Post-doctorat Ecologie Numérique

**Description de l'offre**:
Le Laboratoire Environnement Ressources de Normandie (LER/N) appartient à l’Unité Littoral du Département Océanographie et Dynamique des Ecosystèmes (ODE) de l’Ifremer. Il est implanté sur les sites de Port en Bessin. Son activité se décline suivant trois axes : (i) la surveillance et l'observation de la qualité des eaux et des habitats ; (ii) l’expertise auprès des collectivités territoriales, des organismes publics et des structures professionnelles et l'émission d'avis auprès des ministères et services déconcentrés ; (iii) la recherche en réponse directe à des enjeux sociaux et économiques, à une échelle régionale, nationale et internationale. L’activité récente du laboratoire se décline autour de l’observation côtière en lien avec la qualité de l’eau et le fonctionnement des écosystèmes littoraux sous pressions anthropiques.

Au sein du Département Océanographie et Dynamique des Ecosystèmes et de l'unité Littoral, le poste situé à Port en Bessin, est placé sous la responsabilité hiérarchique du Responsable du Laboratoire Environnement et Ressources de Normandie (LER/N). L’Unité Littoral est très fortement impliquée dans le développement et la mise en œuvre de systèmes d’observations en milieu côtier (capteurs innovants, déploiements ponctuels, réseaux pérennes d’observation haute et basse fréquence) permettant l’acquisition de données caractéristiques de différents composants de l’écosystème (physique, biologique, biogéochimique, hydrosédimentaire). La richesse de ces données offre l’opportunité unique d’adopter des approches holistiques et multi-échelles permettant d’appréhender les processus à l’œuvre dans toute leur complexité, afin de répondre aux objectifs de l’Unité Littoral et du département ODE.

**Missions principales**
Vous aurez pour première mission de diffuser des données d’observations de la variabilité temporelle des traits de vie des moules, selon les standards de l’approche FAIR visant la reproductibilité et le partage des matériels de recherche. Ce jeu de données devra en premier lieu être constitué des séries annuelles acquises sur les 5 à 9 stations du réseau Mytilobs, initié en 2013, cofinancé par Ifremer et la direction générale des affaires maritimes, de la pêche et de l'aquaculture et qui arrive à l’issue de sa 9ème campagne annuelle d’observation consécutive. Il pourra également agréger des données d’autres sources telles que les réseaux associés au Mytilobs et opérés par des partenaires de l’interprofession (Bureaux d’étude, Comité Régionaux Conchylicoles, Centres Techniques Aquacoles) qui permettraient d’ajouter jusqu’à 21 points supplémentaires répartis sur les côtes de la Mer-du-Nord, de la Manche est, de la Manche ouest, et de l’Atlantique. La diffusion des jeux de données devra être matérialisée par la publication d’un datapaper et la production d’une plateforme d’interrogation des données en ligne.

Le jeu de données constitué permettra ensuite d’étudier les drivers environnementaux de la variation des traits de vie chez les moules. Les descripteurs de l’environnement seront issus du réseaux Mytilobs, des différents réseaux d’observation de l’environnement côtiers de l’IR-ILICO, et de divers réseaux locaux dédiés à l’observation côtière. Vous devrez développer des modèles statistiques permettant d’étudier les relations entre la variabilité des paramètres de l’environnement et celle des traits de vie de la moule à 2 échelles spatiales contrastées
100 km), et à diverses échelles temporelles allant du mois à la décennie. Ces travaux pourront s’appuyer sur les développements statistiques (apprentissage automatique par génération de forêts d’arbres décisionnels) issus d’un précédent projet, et permettant de tester des associations non-linéaires entre variables biologiques et facteurs de l’environnement, tout en considérant différentes échelles de temps, ou d’espace. Ce travail devra également faire l’objet d’une publication dans une revue à comité de lecture.

**Activités principales**
En collaboration étroite avec le coordinateur du réseau Mytilobs, vous aurez pour missions principales:

- D’assurer l’interface avec les partenaires de l’interprofession (Bureaux d’étude, Comité Régionaux Conchylicoles, Centres Techniques Aquacoles)
- De rédiger et publier un datapaper
- De participer activement au développement d’une plateforme d’interrogation des données en ligne
- D’étudier les drivers environnementaux de la variation des traits de vie en développant des méthodes d’analyses statistiques
- De participer activement à la rédaction et à la publication des résultats de cette étude.

**Champs relationnel**
- En interne : personnels du LER/N, de l’Unité Littoral et des autres unités du dé