Ingénieur de Recherche en traitement bioinformatique et analyse statistique de données de séquençage

il y a 3 semaines


Toulouse, Occitanie, France CNRS Temps plein
Informations générales

Titre de l'offre : Ingénieur de Recherche en traitement bioinformatique et analyse statistique de données de séquençage (H/F)

Nombre de postes : 1

Lieu de travail : Toulouse

Type de contrat : CDD Technique/Administratif

Durée du contrat : 12 mois

Date d'embauche prévue : 2 décembre 2024

Quotité de travail : Temps complet

Rémunération : Entre 2349.06 € et 3005.46 € brut mensuel selon l'expérience

Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)

Expérience souhaitée : Indifférent

BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement

Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données

Missions

Assurer le recueil, le traitement et l'analyse des données de séquençage sur les projets associant la plateforme bioinformatique du CBI. L'agent sera en contact direct avec les biologistes porteurs de projet et sera chargé des données de séquençage. Il/Elle travaillera sur plusieurs projets simultanément dans des domaines variés tels que : transcriptomique, épigénomique, assemblage De Novo...

Activités

Assurer le recueil, le contrôle des données et organiser leur stockage

Réaliser le traitement des données brutes en utilisant ou développant des chaînes de traitement des données, de la collecte à l'analyse statistique

Choisir et appliquer les méthodes statistiques existantes les plus pertinentes sur les données et déterminer les logiciels les mieux adaptés et les plus performants pour le projet

Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques, Participer à la rédaction des synthèses de présentation des résultats des analyses statistiques

Gérer et maintenir des outils informatiques partagés

Conseiller et former aux outils utilisés et effectuer des présentations pour assurer un transfert de compétences

Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine d'activité

Assurer un contrôle qualité sur les résultats produits

Compétences

Savoirs / connaissances :

Techniques informatiques de recueil, analyse et traitement des données

Expérience ou théorie sur l'assemblage de génomes, la transcriptomique et l'épigénomique

Langages de programmation (R, Python, bash)

Biologie (connaissance générale) avec une expérience en données omiques

Langue anglaise : écrit et oral

Savoir-faire :

Traiter des données transcriptomique ou épigénomique

Assembler un génome de novo

Programmer dans différents environnements informatiques

Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats, Rédiger la documentation pour les utilisateurs et Réaliser des synthèses

Savoir-être :

Transmettre des connaissances et utiliser les techniques de présentation

Assurer une veille

Travailler en équipe

Contexte de travail

Les équipes du Centre de Biologie Integrative (CBI) de Toulouse développent des approches multidisciplinaires, multi-échelles des molécules isolées aux organismes entiers et aux sociétés animales dans le but de comprendre le fonctionnement des organismes vivants. L'utilisation de technologies de séquençage est nécessaire à la poursuite de nombreux projets. La plateforme bioinformatique du CBI est dédiée à l'analyse de ces données permet à tous d'utiliser ces approches devenues incontournables dans de nombreux champs d'investigation de l'ensemble des équipes du CBI.

Contraintes et risques

Travail sur écran

Interaction avec différentes équipes, différents services, différents public (biologistes, informaticiens)



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