Caractérisation de L'activité Tat Du Sous-type A6 Du Vih-1

**Caractérisation de l'activité Tat du sous-type A6 du VIH-1 // Characterization of Tat activity of HIV-1 subtype A6**:

- Réf **ABG-130842**
**ADUM-64274**
- Sujet de Thèse
- 11/04/2025
- Contrat doctoral
- Université de Montpellier
- Lieu de travail- Montpellier CEDEX 5 - France
- Intitulé du sujet- Caractérisation de l'activité Tat du sous-type A6 du VIH-1 // Characterization of Tat activity of HIV-1 subtype A6
- Mots clés- VIH, Tat, TAR, LTR, transcription, latence
HIV, Tat, TAR, LTR, transcription, latency

**Description du sujet**:

- La protéine du VIH-1, transactivateur de la transcription (Tat), contrôle l'expression du génome viral en recrutant des coactivateurs essentiels grâce à son interaction de haute affinité avec l'ARN TAR. Le mécanisme de transactivation par Tat a fait l'objet de recherches approfondies ces dernières décennies et sert de paradigme pour l'étude de l'expression génétique. Tat est non seulement essentielle au contrôle de l'expression du VIH-1 pendant la phase aiguë de la maladie, mais aussi un médiateur clé de la réactivation virale après la latence, permettant le passage de la répression transcriptionnelle à la transcription virale. Ainsi, le potentiel de transactivation de Tat est un facteur majeur de la progression de la maladie. Cependant, la quasi-totalité des études mécanistiques menées jusqu'à présent ont porté sur Tat du sous-type B, principalement présent en Amérique et en Europe occidentale. La prévalence croissante du sous-type A, en particulier A6, auparavant limité à la Russie et aux pays de l'ex-Union soviétique, en Europe, est préoccupante. L'augmentation de la migration ukrainienne vers les pays européens voisins, due à la situation politique de ces dernières années, a radicalement modifié l'épidémiologie des nouvelles infections à VIH dans plusieurs pays. Par exemple, en Pologne, 30 % des nouveaux cas de VIH positifs appartiennent au sous-type A6, alors que ce sous-type n'était présent qu'à un taux très faible auparavant. Une situation similaire est observée en Allemagne, où environ 12 % des nouveaux cas sont causés par le sous-type A6. On peut donc s'attendre à ce que le sous-type A6 devienne plus dominant dans les autres pays européens dans les années à venir. Le VIH-A6 présente de nombreuses modifications de séquence par rapport au VIH-B qui justifient des investigations. Nous nous concentrerons ici sur le potentiel de transactivation du VIH-A6. Nous étudierons l'activité de la protéine Tat et la séquence d'ARN TAR du sous-type A6 du VIH. L'analyse de la séquence a révélé que Tat-A6 présente un certain nombre de substitutions d'acides aminés par rapport à Tat-B, présentes dans toute la protéine. De même, plusieurs modifications de bases sont observées dans la séquence d'ARN TAR, modifiant sa structure dans une certaine mesure. Ces modifications de Tat et de TAR pourraient potentiellement impacter le potentiel de transactivation de Tat et affecter l'expression virale.

The HIV-1 protein, Transactivator of Transcription (Tat), controls the expression of the viral genome by recruiting essential coactivators through its high affinity interaction with TAR RNA. The mechanism of transactivation by Tat has been intensively investigated over the last decades, and serves as a paradigm for the study of gene expression. Tat is not only critical for controlling HIV-1 expression during the acute phase of the disease, it is a key mediator of reactivation from viral latency, allowing a shift from transcriptional repression towards viral transcription. Thus, the transactivation potential of Tat is a major factor in HIV disease progression. However, almost all mechanistic studies so far have investigated Tat from Subtype B, which is found predominantly in the Americas and Western Europe. A cause for concern is the increasing prevalence of subtype A, particularly A6, that was previously restricted to Russia and former Soviet countries, in Europe. The increase in Ukranian migration to neighboring European countries due to the political situation over the last few years has dramatically changed the epidemiology of new HIV infections in several countries. For example, in Poland, 30% of new HIV-positive cases belong to subtype A6 whereas subtype A6 was only present at a very low rate previously. A similar situation is found in Germany where approximately 12% of new cases are caused by HIV subtype A6. Thus, it could be expected that subtype A6 will become more dominant throughout other European countries in coming years. HIV-A6 shows many sequences changes compared to HIV-B that warrant investigation. Here, we will focus on the transactivation potential of HIV-A6. We will investigate the activity of Tat protein and TAR RNA sequence of HIV subtype A6. Sequence analysis revealed that Tat-A6 shows a number of amino acid substitutions compared to Tat-B that can be found throughout the protein. Similarly, several base changes can be found in the sequence of TAR RNA that modify its stru