  • Expérience avec l'utilisation de bases de données et l'utilisation de scripts simples (typiquement sous R) pour la manipulation de fichiers de données.
  • Rigueur dans son travail (organisation des données, des protocoles de collecte, de curation, de préparation des données).
  • Capacité à bien communiquer avec les autres membres du projet pour permettre un véritable travail en équipe.
  • Bon niveau en anglais, en particulier à l'écrit (rédaction de protocoles, de fiches de métadonnées, littérature en anglais).
Contexte

Le poste s'inscrit dans le projet ANR FloweRS (Déterminants reproductifs du succès évolutif et écologique chez les plantes à fleurs). La personne sera basée à ECOBIO au sein du thème EVO-ADAPT et travaillera étroitement avec Sylvain Glémin mais interagira également avec Cendrine Mony, Aude Ernoult, Simon Chollet et Vincent Jung du thème PAYSABIO. En dehors du laboratoire, elle interagira en particulier avec Jos Käfer (ISEM, Montpellier) et Hervé Sauquet (Jardin botanique de Sydney, Australie), partenaires du projet. Sur des aspects techniques des bases de données, la personne recrutée pourra compter sur la collaboration avec des chercheurs et ingénieurs en informatique (équipes d'Eric Tannier, LBBE Lyon et de Simon Castellan, INRIA Rennes). Déplacements occasionnels possibles à Montpellier et à Lyon pour rencontrer les collaborateurs du projet.



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