Developer/data Analyst for Neuroimaging Databases

**Type de contrat**: CDD

**Contrat renouvelable**: Oui

**Niveau de diplôme exigé**: Bac + 5 ou équivalent

**Fonction**: Ingénieur scientifique contractuel

**Niveau d'expérience souhaité**: Jusqu'à 3 ans

**A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**:
The Inria Centre at Rennes University is one of Inria's eight centres and has more than thirty research teams. The Inria Centre is a major and recognized player in the field of digital sciences. It is at the heart of a rich R&D and innovation ecosystem: highly innovative PMEs, large industrial groups, competitiveness clusters, research and higher education players, laboratories of excellence, technological research institute, etc.

**Contexte et atouts du poste**:
Multiple Sclerosis (MS) is a common and potentially debilitating disease affecting around 3 millions persons in the world. Currently, Magnetic Resonance Imaging (MRI) plays a central role in this context and in particular allows the identification of MS lesions in the central nervous system.

The identification of these lesions on a given MRI image, and of new lesions between pairs of longitudinal MRI images, is a complex and mentally demanding task that often leads to an underestimation of disease activity, even for most experienced radiologists. There is thus a need for dedicated systems that can provide clinicians an aid for accurate and robust identification of MS lesions in the brain as in the spinal cord.

**Mission confiée**:

- ensure the development of the MS imaging database. This includes the maintaining and development of tools to:

- identify and organize MR images, experts annotations and associated metadata,
- populate the database,
- control data integrity,
- ease data segmentations/annotations,
- automate numerical and graphical summaries of data, extract relevant subsets of data from a variety of conditions,- be involved in the valorization of the database. In particular, the team organized the past two international MS segmentation challenges (MSSEG-1 and MSSEG-2) and will organise in 2025 an international challenge devoted to the segmentation of spinal cord MS lesions (MS-Multi-Spine). Moreover, several other data sources could be included in this aspect of the work.

**Principales activités**:
From a technical perspective, the activities will include:

- the maintaining of existing R/python code as well a the developpement, documentation and maintaining of new R/python scripts to:

- identify and organize MR images, experts annotations and associated metadata,
- populate the database
- control data integrity,
- ease data segmentations/annotations,
- automate numerical and graphical summaries of data,
- extract relevant subsets of data from a variety of conditions.
- the collaboration with different members of the associated projects to design and extract dataset relevant to their needs.

**Compétences**:
**Avantages**:

- Prise en charge à 75 % des frais de transport en commun sur le trajet domicile-travail ou FMD (forfait mobilité durable)
- Restauration subventionnée
- Prise en charge partielle des frais de mutuelle
- Possibilité de télétravail (à hauteur de 90 jours annuels) et d'aménagement du temps de travail

**Rémunération**:
Rémunération brute mensuelle de 2 695 € en fonction du diplôme et de l'expérience

**Informations générales**:

- **Thème/Domaine**: Neurosciences et médecine numériques
Systèmes d'information (BAP E)
- **Ville**: Rennes
- **Centre Inria**: Centre Inria de l'Université de Rennes
- **Date de prise de fonction souhaitée**: 2025-03-01
- **Durée de contrat**: 12 mois
- **Date limite pour postuler**: 2025-01-18

**Consignes pour postuler**:
Merci de déposer en ligne CV, lettre de motivation et éventuelles recommandations

**Sécurité défense**:
Ce poste est susceptible d’être affecté dans une zone à régime restrictif (ZRR), telle que définie dans le décret n°2011-1425 relatif à la protection du potentiel scientifique et technique de la nation (PPST). L’autorisation d’accès à une zone est délivrée par le chef d’établissement, après avis ministériel favorable, tel que défini dans l’arrêté du 03 juillet 2012, relatif à la PPST. Un avis ministériel défavorable pour un poste affecté dans une ZRR aurait pour conséquence l’annulation du recrutement.

**Politique de recrutement**:
Dans le cadre de sa politique diversité, tous les postes Inria sont accessibles aux personnes en situation de handicap.

**Contacts**:

- **Équipe Inria**: EMPENN
- **Recruteur**:
**L'essentiel pour réussir**:
Organization and autonomy as well as an ambition to contribute to the improvement of clinical follow-up of patients are fundamental.

**A propos d'Inria**:
Inria est l’institut national de recherche dédié aux sciences et technologies du numérique. Il emploie 2600 personnes. Ses 215 équipes-projets agiles, en général communes avec des partenaires académiques, impliquent plus de 3900 scientifiques pour relever les défis du numérique, souvent à l’interface d’autres discipl