Assistant Ingénieur en Imagerie du Plancton

il y a 4 semaines


VillefranchesurMer, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France CNRS Temps plein
Présentation du Poste

Nous recherchons un Assistant Ingénieur en Imagerie du Plancton pour rejoindre notre équipe de recherche au Laboratoire d'Océanographie de Villefranche. Le candidat idéal sera chargé de la préparation des échantillons, de l'acquisition et du traitement des images de plancton. Il travaillera sous la responsabilité de la responsable de la PIQv et soutiendra des tâches du projet BIOcean5D.

Missions et Activités

- Assurer la cohérence des metadata des prélèvements et la qualité des analyses
- Analyser des échantillons de plancton par imagerie (IFCB/Flowcam/Zooscan)
- Identifier des images de plancton et de particules issues des instruments IFCB/Flowcam/Zooscan/UVP sur l'application web Ecotaxa
- Rédiger les conventions d'analyses avec les chefs scientifiques des projets analysés par la PIQv
- Réaliser à la maintenance des petits équipements de la PIQv et CCPv
- Encadrer techniquement les personnels (étudiants, stagiaires) à la PIQv
- Rédiger les comptes rendus d'analyses et les rapports qualité pour les chefs scientifiques des projets analysés par la PIQv

Compétences et Qualités

- Connaissances transversales requises :
- Connaissance des techniques de laboratoire et en particulier d'imagerie quantitative
- Capacité à établir des protocoles et spécifications, développer des méthodes
- Compétences approfondies pour l'utilisation des outils informatiques du domaine d'activité, outils de classification, d'inventaire, de gestion des tâches
- Connaissance de la taxonomie du plancton (phyto- et zooplancton)

- Savoir-faire :
- Travail de laboratoire sur paillasse avec produits chimiques de type CMR
- Réaliser ou adapter des modes opératoires
- Suivi des règles H&S

- Savoir-être :
- Minutie
- Initiative, autonomie et responsabilité
- Sens de l'organisation
- Savoir rendre compte

Contexte de Travail

Le Laboratoire d'Océanographie de Villefranche est situé près de Nice, sur la Côte d'Azur, dans l'une des trois stations marines de Sorbonne Université. Avec environ 90 employés, le LOV génère et analyse une grande quantité de données marines, notamment des données d'imagerie, génomiques et satellitaires, pour étudier l'océan.

L'équipe COMPLEx compte une trentaine de membres qui étudient le plancton marin en collectant des données avec des instruments d'imagerie quantitative et de la génomique à haut débit, qui viennent alimenter des méthodes d'analyse numérique (modélisation, statistiques, apprentissage automatique). Le plancton englobe tous les organismes dérivant avec les courants marins. Ces organismes produisent une partie de l'oxygène que nous respirons, stockent le carbone que nous émettons, nourrissent les poissons que nous mangeons ; le plancton est donc un élément constitutif majeur de l'écosystème terrestre. COMPLEx interagit fortement avec la Plateforme d'Imagerie Quantitative de Villefranche (PIQv ; https:///view/piqv), qui supervise l'opération des outils que l'équipe développe. Ces outils incluent des capteurs d'imagerie, tels que l'Underwater Vision Profiler (UVP) ou le ZooScan. L'UVP6 est notamment en cours d'intégration sur des plateformes autonomes (. des robots sous-marins) qui permettent de collecter des données à une échelle sans précédent. Mais ces outils incluent également un nombre croissant de logiciels : ZooProcess et UVPapp pour traiter les données produites par les instruments, EcoTaxa (https:///) qui utilise le machine learning pour aider les taxonomistes à trier de grandes quantités d'images de plancton (actuellement ~180 millions), EcoPart (https:///) qui stocke et affiche les données collectées dans le monde entier par l'UVP (plus de 17,000 profils), etc. Nous avons une longue expérience d'interaction avec des informaticiens et des ingénieurs, dans le monde universitaire mais aussi dans le secteur privé, pour développer ces outils.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Informations Complémentaires

Durée de contrat : 12 mois, renouvelable.

Congés jusqu'à 55 jours par an.

Le laboratoire est situé à Villefranche sur mer et propose un accès direct à la rade de Villefranche



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  • Villefranche-sur-Mer, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Le/la Responsable de la Gestion et de l'Interopérabilité de Données d'Océanographie Biologique sera chargé(e) de suivre, de gérer et d'interopérabilité des données collectées dans le cadre du projet, qui sont de nature diverse (génomique, imagerie, taxinomie classique, physico-chimie, etc). Il/elle suivra leur récolte, leur traitement initial,...


  • Villefranche-sur-Mer, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Responsable de la Gestion et de l'Interopérabilité de Données d'Océanographie Biologique (Chief Data Manager) Type de contrat : CDD·IR·24 mois Niveau d'études souhaité : Bac+5 / Master Employeur : Sorbonne Université – Faculté des Sciences - Laboratoire d'Océanographie de Villefranche sur Mer Lieu de travail : Villefranche sur Mer...


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    L'Assistant technique électromécanique et sécurité de la Marine nationale est responsable de la supervision de l'analyse de sujets techniques et de la contribution aux formations en fonction du parcours académique.Compétences requisesUn niveau ingénieur/Master 2 à dominante scientifique ou technique est souhaité. Un DUT à dominante scientifique ou...


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    Construisons ensemble la ville de demain : dynamique, digitale, mobile, connectée, innovanteMissionL'Assistant Administratif et Technique en charge de JCDecaux permet de faire le lien avec les adjoints d'exploitation, ingénieurs-travaux sur le terrain, pour la mise en place des chantiers liés à l'installation de mobilier urbain et...


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  • Saint-Mandrier-sur-Mer, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France Marine Nationale Temps plein

    MissionL'assistant technique électromécanique et sécurité est chargé de superviser l'analyse de sujets techniques dans les domaines de la mécanique, de l'électrotechnique et de la sécurité.Il est responsable de la rédaction des notes de synthèse correspondant à ces travaux et de la coordination de travaux transverses aux différentes entités de...

  • Assistant ingénieur

    il y a 4 semaines


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    Mission de stage : Optimiser les performances d'une nouvelle usine innovante de recyclageVous rejoindrez l'équipe d'Eurovia à FOS-sur-MER (13) pour participer à la mise en route et aux réglages de la nouvelle usine de recyclage.Vos missions principales seront les suivantes :Suivre la fin du chantier de montageRéceptionner et régler les...


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    A propos de l'entreprise : Lynx RH, cabinet de recrutement, vous propose un partenariat pour vos besoins en CDI.Voici les missions que nous vous proposons :- Effectuer des opérations de dépannage et de remise en état des machines de production,- Rédiger et optimiser les gammes de maintenance,- Participer à la fiabilisation des équipements,- Assurer la...


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    il y a 3 semaines


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  • Assistant ingénieur

    il y a 4 semaines


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    il y a 4 semaines


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