Alternance en Oligonucléotides

Poste en alternance à pourvoir dès la rentrée 2025-2026

Localisation : Toulouse

Les oligonucléotides sont des macromolécules synthétiques permettant la régulation de la traduction protéique par divers mécanismes utilisant la machinerie cellulaire endogène. L’utilisation principale des oligonucléotides consiste à inhiber la traduction protéique, soit par dégradation de l’ARN messager ou pré-messager cible, soit par encombrement stérique et donc blocage de l’activité ribosomale ou nucléaire (inhibition de l’épissage, de la coiffe en 5’, etc.). De plus, de nombreuses structures ont été développées et étudiées depuis les années 1980, comme les Oligonucléotide Antisens (ASO), les petits ARN interférants (siRNA), les _short hairpin_ RNA (shRNA), les _single guide_ RNA (sgRNA) ou encore les aptamères. Toutes ces macromolécules utilisent la complémentarité des bases azotées pour cibler et/ou se structurer afin d’utiliser des mécanismes cellulaires endogènes pour générer une activité (inhibition, activation, régulation, affinité, guide,).

Une des principales limitations de cette technologie est sa stabilité en milieu biologique ainsi que leur internalisation cellulaire. L’ADN et l’ARN natif exogènes sont reconnus par l’organisme et catabolisés rapidement par le foie en base azotée et ribose. Pour limiter cette dégradation et augmenter la demi-vie plasmatique de ces molécules, plusieurs modifications chimiques ont été développées, comme les liens internucléotides (phosphorothioates, boranophosphate, phosphoramidate,), les modifications du ribose (2’-O-Methyle, 2’-fluoro, LNA, etc.) ou encore les modifications des bases azotées en elle-même.

L'objectif principale de cette alternance est de développer des monomères innovants puis leur utilisation lors de la synthèse d'oligonucléotides afin de proposer de nouvelles macromolécules à fort intérêt thérapeutique. Pour ce faire, l'étudiant aura à sa disposition : tous les produits chimiques nécessaires, l'aide et les connaissances en chimie des oligonucléotides et en chimie organique par des chimistes expérimentés, tout le matériel nécessaire, etc.

Profil idéal:

- être en 1ère ou 2ème année de Master ou en 1ère ou 2ème année d'école d'ingénieur
- posséder de solides compétences en chimie organique
- être familiarisé avec les techniques classiques de caractérisation (RMN)
- avoir un fort intérêt pour la recherche, l'innovation
- faire preuve d'autonomie et d'initiatives