Responsable de la Gestion et de l'Interopérabilité de Données d'Océanographie Biologique

il y a 4 semaines

VillefranchesurMer, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France CNRS Temps plein

Présentation du poste

Le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) recherche un Responsable de la Gestion et de l'Interopérabilité de Données d'Océanographie Biologique pour rejoindre son équipe.

Missions

Le candidat sélectionné assurera le suivi, la gestion et l'interopérabilité des données collectées dans le cadre du projet AO-EMBRC, qui sont de nature diverse (génomique, imagerie, taxinomie classique, physico-chimie, etc.).

Activités

Les principales activités du poste seront :

  • Animer des ateliers d'expression des besoins internes et rédiger la spécification des besoins en identifiant les solutions déjà existantes et en écrivant le cahier des charges de celles à développer.
  • Mettre en œuvre des systèmes d'information et de traitement existants ou en concevoir de nouveaux permettant de collecter, structurer, stocker, qualifier et envoyer les données vers des systèmes d'information internationaux.
  • Créer un système permettant de mettre en relation des données de nature différente, stockées dans des bases actuellement distinctes (génomique, imagerie, environnement).
  • Assurer une veille technologique concernant la gestion de grands volumes de données en suivant les principes et les directives institutionnelles.
  • Administrer les machines locales sur lesquelles reposent une partie des systèmes d'information et de traitement de la donnée, en relation avec le service informatique dédié.
  • Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de gestion des données biologiques.
  • Participer à la diffusion et valorisation des résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, publications et présentations orales.
  • Pour les nouvelles collectes de données, participer à la définition du plan de gestion des données le mieux adapté au problème posé.
  • Contribuer à des réseaux professionnels d'échange de compétences.

Compétences requises

Le candidat idéal possèdera les compétences suivantes :

  • Maîtrise des outils et concepts liés à la gestion, l'interopérabilité et à la diffusion ouverte de données multimodales.
  • Maîtrise de la gestion de grands volumes de données sous forme de base SQL, no-SQL ou de collections de fichiers tabulaires (csv, parquet, etc.).
  • Maîtrise des environnements Unix/Linux (administration système, shell, etc.).
  • Connaissance d'un langage de programmation et de traitement de données (Python, R, Perl, etc.).
  • Connaissance et capacité à mettre en œuvre une démarche qualité.
  • Idéalement, connaissance du stockage, traitement et analyse de données d'océanographie biologique (de génomique et/ou imagerie et/ou taxinomie et/ou physico/chimie).
  • Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues).

Contexte de travail

Le poste sera localisé au Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV), avec de fortes interactions avec les autres stations de biologie marine (Banyuls et Roscoff) ainsi qu'avec le CEA / Genoscope à Evry.

Informations complémentaires

Le CNRS est une institution publique de recherche qui se consacre à la recherche scientifique et à la formation des chercheurs. Le Centre National de Ressources Biologiques Marines (EMBRC-France) est une infrastructure de recherche nationale en biologie et écologie marines, lauréate du Programme Investissements d'Avenir (PIA) et portée par Sorbonne Université et le CNRS.

  • Responsable de la Gestion et de l'Interopérabilité de Données d'Océanographie Biologique

    il y a 4 semaines

    Villefranche-sur-Mer, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France CNRS Temps plein

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  • Responsable de la Gestion et de l'Interopérabilité de Données d'Océanographie Biologique

    il y a 4 semaines

    Villefranche-sur-Mer, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France CNRS Temps plein

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    il y a 4 semaines

    Villefranche-sur-Mer, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France CNRS Temps plein

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    il y a 2 semaines

    Villefranche-sur-Mer, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France CNRS Temps plein

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