Postdoctorant (H/F) Réponses moléculaires et cellulaires des diatomées arctiques lors de la formation de la banquise

il y a 3 semaines

Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

Informations générales

Titre de l'offre : Postdoctorant (H/F) Caractérisation de la réponse structurale et fonctionnelle de diatomées arctiques

Référence : UMR5168-ERIMAR-006

Nombre de postes : 1

Lieu de travail : Grenoble

Date de publication : jeudi 3 octobre 2024

Type de contrat : CDD Scientifique

Durée du contrat : 30 mois

Date d'embauche prévue : 1 février 2025

Quotité de travail : Temps complet

Rémunération : à partir de 2 991,58€

Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)

Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Section(s) CN : Biologie intégrative des organismes photosynthétiques et des microorganismes associés

Missions

Le postdoctorat proposé, sur une durée de 30 mois (prolongation possible), visera à caractériser la réponse structurale et fonctionnelle de diatomées arctiques à la formation de la banquise. Les études seront menées dans le cadre du projet HFSP TrappedInIce, impliquant des interactions avec les trois autres partenaires du projet (laboratoires de Marcel Babin, Canada, François Fripiat, Belgique, et Manu Prakash, USA). La stratégie d'étude sera intégrative combinant des analyses en imagerie cellulaire, génomique, transcriptomique, lipidomique. Le projet articulera des analyses de populations en culture et des analyses de cellules isolées (single-cell). Le post-doc (H/F) réalisera les expérimentations, analysera les données, et aura une part significative dans la rédaction des articles.

Activités

Le postdoctorat se déroulera au laboratoire LPCV, Grenoble, et débutera par la production des séquences génomiques des quatre lignées de diatomées sélectionnées. Cette première phase reposera sur l'expérience éprouvée du LPCV et combinera culture des lignées, extraction d'ADN en vue du séquençage, assemblage et annotation par un prestataire externe, et collecte et analyse des données obtenues. Ces génomes serviront de références pour des études transcriptomiques des diatomées en cultures dans des conditions mimant la formation de la banquise, menées par le laboratoire de Marcel Babin, Canada. Les cultures menées dans ce laboratoire permettront d'extraire les ARN pour profilage transcriptomique et lipidomique au LPCV. Les profils d'expressions seront analysés et interprétés par le post-doc (H/F). Des analyses en imagerie seront menées en parallèle, s'appuyant sur l'expertise du LPCV en microscopie électronique 3D. Les profilages lipidomiques seront réalisés en collaboration avec la plateforme LIPANG. Une seconde phase visera à développer des méthodes pour la caractérisation moléculaire et fonctionnelle de processus identifiés dans la première phase, au niveau de la cellule unique (single-cell). Cette partie plus exploratoire impliquera une collaboration avec le laboratoire de Manu Prakash, expert de la manipulation de cellules isolées. L'ensemble permettra de caractériser certaines réponses précoces lors de la formation de la banquise en zone arctique.

Compétences

La personne recrutée disposera d'une Thèse de Biologie ayant permis de suivre une stratégie intégrative et multiéchelle (une question intégrant plusieurs niveaux, par exemple moléculaire, métabolique, génomique, cellulaire, . Une connaissance de la biologie/physiologie du phytoplancton et des microalgues sera appréciée. Deux prérequis sont importants. D'une part, la personne candidate devra avoir une expérience (autonomie) sur l'étude de microorganismes en culture stérile, idéalement de microalgues. D'autre part, elle devra avoir de bonnes bases en bioinformatique, pour l'analyse de génomes et de transcriptomes (par ex. environnement Galaxy). Les analyses de lipidomique ou d'imagerie 3D se feront en collaboration avec les membres de l'équipe LIPID au LPCV. Toute expérience passée de type single-cell sera un atout pour la seconde partie plus exploratoire du postdoctorat. La personne recrutée devra aussi avoir la capacité de travailler en équipe et dans un contexte collaboratif international.

Contexte de travail

Le postdoctorat se déroulera au Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, une unité mixte CNRS/CEA/INRAE/Univ. Grenoble Alpes, sur le polygone scientifique de Grenoble. La mission sera menée au sein de l'équipe LIPID, dans un environnement comprenant chambres de cultures de microalgues en conditions contrôlées, équipements pour la microbiologie/biologie moléculaire/biochimie, l'accès aux plateformes d'imagerie et d'analyses lipidomiques. Des missions dans les laboratoires partenaires seront considérées en fonction des avancées du projet.

Contraintes et risques

Le projet devra se dérouler dans le cadre du projet collaboratif HFSP TrappedInIce, fournissant un environnement scientifique international pluridisciplinaire stimulant, mais nécessitant une coordination des travaux menés par les différents partenaires sur les 4 lignées étudiées. Les risques sont maitrisés par le choix de ces quatre lignées, dans la mesure où les travaux seront priorisés en fonction des difficultés techniques éventuelles rencontrées sur certaines lignées. La première phase fait appel à des techniques et des méthodes maitrisées, et pourra être valorisée. La seconde phase comprend des aspects plus exploratoires, qui seront pris en compte lors de la sélection des cibles moléculaires (gènes différentiellement exprimés) retenus.

Informations complémentaires

Le postdoctorat proposé sur une durée de 30 mois, visera à caractériser la réponse structurale et fonctionnelle de diatomées arctiques à la formation de la banquise, aux niveaux moléculaires et cellulaires. Les études seront menées dans le cadre du projet HFSP TrappedInIce, impliquant des interactions avec les trois autres partenaires du projet (laboratoires de Marcel Babin, Canada, François Fripiat, Belgique, et Manu Prakash, USA). La stratégie d'étude sera intégrative combinant des analyses en imagerie cellulaire, génomique, transcriptomique, lipidomique. Le projet articulera des analyses de populations en culture et des analyses de cellules isolées (single-cell). Le post-doc (H/F) réalisera les expérimentations, analysera les données, et aura une part significative dans la rédaction des articles.

  • Post-doc (H/F) réponses moléculaires et cellulaires des diatomées arctiques lors de la formation de la banquise

    il y a 4 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Post-doc (H/F) réponses moléculaires et cellulaires des diatomées arctiques lors de la formation de la banquiseRéférence : UMR5168-ERIMAR-006Nombre de postes : 1Lieu de travail : GRENOBLEDate de publication : jeudi 3 octobre 2024Type de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 30 moisDate d'embauche...

  • Chercheur postdoctoral en biologie des diatomées arctiques

    il y a 3 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Chercheur postdoctoral en biologie des diatomées arctiquesRéférence : UMR5168-ERIMAR-006Nombre de postes : 1Lieu de travail : GRENOBLEDate de publication : jeudi 3 octobre 2024Type de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 30 moisDate d'embauche prévue : 1 février 2025Quotité de travail : Temps...

  • Postdoctorant en biologie cellulaire

    il y a 4 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    Description de l'offreLe laboratoire Matériaux pour les Capteurs et la Délivrance (LMCD) du DTIS est à la recherche d'un postdoctorant pour contribuer à un projet européen visant à développer des dispositifs médicaux à base de micro-aiguilles solubles pour la délivrance de formulations vaccinales dirigées contre les virus de type orthopox.Le...

  • Postdoctorant en biologie cellulaire et vaccinologie

    il y a 2 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    Offre de postdoctoratLe laboratoire Matériaux pour les Capteurs et la Délivrance (LMCD) du DTIS recherche un postdoctorant pour travailler sur le développement de dispositifs médicaux à base de micro-aiguilles solubles pour la délivrance de formulations vaccinales.Le postdoctorant travaillera en étroite collaboration avec une équipe d'experts dans...

  • Postdoctorant en biologie cellulaire

    il y a 1 semaine

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    DescriptionLe laboratoire Matériaux pour les Capteurs et la Délivrance (LMCD) du DTIS travaille sur la conception et la fabrication de dispositifs médicaux à base de micro-aiguilles.PosteLe/la postdoctorant(e) sera en charge de la conception, de la fabrication et de la caractérisation de dispositifs médicaux à base de micro-aiguilles solubles pour la...

  • Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire

    il y a 2 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Présentation de l'offreL'équipe de recherche « Lumière, Photosynthèse et Métabolisme » du laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale (LPCV) recherche un Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire pour participer au développement d'un projet multidisciplinaire visant à identifier et explorer le rôle des interactions entre...

  • Ingénieur en biologie cellulaire et moléculaire H/F

    il y a 2 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    Présentation du posteL'Institut de recherche du CEA recherche un(e) Ingénieur en biologie cellulaire et moléculaire H/F pour rejoindre son équipe de recherche.MissionsLe candidat sélectionné sera chargé de :Entretien et préparation des cultures cellulaires pour la réalisation des expériences liées au projet, y compris leur...

  • Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire

    il y a 1 semaine

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Offre de poste Nous recherchons un Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire pour rejoindre notre équipe en tant que spécialiste en techniques biologiques. Missions - Préparer et suivre des cultures de microalgues. - Développer, cribler et participer à la caractérisation phénotypique de souches mutantes de microalgues. - Préparer des...

  • Postdoctorant en biologie cellulaire

    il y a 4 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    Description de l'offreLe laboratoire Matériaux pour les Capteurs et la Délivrance (LMCD) du DTIS est à la recherche d'un postdoctorant pour rejoindre son équipe de recherche. Le candidat sélectionné sera chargé de développer des dispositifs médicaux à base de micro-aiguilles solubles pour la délivrance de formulations vaccinales dirigées contre...

  • Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire

    il y a 2 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaireContexte de travailL'équipe « Lumière, Photosynthèse et Métabolisme » est une équipe multidisciplinaire composée d'une quinzaine de personnes qui s'intéresse à la régulation du mécanisme de photosynthèse. La personne sélectionnée travaillera en étroite...

  • Ingénieur en biologie cellulaire et moléculaire H/F

    il y a 2 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    Présentation du posteL'équipe du CEA recherche un(e) Ingénieur en biologie cellulaire et moléculaire pour participer à un projet de recherche sur l'évaluation de l'exposition aux radiations. Le candidat sélectionné travaillera sur la mesure de l'expression de gènes candidats biomarqueurs dans les vésicules extra-cellulaires (EVs)...

  • Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire

    il y a 3 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Présentation de l'offreL'équipe de recherche de l'UMR 5168 du CNRS recherche un Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire pour rejoindre son équipe de recherche.MissionsLe candidat sélectionné participera au développement d'un projet multidisciplinaire visant à identifier et explorer le rôle des interactions entre le chloroplaste...

  • Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire

    il y a 3 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaireRéférence : UMR5168-GUIALL-003Nombre de postes : 1Lieu de travail : GRENOBLEType de contrat : CDD Technique/AdministratifDurée du contrat : 12 moisQuotité de travail : Temps completRémunération : Entre 2349 € et 2957 € brut mensuels selon expérience et le...

  • Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire

    il y a 2 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Ingénieur en biologie moléculaire et cellulaire Nombre de postes : 1 Lieu de travail : CNRS Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 12 mois Quotité de travail : Temps complet Rémunération : Entre 2349 € et 2957 € brut mensuels selon expérience et le barème en vigueur au CNRS...

  • Ingénieur en biologie cellulaire et moléculaire H/F

    Il y a 2 mois

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'objectif de ce projet est de développer une méthode de détection rapide de l'exposition à des radiations en utilisant les vésicules extra-cellulaires (EVs) présentes dans l'air exhalé et l'urine. Les EVs transportent des ARNm et leur contenu reflète le contenu des cellules dont elles sont issues.MissionsEntretien et...

  • Ingénieur en biologie cellulaire et moléculaire H/F

    il y a 1 mois

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'objectif de ce projet est de développer une méthode de détection rapide de l'exposition à des radiations en utilisant les vésicules extra-cellulaires (EVs) présentes dans l'air exhalé et l'urine. Les EVs transportent des ARNm et leur contenu reflète le contenu des cellules dont elles sont issues.Nos missions seront les...

  • Postdoctoral Researcher

    il y a 1 mois

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Postdoctoral Researcher (M/F) Molecular and Cellular Responses of Arctic Diatoms During Sea Ice FormationJob Description:The postdoctoral researcher will investigate the molecular and cellular responses of Arctic diatoms to sea ice formation. The project will be conducted in collaboration with three other partners (laboratories of Marcel Babin, Canada,...

  • Ingénieur en biologie cellulaire et moléculaire H/F

    il y a 3 semaines

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'objectif de ce projet est de développer une méthode de détection rapide de l'exposition aux radiations en utilisant les vésicules extra-cellulaires (EVs) présentes dans l'air exhalé et l'urine. Les EVs transportent des ARNm et leur contenu reflète le contenu des cellules dont elles sont issues.Nos missions...

  • Bioingénieur en biologie moléculaire et cellulaire

    il y a 1 semaine

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Poste de rechercheObjetDans le cadre de son unité mixte de recherche, le CNRS recherche un bioingénieur pour participer au développement d'un projet multidisciplinaire axé sur l'identification et l'exploration du rôle des interactions entre le chloroplaste et la mitochondrie dans la régulation de la photosynthèse chez les microalgues.Responsabilités...

  • Ingénieur en biologie cellulaire et moléculaire H/F

    il y a 1 semaine

    Grenoble, Auvergne-Rhône-Alpes, France CEA Temps plein

    Missions et responsabilitésL'Ingénieur en biologie cellulaire et moléculaire sera chargé de développer des biomarqueurs pour l'évaluation de l'exposition aux radiations. Il travaillera sur la mise au point de tests PCR quantitative pour analyser l'expression de gènes biomarqueurs dans les vésicules extra-cellulaires. Les missions...