Emplois actuels liés à Ingénieur en bioinformatique spécialisé dans l'analyse de données unicellulaires - GifsurYvette, Île-de-France - CNRS
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Postdoctorant en bioinformatique
il y a 2 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre de poste : Postdoctorant en bioinformatiqueContexteL'I2BC, un grand institut de biologie moléculaire et cellulaire, recherche un postdoctorant en bioinformatique pour rejoindre son équipe de recherche. Cette équipe est spécialisée dans l'analyse de données RNA-seq pour identifier des signatures ARN spécifiques des tumeurs.MissionsLe...
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Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinCDD Ingénieur de Recherche Bioinformatique et Biologie moléculaire**Offre de poste**Nous sommes à la recherche d'un Ingénieur de Recherche en Bioinformatique et Biologie Moléculaire pour rejoindre notre équipe. Vous aurez la responsabilité de coordonner la mise en œuvre de techniques d'analyses bioinformatiques et de biologie moléculaire pour...
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Ingénieur de Recherche en Bioinformatique et Biologie Moléculaire
il y a 2 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinPrésentation du posteL'Ingénieur de Recherche en Bioinformatique et Biologie Moléculaire rejoindra l'équipe Régulation Épigénétique des Éléments Transposables chez Arabidopsis, financée par le réseau SPS, pour l'étude des régulations épigéntiques des éléments transposables chez Arabidopsis.MissionsL'ingénieur explorera la...
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Ingénieur de Recherche en Bioinformatique et Biologie Moléculaire
il y a 1 semaine
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinInformations GénéralesTitre de l'Offre : Ingénieur de Recherche en Bioinformatique et Biologie MoléculaireRéférence : UMR9198-ANGDEL-002Nombre de Postes : 1Lieu de Travail : GIF SUR YVETTEType de Contrat : CDD Technique/AdministratifDurée du Contrat : 7 moisDate d'Embauche Prévue : 1 décembre 2024Quotité de Travail : Temps...
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Postdoctorant en bioinformatique
il y a 3 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinPostdoctorant en bioinformatiqueInformations généralesTitre de l'offre : Postdoctorant en bioinformatique : méthodes d'analyse d'ARN à grande échelle pour le cancerRéférence : UMR9198-DANGAU-005Nombre de postes : 1Lieu de travail : Gif sur YvetteDate de publication : Type de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 24 moisDate d'embauche prévue...
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Ingénieur biologiste en analyse de données
il y a 3 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre de poste : Ingénieur d'étude en biologie cellulaire (H/F)Le groupe d'accueil étudie la ciliogenèse en se concentrant principalement sur le processus d'ancrage du corps basal et la formation de la zone de transition en utilisant à la fois l'organisme unicellulaire multicilié la paramécie et les cellules de mammifères monociliées...
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Ingénieur de Recherche Bioinformatique et Biologie Moléculaire
il y a 2 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre de PosteL'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) recherche un Ingénieur de Recherche pour rejoindre son équipe Régulation Épigénétique des Éléments Transposables chez Arabidopsis.MissionsL'Ingénieur sera chargé de coordonner la mise en œuvre de techniques d'analyse bioinformatiques et de biologie moléculaire pour...
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Postdoctorant en bioinformatique
il y a 2 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre de poste : Postdoctorant en bioinformatiqueContexteL'I2BC, un grand institut de biologie moléculaire et cellulaire, recherche un postdoctorant en bioinformatique pour rejoindre son équipe de recherche sur les ARN non-codants ou mal codants, particulièrement dans le cancer.MissionsLe postdoctorant sera chargé de mettre en place et d'exploiter des...
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Ingénieur biologiste en analyse de données
il y a 3 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre d'emploi : Ingénieur d'étude en biologie cellulaire (H/F)ContexteL'équipe étudie le processus de ciliogenèse en décryptant le processus d'ancrage du corps basal, qui aboutit à la formation de la zone de transition en utilisant à la fois l'organisme unicellulaire multicilié la paramécie et les cellules de mammifères monociliées...
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Ingénieur biologiste en analyse de données
il y a 2 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre d'emploi : Ingénieur d'étude en biologie cellulaire (H/F)L'I2BC recherche un ingénieur d'étude en biologie cellulaire pour rejoindre son équipe de recherche. Le candidat idéal sera titulaire d'un doctorat en biologie structurale, en biologie cellulaire ou dans un domaine étroitement lié à la biologie.Compétences requisesExpérience technique...
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Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre de postdoctorat en bioinformatiqueL'I2BC recherche un postdoctorant pour rejoindre son équipe de bioinformatique et contribuer à la constitution de grands index de données RNA-seq cancer/normal.MissionsLe postdoctorant mettra en place des protocoles de criblage de données RNA-seq pour identifier des signatures ARN induites par les mutations...
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Bioinformaticien postdoctoral
il y a 1 semaine
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinPrésentation du posteLe CNRS recherche un bioinformaticien postdoctoral pour rejoindre son équipe de recherche en biologie computationnelle. Le candidat sélectionné travaillera sur le développement de nouvelles méthodes d'analyse d'ARN à grande échelle pour le cancer.MissionsLe postdoctorant sera chargé de mettre en place et d'exploiter des outils...
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Chercheur postdoctoral en microbiologie environnementale
il y a 3 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre de postdoctorat en microbiologie environnementaleL'équipe DEEM de l'Université Paris-Saclay recherche un chercheur postdoctoral pour travailler sur le projet ERC AdG SYMBEK. Le candidat sélectionné sera chargé d'analyser les données génomiques pour comprendre l'origine des gènes de type procaryote chez les eucaryotes.MissionsLe...
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Ingénieur d'étude en biologie cellulaire
il y a 2 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre de rechercheL'équipe étudie le processus de ciliogenèse en décryptant le processus d'ancrage du corps basal, qui aboutit à la formation de la zone de transition en utilisant deux modèles cellulaires, des cellules de mammifères en culture et l'organisme unicellulaire multicilié la Paramécie.Le candidat retenu développera plusieurs...
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Ingénieur développeur MLOps en bioinformatique
il y a 4 semaines
Nort-sur-Erdre, Pays de la Loire, France CNRS Temps pleinInformations généralesTitre de l'offre : Ingénieur développeur MLOps en bioinformatiqueRéférence : UMR6074-ANTBRE-002Nombre de postes : 1Lieu de travail : RennesType de contrat : CDD Technique/AdministratifDurée du contrat : 24 moisDate d'embauche prévue : 1 novembre 2024Quotité de travail : Temps completRémunération : 2349 € et 2.625€...
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Chef de la Plateforme de Données
il y a 3 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France L-ACOUSTICS SAS Temps pleinNous recherchons un expert en plateforme de données pour renforcer notre équipe IT & Digital.En tant que membre de l'équipe IT & Digital, vous intervenez au cœur des différents projets de développement du Groupe sur un périmètre international.Votre mission consiste à :Responsabilités :Analyser les besoins fonctionnels.Localiser les données de...
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Chef de la Plateforme de Données
il y a 2 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France L-ACOUSTICS SAS Temps pleinNous recherchons un chef de la plateforme de données pour renforcer nos équipes et contribuer à la stratégie IT du Groupe. En tant que membre de l'équipe IT & Digital, vous intervenez au cœur des différents projets de développement du Groupe sur un périmètre international. Votre mission consiste à : Responsabilités : Analyser les besoins...
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Ingénieur d'Étude en Génétique et Biologie Moléculaire
il y a 3 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre d'Emploi : Ingénieur d'Études en Biologie Moléculaire et Culture In VitroL'Ingénieur d'Études travaillera dans le cadre du projet ERC EvolSexChrom, qui vise à comprendre l'évolution des chromosomes sexuels. Il/Elle développera, adaptera et réalisera des expériences variées basées sur des techniques de biologie...
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Postdoctorant en génomique comparative
il y a 3 semaines
Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps pleinOffre de postdoctorat en génomique comparativeL'équipe DEEM de l'Université Paris-Saclay recherche un postdoctorant pour rejoindre son projet ERC AdG SYMBEK. Le candidat sélectionné travaillera sur la génomique comparative et la phylogénie moléculaire pour étudier l'origine des gènes de type procaryote chez les eucaryotes.MissionsLe...
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Chef de la Plateforme de Données
il y a 1 mois
Gif-sur-Yvette, Île-de-France L-ACOUSTICS SAS Temps pleinRejoignez notre équipe de Data PlatformNous recherchons un chef de Data Platform pour renforcer nos équipes et contribuer à la stratégie de données du groupe.ResponsabilitésAnalyser les besoins fonctionnels et identifier les opportunités de développement.Concevoir et mettre en œuvre des solutions de données pour répondre aux besoins des...
Ingénieur en bioinformatique spécialisé dans l'analyse de données unicellulaires
Il y a 3 mois
Portail des Offres
Ingénieur en bioinformatique spécialisé dans l'analyse de données unicellulairesInformations générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur en bioinformatique spécialisé dans l'analyse de données unicellulaires
Référence : UMR9198-CELHER-003
Nombre de Postes : 1
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2419€ et 2546€ bruts mensuels selon l'expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 6 - (Bac+3 ou 4)
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données
Les missions se concentreront sur deux axes principaux :
• Dans le cadre du programme BacDrop : ce projet transversal a pour but de comparer les résultats de divers protocoles afin de développer des outils d'analyse OMICS pour la transcriptomique en cellule unique de populations bactériennes. L'ingénieur.e sera responsable de la création d'outils et/ou de l'adaptation de pipelines pour les données procaryotes, ainsi que de l'analyse des données du projet (R, Seurat) et de la présentation des résultats obtenus.
• Dans le cadre des activités de service de la plateforme : l'ingénieur.e répartira son temps entre le projet BacDrop et des activités de type plateforme, telles que la mise en place de projets, le traitement initial des runs et l'analyse bioinformatique des données issues des prestations.
Analyse de données de transcriptomique en cellule unique :
• Réaliser une veille technologique et comparer les méthodes et outils d'analyse disponibles.
• Mettre en place, documenter, tester et appliquer un pipeline d'analyse de données de transcriptomique en cellule unique adapté aux populations bactériennes.
• Participer aux réunions d'avancement du projet avec les équipes collaboratrices.
• Valoriser les résultats du projet lors de réunions et conférences scientifiques.
Analyse de données de séquençage à haut débit :
• Traiter et analyser des données de séquençage à haut débit dans le cadre des prestations de la plateforme (étude de faisabilité, traitement, partage de compte-rendu des résultats, stockage, suivi post-prestation).
• Participer aux réunions impliquant la plateforme (réunions d'équipe hebdomadaires, réunions ponctuelles de mise en place des projets avec les utilisateurs).
• Intégrer son activité dans le système Qualité de la plateforme.
Selon l'avancement du projet BacDrop et de l'activité de séquençage de la plateforme, l'ingénieur.e pourra participer à d'autres projets menés par la plateforme.
• Expérience requise dans l'analyse de données de séquençage à haut débit.
• Connaissances nécessaires de l'environnement Unix/Linux, et d'au moins un langage de programmation (R).
• Expérience souhaitée dans l'analyse de données de transcriptomique en cellule unique.
• Expérience souhaitée dans l'utilisation d'un cluster de calcul et d'un gestionnaire de pipelines d'analyses (ex : SnakeMake).
• Connaissances appréciées dans le domaine des ARN et des procaryotes.
• Sens de l'organisation pour gérer des projets nécessitant un volume important de séquençage.
• Autonomie et rigueur.
• Excellentes qualités relationnelles, d'écoute et de communication.
• Goût pour le travail en équipe.
• Langue anglaise : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues).
L'I2BC est une grande unité mixte de recherche CNRS, CEA et Université Paris Saclay. L'unité a un effectif moyen de près de 650 personnes réparties entre plusieurs départements scientifiques, équipes de recherche et plateformes technologiques de haut niveau. La plateforme de séquençage à haut débit de l'I2BC a pour mission d'offrir des services et un soutien à la recherche dans le domaine du séquençage à haut débit et de ses applications. Elle est ouverte aux communautés académiques et industrielles et réalise une grande variété de projets basés sur des technologies avancées. Le programme BacDrop est un projet majeur qui vise à développer une expertise dans l'analyse en cellule unique de populations bactériennes.