Data Scientist

**Construisons ENSEMBLE votre carrière **

Le Centre Léon Bérard (CLB) est LE pôle de référence régional en cancérologie.

Membre de la Fédération UNICANCER, nous sommes à la fois un hôpital et un centre de recherche.

A ce titre, nous assurons 3 missions essentielles:

- Les soins : nos équipes soignantes prennent en charge plus de 40 000 patients par an, avec des soins personnalisés et innovants.
- La recherche : nos 600 chercheurs travaillent quotidiennement sur notre site, couvrant les domaines de la recherche fondamentale, translationnelle et clinique.
- L enseignement : chaque année, nous assurons la diffusion des savoirs et formons près de 700 personnes.

Dans le cadre du développement de l'activité du **CRCL (Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon)** : nous créons un poste de **Data Scientist (F/H) - CDD de 18 mois évolutif - temps plein - statut cadre au forfait jours.**
- **Programmes de médecine personnalisée du CLB**:_

Le CLB est à la tête de grands programmes de médecine personnalisée tels que Profiler, Planet et Auragen (accès national au séquençage) depuis de nombreuses années, ce qui permet d'accéder à de nombreuses données précieuses. Nous développons également plusieurs solutions de traitement du langage naturel sur le texte et d'intelligence artificielle pour les données moléculaires ou d'imagerie. Nous lançons plusieurs projets très ambitieux pour faire passer la médecine personnalisée anti-cancer au niveau supérieur en améliorant:

- L'accès régional à la médecine personnalisée, coordonné par des organisations internationales,
- L'appariement automatique des traitements ou des essais cliniques aux patients,
- L'éducation des patients dans le monde entier,
- L'interface intuitive des services.
- **Données utilisées dans la RCP Moléculaire CLB **:_

Les RCP Moléculaires ont pour mission de proposer de nouveaux traitements et des essais cliniques aux patients atteints de divers types de cancer qui font l'objet d'une analyse moléculaire. C'est le cœur du développement de l'oncologie de précision, à la pointe des nouveaux traitements, des nouvelles techniques moléculaires, des nouveaux types d'analyse de données et de la description personnalisée de la biologie du cancer en vue d'une recommandation thérapeutique. Le CLB encourage le développement constant de sa RCP Moléculaire pour bénéficier de la recherche sur l'analyse moléculaire et la science des données afin d'améliorer les soins aux patients, avec un niveau élevé de contrôle et de qualité.
- **CGI-Cliniques **:_

L'un des outils prioritaires est CGI-Clinics. Il s'agit d'un projet de 5 ans, qui a débuté en novembre 2022, financé par le Horizon Europe Health. CGI-Clinics fournit un outil d'interprétation du génome du cancer et d'orientation thérapeutique basé sur les données. L'interprétation est un goulot d'étranglement pour le déploiement et l'accessibilité à grande échelle du séquençage de nouvelle génération (NGS) dans la gestion du cancer. Le projet s'attaque aux trois principaux obstacles à l'interprétation des mutations cancéreuses : elle n'est pas systématique, elle traite une majorité de variantes dont la signification est inconnue et elle ne parvient pas à responsabiliser les patients. Le projet est divisé en trois phases (configuration, validation et mise en œuvre).

**LE POSTE**:
Placé sous la responsabilité de médecins chercheurs et du responsable de l’équipe «Analyse intégrée de la dynamique du cancer» du CRCL, vous travaillerez avec les oncologues, les biologistes moléculaires, le service informatique, la plateforme bio-informatique, les ingénieurs NLP, les équipes « Pôle Data » et « Data Factory », et vous serez en contact étroit avec des collaborateurs internationaux et multidisciplinaires.
- Vos missions principales :_
- Soutenir l'utilisation de l'outil _CGI-Clinics _au CLB et en collaboration avec le consortium international, et effectuer l'analyse des données des patients rétrospectives et en temps réel.
- Développer, mettre en œuvre et maintenir des outils (tels que l'interprétation des variants génomiques, l'appariement aux essais cliniques, les analyses de signature d'expression) pour divers types de données (ADN, RNAseq, texte, imagerie telle que multiIHC et multiIF), utilisées dans la RCP Moléculaire.
- Jouer un rôle clé dans la réussite globale du développement de la RCP Moléculaire, notamment en coordonnant l'implication de multiples parties prenantes, en réalisant le suivi des projets et en rédigeant les rapports.

**VOTRE PROFIL**:
Doctorat en bio-informatique,

OU Master ou Ecole d’ingénieur

OU diplôme de troisième cycle en sciences des données ou statistiques appliquées.

**+** Excellent niveau d’anglais oral et écrit

**+ **Une première expérience en tant que bio-informaticien et/ou développeur full stack, en big data, science des données, génie