Développeur full stack pour un outil de courtage des données
il y a 4 semaines
Présentation du poste
L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) recrute un Développeur full stack pour contribuer au développement d'un outil de courtage de données, Madbot, qui vise à collecter, gérer, analyser et diffuser des données et des métadonnées vers les entrepôts internationaux.
Missions
Le candidat sélectionné contribuera aux développements de l'application de courtage de données, qui vise à:
- Concevoir et développer la base de données
- Optimiser le requêtage sur la base de données
- Mettre en place des processus automatiques de traitement de données sur une VM ou sur le cluster de calcul de l'IFB
- Mettre en place des connecteurs entre l'outil de courtage et des outils d'analyse, traitement, ...
- Concevoir et développer des interfaces utilisateurs (GUI) et d'interfaces programmatiques (API)
- Optimiser les APIs déjà existantes
- Concevoir et développer des outils extérieurs facilitant l'analyse de données
- Participer à des réunions avec les partenaires et les différents groupes de travail pour assurer l'adéquation de l'outil avec les besoins des usagers
- Rédiger, en français et en anglais, la documentation pour les usagers, les administrateurs et les développeurs
- Assurer une veille technologique
- Participer à l'assistance et au support utilisateur
Compétences requises
Le candidat sélectionné devra posséder les compétences suivantes:
- Double compétence en biologie et informatique
- Méthodes, concepts et outils de la Science Ouverte, principes FAIR (Findable Accessible Interoperable Reusable)
- Méthodologie de développement logiciel
- Bonnes pratiques de développement : gestion collaborative de code, tests unitaires, vérification de la qualité, intégration continue, partage d'environnements contrôlés
- Langages de programmation les plus utilisés en bioinformatique (Python, R, bash)
- Frameworks pour le développement d'applications web
- Protocoles de communication et d'échanges de données, y compris API
- Analyse et visualisation de données
Contexte de travail
Le poste est localisé sur la plateforme de l'Université Paris Cité IPOP-UP dédié à la promotion et à la pratique de la bioinformatique, au sein de l'unité Epigénétique et Destin Cellulaire (UMR7216) à Paris 13ème.
Contraintes et risques
La personne recrutée sera formée à son arrivée aux outils et techniques mis en œuvre au sein d'une infrastructure de calcul scientifique. Elle s'intégrera dans son équipe d'accueil, et participera, sur site et en télétravail, aux groupes de travail de l'IFB pertinents pour sa mission.
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il y a 4 semaines
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il y a 4 semaines
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il y a 4 semaines
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il y a 2 semaines
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il y a 4 semaines
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